23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1106A_A1086 on replicon NC_009078
Organism: Burkholderia pseudomallei 1106a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008835  BMA10229_0819  hypothetical protein  100 
 
 
106 aa  218  3e-56  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1163  hypothetical protein  100 
 
 
106 aa  218  3e-56  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1086  hypothetical protein  100 
 
 
106 aa  218  3e-56  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0645  hypothetical protein  99.06 
 
 
112 aa  217  5e-56  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1781  hypothetical protein  98.11 
 
 
112 aa  214  2.9999999999999998e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1601  hypothetical protein  91.51 
 
 
112 aa  171  2.9999999999999996e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1219  hypothetical protein  65.09 
 
 
113 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1246  hypothetical protein  65.09 
 
 
113 aa  143  8.000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.944983  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6338  hypothetical protein  61.17 
 
 
109 aa  135  2e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00357939  normal  0.513822 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5323  protein of unknown function DUF718  64.08 
 
 
109 aa  134  4e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5480  protein of unknown function DUF718  57.55 
 
 
113 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.299938  normal  0.858981 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0643  hypothetical protein  50.94 
 
 
119 aa  117  6e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.198224  normal  0.98044 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3138  hypothetical protein  53.77 
 
 
113 aa  117  7.999999999999999e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.296679  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2046  hypothetical protein  39.42 
 
 
110 aa  91.3  4e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0822  hypothetical protein  43.4 
 
 
118 aa  89.7  1e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00000000953829  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0311  protein of unknown function DUF718  43.69 
 
 
108 aa  90.1  1e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.881314 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1991  protein of unknown function DUF718  43.27 
 
 
110 aa  88.2  4e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.893292 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5741  protein of unknown function DUF718  40.78 
 
 
109 aa  85.9  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0374824 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4020  protein of unknown function DUF718  40.19 
 
 
112 aa  80.5  0.000000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02757  hypothetical protein  42.99 
 
 
113 aa  76.6  0.0000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_40891  predicted protein  42.16 
 
 
126 aa  72.8  0.000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1543  hypothetical protein  39.81 
 
 
118 aa  67  0.00000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.823935 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2427  hypothetical protein  39.36 
 
 
115 aa  60.1  0.000000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>