65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_4951 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_4951  protein of unknown function DUF718  100 
 
 		 117 aa  243  6e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.666273  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3394  hypothetical protein  48.6 
 
 		 109 aa  115  1.9999999999999998e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.384678 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2270  hypothetical protein  43.93 
 
 		 109 aa  108  3e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.767622  normal  0.824523 
 
 
-
 
NC_004310  BR0240  hypothetical protein  41.51 
 
 		 114 aa  94.7  4e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1446  hypothetical protein  40.57 
 
 		 105 aa  91.3  4e-18  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0538  hypothetical protein  40.57 
 
 		 105 aa  89.7  1e-17  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.161074  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3484  protein of unknown function DUF718  37.74 
 
 		 107 aa  89.7  1e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0314  hypothetical protein  37.38 
 
 		 110 aa  87.4  6e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH01960  conserved hypothetical protein  39.29 
 
 		 131 aa  86.3  1e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4974  hypothetical protein  39.25 
 
 		 109 aa  85.5  2e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.651142  normal  0.112627 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1067  hypothetical protein  32.38 
 
 		 367 aa  73.6  0.0000000000008  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0263007  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44979  predicted protein  31.88 
 
 		 210 aa  73.2  0.000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0233  hypothetical protein  35.58 
 
 		 93 aa  73.2  0.000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.578121  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01009  DUF718 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_1G12860)  36.47 
 
 		 114 aa  69.3  0.00000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0197794  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3612  L-rhamnose 1-epimerase  33.94 
 
 		 104 aa  58.5  0.00000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2729  hypothetical protein  30.84 
 
 		 107 aa  56.2  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.727532  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0564  protein of unknown function DUF718  31.73 
 
 		 101 aa  53.1  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2046  hypothetical protein  28.12 
 
 		 110 aa  51.6  0.000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3456  hypothetical protein  28.97 
 
 		 107 aa  50.8  0.000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.022732 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0965  L-rhamnose 1-epimerase  30.43 
 
 		 104 aa  50.8  0.000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3786  L-rhamnose 1-epimerase  27.78 
 
 		 104 aa  50.1  0.00001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1358  L-rhamnose 1-epimerase  34.26 
 
 		 104 aa  49.3  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2430  hypothetical protein  34.02 
 
 		 112 aa  49.3  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.878455  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3314  protein of unknown function DUF718  28.97 
 
 		 107 aa  48.9  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00130115 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4919  L-rhamnose 1-epimerase  28.3 
 
 		 103 aa  48.5  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0331686  normal  0.318925 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2457  hypothetical protein  29.25 
 
 		 115 aa  47.4  0.00006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4083  L-rhamnose 1-epimerase  27.78 
 
 		 104 aa  47.4  0.00006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4129  L-rhamnose 1-epimerase  27.78 
 
 		 104 aa  47.4  0.00006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4116  L-rhamnose 1-epimerase  27.78 
 
 		 104 aa  47.4  0.00006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4432  L-rhamnose 1-epimerase  27.78 
 
 		 104 aa  47.4  0.00007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4292  L-rhamnose 1-epimerase  27.78 
 
 		 104 aa  47.4  0.00007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.350342 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5353  L-rhamnose 1-epimerase  27.78 
 
 		 104 aa  47.4  0.00008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0643  hypothetical protein  31.48 
 
 		 119 aa  47  0.00009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.198224  normal  0.98044 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3488  L-rhamnose 1-epimerase  28.87 
 
 		 104 aa  45.4  0.0003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4381  L-rhamnose 1-epimerase  27.84 
 
 		 99 aa  44.7  0.0004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03787  L-rhamnose mutarotase  26.85 
 
 		 104 aa  44.7  0.0005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03736  hypothetical protein  26.85 
 
 		 104 aa  44.7  0.0005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3759  L-rhamnose 1-epimerase  29.63 
 
 		 104 aa  44.7  0.0005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0748  hypothetical protein  29.63 
 
 		 104 aa  44.7  0.0005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0511039 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3849  L-rhamnose 1-epimerase  29.63 
 
 		 104 aa  44.7  0.0005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0417  L-rhamnose 1-epimerase  28.87 
 
 		 104 aa  44.3  0.0006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.373765  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1210  L-rhamnose 1-epimerase  31.63 
 
 		 104 aa  43.9  0.0007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1807  L-rhamnose 1-epimerase  31.52 
 
 		 104 aa  43.9  0.0007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0496  L-rhamnose 1-epimerase  28.7 
 
 		 104 aa  43.1  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3401  L-rhamnose 1-epimerase  31.18 
 
 		 106 aa  43.1  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.207239  normal  0.325252 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09140  L-rhamnose 1-epimerase  39.13 
 
 		 103 aa  42.7  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.435762  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3612  protein of unknown function DUF718  30.28 
 
 		 115 aa  42.7  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.175398  normal  0.641333 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4326  L-rhamnose 1-epimerase  26.85 
 
 		 104 aa  42.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.272019 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3493  L-rhamnose 1-epimerase  28.44 
 
 		 104 aa  42.4  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.118887  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1991  protein of unknown function DUF718  27.84 
 
 		 110 aa  42.7  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.893292 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0801  protein of unknown function DUF718  30.84 
 
 		 108 aa  42  0.003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.771693 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4075  L-rhamnose 1-epimerase  27.78 
 
 		 104 aa  41.6  0.003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.649015  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0822  hypothetical protein  29.59 
 
 		 118 aa  42  0.003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00000000953829  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2123  hypothetical protein  30 
 
 		 106 aa  42  0.003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0247927  normal  0.886826 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4286  L-rhamnose 1-epimerase  26.85 
 
 		 104 aa  41.2  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4257  L-rhamnose 1-epimerase  26.85 
 
 		 104 aa  41.2  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4438  L-rhamnose 1-epimerase  26.85 
 
 		 104 aa  41.2  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6401  L-rhamnose 1-epimerase  32.26 
 
 		 104 aa  40.8  0.006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.588698  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5686  L-rhamnose 1-epimerase  30.53 
 
 		 107 aa  40.8  0.006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6634  L-rhamnose 1-epimerase  32.26 
 
 		 104 aa  40.8  0.006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6232  L-rhamnose 1-epimerase  32.26 
 
 		 104 aa  40.8  0.006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.419182  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4774  hypothetical protein  31.65 
 
 		 108 aa  40.4  0.008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4372  L-rhamnose 1-epimerase  25.93 
 
 		 104 aa  40.4  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1027  protein of unknown function DUF718  26.42 
 
 		 104 aa  40.4  0.008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.160295 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3700  protein of unknown function DUF718  28 
 
 		 106 aa  40  0.01  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>