25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_1219 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008390  Bamb_1219  hypothetical protein  100 
 
 		 113 aa  234  2e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1246  hypothetical protein  97.35 
 
 		 113 aa  228  2e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.944983  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5480  protein of unknown function DUF718  71.43 
 
 		 113 aa  176  7e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.299938  normal  0.858981 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6338  hypothetical protein  70.64 
 
 		 109 aa  174  4e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00357939  normal  0.513822 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5323  protein of unknown function DUF718  65.14 
 
 		 109 aa  154  4e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0645  hypothetical protein  67.86 
 
 		 112 aa  147  4e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1601  hypothetical protein  66.96 
 
 		 112 aa  145  1.0000000000000001e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1781  hypothetical protein  66.96 
 
 		 112 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0819  hypothetical protein  65.09 
 
 		 106 aa  133  8e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1163  hypothetical protein  65.09 
 
 		 106 aa  133  8e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1086  hypothetical protein  65.09 
 
 		 106 aa  133  8e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3138  hypothetical protein  57.14 
 
 		 113 aa  129  2.0000000000000002e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.296679  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0643  hypothetical protein  49.55 
 
 		 119 aa  122  1e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.198224  normal  0.98044 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2046  hypothetical protein  44.04 
 
 		 110 aa  111  4.0000000000000004e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0311  protein of unknown function DUF718  46.79 
 
 		 108 aa  108  2.0000000000000002e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.881314 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4020  protein of unknown function DUF718  43.64 
 
 		 112 aa  103  8e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1991  protein of unknown function DUF718  42.2 
 
 		 110 aa  102  1e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.893292 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5741  protein of unknown function DUF718  40.74 
 
 		 109 aa  100  7e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0374824 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0822  hypothetical protein  44.35 
 
 		 118 aa  94.7  4e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00000000953829  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1543  hypothetical protein  42.11 
 
 		 118 aa  83.2  0.000000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.823935 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02757  hypothetical protein  41.9 
 
 		 113 aa  75.9  0.0000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2427  hypothetical protein  38.71 
 
 		 115 aa  57.8  0.00000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_40891  predicted protein  34.31 
 
 		 126 aa  56.2  0.0000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01009  DUF718 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_1G12860)  36.62 
 
 		 114 aa  42.7  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0197794  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3394  hypothetical protein  28.07 
 
 		 109 aa  40.8  0.007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.384678 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>