26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_0822 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_0822  hypothetical protein  100 
 
 		 118 aa  246  6e-65  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00000000953829  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1991  protein of unknown function DUF718  48.65 
 
 		 110 aa  118  3e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.893292 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0643  hypothetical protein  47.79 
 
 		 119 aa  117  3.9999999999999996e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.198224  normal  0.98044 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6338  hypothetical protein  49.09 
 
 		 109 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00357939  normal  0.513822 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2046  hypothetical protein  46.85 
 
 		 110 aa  114  3.9999999999999997e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5323  protein of unknown function DUF718  48.18 
 
 		 109 aa  110  7.000000000000001e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5480  protein of unknown function DUF718  46.85 
 
 		 113 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.299938  normal  0.858981 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4020  protein of unknown function DUF718  47.32 
 
 		 112 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5741  protein of unknown function DUF718  43.64 
 
 		 109 aa  103  8e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0374824 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0311  protein of unknown function DUF718  46.79 
 
 		 108 aa  101  3e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.881314 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02757  hypothetical protein  46.3 
 
 		 113 aa  101  4e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1246  hypothetical protein  43.24 
 
 		 113 aa  98.2  3e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.944983  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1601  hypothetical protein  47.75 
 
 		 112 aa  97.1  8e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1219  hypothetical protein  44.35 
 
 		 113 aa  94.7  4e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0645  hypothetical protein  46.85 
 
 		 112 aa  94.4  5e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1781  hypothetical protein  46.85 
 
 		 112 aa  91.7  3e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3138  hypothetical protein  41.82 
 
 		 113 aa  89  2e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.296679  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1543  hypothetical protein  40.91 
 
 		 118 aa  88.6  3e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.823935 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1086  hypothetical protein  43.4 
 
 		 106 aa  81.6  0.000000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1163  hypothetical protein  43.4 
 
 		 106 aa  81.6  0.000000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0819  hypothetical protein  43.4 
 
 		 106 aa  81.6  0.000000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_40891  predicted protein  37 
 
 		 126 aa  72  0.000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2427  hypothetical protein  40.22 
 
 		 115 aa  62  0.000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4114  hypothetical protein  23.36 
 
 		 832 aa  43.1  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0478518  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4951  protein of unknown function DUF718  29.59 
 
 		 117 aa  42  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.666273  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1067  hypothetical protein  30.93 
 
 		 367 aa  40  0.01  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0263007  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>