81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_4974 on replicon NC_009620
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009620  Smed_4974  hypothetical protein  100 
 
 		 109 aa  230  4.0000000000000004e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.651142  normal  0.112627 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0314  hypothetical protein  83.49 
 
 		 110 aa  200  7e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0240  hypothetical protein  86.11 
 
 		 114 aa  196  7e-50  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3394  hypothetical protein  69.72 
 
 		 109 aa  168  2e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.384678 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2270  hypothetical protein  61.68 
 
 		 109 aa  147  3e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.767622  normal  0.824523 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0233  hypothetical protein  68.52 
 
 		 93 aa  146  9e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.578121  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3484  protein of unknown function DUF718  46.79 
 
 		 107 aa  105  2e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1446  hypothetical protein  50.46 
 
 		 105 aa  93.6  9e-19  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01009  DUF718 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_1G12860)  41.59 
 
 		 114 aa  91.3  4e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0197794  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1067  hypothetical protein  40 
 
 		 367 aa  88.2  3e-17  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0263007  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4951  protein of unknown function DUF718  39.25 
 
 		 117 aa  85.5  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.666273  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0538  hypothetical protein  47.71 
 
 		 105 aa  84.3  5e-16  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.161074  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH01960  conserved hypothetical protein  31.82 
 
 		 131 aa  76.6  0.0000000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2729  hypothetical protein  34.86 
 
 		 107 aa  67.4  0.00000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.727532  normal  1 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44979  predicted protein  29.92 
 
 		 210 aa  66.6  0.0000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3314  protein of unknown function DUF718  33.03 
 
 		 107 aa  62.4  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00130115 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2457  hypothetical protein  33.94 
 
 		 115 aa  61.6  0.000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3456  hypothetical protein  33.03 
 
 		 107 aa  60.8  0.000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.022732 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2300  protein of unknown function DUF718  35.51 
 
 		 105 aa  58.9  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.60391  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3108  protein of unknown function DUF718  39 
 
 		 115 aa  59.3  0.00000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4230  L-rhamnose 1-epimerase  35.44 
 
 		 107 aa  57.4  0.00000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3612  protein of unknown function DUF718  34.58 
 
 		 115 aa  57  0.00000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.175398  normal  0.641333 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6270  L-rhamnose 1-epimerase  39.39 
 
 		 107 aa  56.6  0.0000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.203804  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0229  L-rhamnose 1-epimerase  34.57 
 
 		 104 aa  56.6  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.187644  normal  0.116954 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0974  protein of unknown function DUF718  33.03 
 
 		 106 aa  55.8  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4919  L-rhamnose 1-epimerase  27.35 
 
 		 103 aa  54.7  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0331686  normal  0.318925 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2598  hypothetical protein  31.71 
 
 		 104 aa  54.7  0.0000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.477414  normal  0.549561 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3307  hypothetical protein  38.38 
 
 		 118 aa  54.3  0.0000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3566  L-rhamnose 1-epimerase  32.91 
 
 		 106 aa  53.5  0.0000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.478649  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1991  protein of unknown function DUF718  34.86 
 
 		 110 aa  53.1  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.893292 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2208  L-rhamnose 1-epimerase  34.62 
 
 		 106 aa  52.8  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.356226 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2123  hypothetical protein  34.85 
 
 		 106 aa  52.4  0.000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0247927  normal  0.886826 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6714  L-rhamnose 1-epimerase  32.91 
 
 		 106 aa  51.2  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.7144  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3493  L-rhamnose 1-epimerase  32.5 
 
 		 104 aa  51.6  0.000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.118887  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5813  L-rhamnose 1-epimerase  30 
 
 		 106 aa  50.1  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.641251  normal  0.0735318 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0965  L-rhamnose 1-epimerase  27.5 
 
 		 104 aa  49.7  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05800  hypothetical protein  35.53 
 
 		 113 aa  48.9  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3759  L-rhamnose 1-epimerase  33.75 
 
 		 104 aa  49.3  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1358  L-rhamnose 1-epimerase  31.25 
 
 		 104 aa  49.3  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0885  protein of unknown function DUF718  35.29 
 
 		 118 aa  48.9  0.00002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3849  L-rhamnose 1-epimerase  33.75 
 
 		 104 aa  49.3  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0748  hypothetical protein  33.75 
 
 		 104 aa  49.3  0.00002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0511039 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2046  hypothetical protein  33.03 
 
 		 110 aa  48.1  0.00004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1210  L-rhamnose 1-epimerase  27.72 
 
 		 104 aa  48.1  0.00004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_40891  predicted protein  33.03 
 
 		 126 aa  48.1  0.00004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2430  hypothetical protein  26.32 
 
 		 112 aa  47.4  0.00006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.878455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2981  L-rhamnose 1-epimerase  35.19 
 
 		 104 aa  47.4  0.00007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0297257  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5741  protein of unknown function DUF718  31.19 
 
 		 109 aa  46.6  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0374824 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3700  protein of unknown function DUF718  32.91 
 
 		 106 aa  46.2  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1807  L-rhamnose 1-epimerase  27.16 
 
 		 104 aa  45.8  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1149  L-rhamnose 1-epimerase  36.84 
 
 		 104 aa  46.2  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.52416  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0496  L-rhamnose 1-epimerase  38.6 
 
 		 104 aa  46.2  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3488  L-rhamnose 1-epimerase  38.6 
 
 		 104 aa  44.7  0.0004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0417  L-rhamnose 1-epimerase  31.25 
 
 		 104 aa  42.7  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.373765  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6401  L-rhamnose 1-epimerase  27.16 
 
 		 104 aa  42.7  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.588698  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0801  protein of unknown function DUF718  26.85 
 
 		 108 aa  42.7  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.771693 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6232  L-rhamnose 1-epimerase  27.16 
 
 		 104 aa  42.4  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.419182  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6634  L-rhamnose 1-epimerase  27.16 
 
 		 104 aa  42.7  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3401  L-rhamnose 1-epimerase  27.16 
 
 		 106 aa  42  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.207239  normal  0.325252 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3612  L-rhamnose 1-epimerase  30 
 
 		 104 aa  42  0.003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4381  L-rhamnose 1-epimerase  33.33 
 
 		 99 aa  41.2  0.004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4292  L-rhamnose 1-epimerase  33.33 
 
 		 104 aa  41.2  0.005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.350342 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4020  protein of unknown function DUF718  28.72 
 
 		 112 aa  41.2  0.005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0311  protein of unknown function DUF718  34.02 
 
 		 108 aa  41.2  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.881314 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5353  L-rhamnose 1-epimerase  33.33 
 
 		 104 aa  40.8  0.005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4083  L-rhamnose 1-epimerase  33.33 
 
 		 104 aa  41.2  0.005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4774  hypothetical protein  26.83 
 
 		 108 aa  41.2  0.005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4129  L-rhamnose 1-epimerase  33.33 
 
 		 104 aa  41.2  0.005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4116  L-rhamnose 1-epimerase  33.33 
 
 		 104 aa  41.2  0.005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4432  L-rhamnose 1-epimerase  33.33 
 
 		 104 aa  41.2  0.005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03787  L-rhamnose mutarotase  33.33 
 
 		 104 aa  40.8  0.006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03736  hypothetical protein  33.33 
 
 		 104 aa  40.8  0.006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4393  hypothetical protein  26.83 
 
 		 108 aa  40.8  0.006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.278522  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4480  hypothetical protein  26.83 
 
 		 108 aa  40.8  0.006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0564  protein of unknown function DUF718  30.26 
 
 		 101 aa  40.8  0.007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09140  L-rhamnose 1-epimerase  29.41 
 
 		 103 aa  40.4  0.007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.435762  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4326  L-rhamnose 1-epimerase  31.58 
 
 		 104 aa  40.4  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.272019 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4372  L-rhamnose 1-epimerase  31.58 
 
 		 104 aa  40.4  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4257  L-rhamnose 1-epimerase  31.58 
 
 		 104 aa  40.4  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4286  L-rhamnose 1-epimerase  31.58 
 
 		 104 aa  40.4  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4438  L-rhamnose 1-epimerase  31.58 
 
 		 104 aa  40.4  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>