42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_1991 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_1991  protein of unknown function DUF718  100 
 
 
110 aa  228  2e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.893292 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5741  protein of unknown function DUF718  70.64 
 
 
109 aa  173  6e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0374824 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2046  hypothetical protein  66.36 
 
 
110 aa  161  3e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4020  protein of unknown function DUF718  67.89 
 
 
112 aa  158  2e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0311  protein of unknown function DUF718  72.9 
 
 
108 aa  153  8e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.881314 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0643  hypothetical protein  56.88 
 
 
119 aa  130  5e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.198224  normal  0.98044 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5323  protein of unknown function DUF718  53.7 
 
 
109 aa  128  3e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6338  hypothetical protein  49.07 
 
 
109 aa  120  7e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00357939  normal  0.513822 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0822  hypothetical protein  48.65 
 
 
118 aa  118  3e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00000000953829  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5480  protein of unknown function DUF718  45.87 
 
 
113 aa  111  3e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.299938  normal  0.858981 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3138  hypothetical protein  50 
 
 
113 aa  104  4e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.296679  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1246  hypothetical protein  44.55 
 
 
113 aa  103  8e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.944983  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1219  hypothetical protein  42.2 
 
 
113 aa  102  1e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1543  hypothetical protein  45.87 
 
 
118 aa  95.9  2e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.823935 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02757  hypothetical protein  49.04 
 
 
113 aa  93.2  1e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0645  hypothetical protein  44.04 
 
 
112 aa  90.9  5e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1601  hypothetical protein  44.95 
 
 
112 aa  90.9  5e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1781  hypothetical protein  44.04 
 
 
112 aa  89  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1086  hypothetical protein  41.35 
 
 
106 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1163  hypothetical protein  41.35 
 
 
106 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0819  hypothetical protein  41.35 
 
 
106 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2427  hypothetical protein  42.39 
 
 
115 aa  63.5  0.0000000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_40891  predicted protein  34.23 
 
 
126 aa  60.5  0.000000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4114  hypothetical protein  27.36 
 
 
832 aa  58.9  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0478518  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2776  hypothetical protein  29.81 
 
 
838 aa  58.9  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.149981  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0240  hypothetical protein  35.71 
 
 
114 aa  57  0.00000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0314  hypothetical protein  39.18 
 
 
110 aa  55.8  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4974  hypothetical protein  34.86 
 
 
109 aa  53.1  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.651142  normal  0.112627 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3394  hypothetical protein  33.33 
 
 
109 aa  50.4  0.000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.384678 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1067  hypothetical protein  37.5 
 
 
367 aa  48.9  0.00003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0263007  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2300  protein of unknown function DUF718  28.44 
 
 
105 aa  47.4  0.00008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.60391  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3314  protein of unknown function DUF718  31.53 
 
 
107 aa  47  0.00009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00130115 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3456  hypothetical protein  32.43 
 
 
107 aa  46.6  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.022732 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0974  protein of unknown function DUF718  27.52 
 
 
106 aa  44.7  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2270  hypothetical protein  30.85 
 
 
109 aa  43.9  0.0008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.767622  normal  0.824523 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2729  hypothetical protein  30.63 
 
 
107 aa  43.5  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.727532  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2457  hypothetical protein  26.13 
 
 
115 aa  43.1  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4951  protein of unknown function DUF718  27.84 
 
 
117 aa  42.7  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.666273  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3612  protein of unknown function DUF718  28.18 
 
 
115 aa  41.6  0.004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.175398  normal  0.641333 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2981  L-rhamnose 1-epimerase  33.33 
 
 
104 aa  41.2  0.004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0297257  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1027  protein of unknown function DUF718  38.3 
 
 
104 aa  40.8  0.006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.160295 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0233  hypothetical protein  30.21 
 
 
93 aa  40  0.01  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.578121  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>