23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_2427 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_2427  hypothetical protein  100 
 
 		 115 aa  233  6e-61  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1543  hypothetical protein  41.59 
 
 		 118 aa  79.3  0.00000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.823935 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02757  hypothetical protein  42.86 
 
 		 113 aa  74.7  0.0000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5480  protein of unknown function DUF718  41.44 
 
 		 113 aa  73.9  0.0000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.299938  normal  0.858981 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5741  protein of unknown function DUF718  37.61 
 
 		 109 aa  72.8  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0374824 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0311  protein of unknown function DUF718  42.73 
 
 		 108 aa  72.4  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.881314 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4020  protein of unknown function DUF718  41.28 
 
 		 112 aa  72  0.000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6338  hypothetical protein  39.64 
 
 		 109 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00357939  normal  0.513822 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1991  protein of unknown function DUF718  42.2 
 
 		 110 aa  69.3  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.893292 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0822  hypothetical protein  40.37 
 
 		 118 aa  69.3  0.00000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00000000953829  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5323  protein of unknown function DUF718  39.64 
 
 		 109 aa  67.8  0.00000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1219  hypothetical protein  39.64 
 
 		 113 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2046  hypothetical protein  39.42 
 
 		 110 aa  65.1  0.0000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1246  hypothetical protein  39.64 
 
 		 113 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.944983  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1601  hypothetical protein  39.29 
 
 		 112 aa  62.8  0.000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0645  hypothetical protein  39.29 
 
 		 112 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1781  hypothetical protein  39.29 
 
 		 112 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1086  hypothetical protein  38.68 
 
 		 106 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1163  hypothetical protein  38.68 
 
 		 106 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0819  hypothetical protein  38.68 
 
 		 106 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3138  hypothetical protein  35.96 
 
 		 113 aa  55.8  0.0000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.296679  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0643  hypothetical protein  35.58 
 
 		 119 aa  46.2  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.198224  normal  0.98044 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_40891  predicted protein  30.28 
 
 		 126 aa  44.7  0.0004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>