109 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_2117 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_2117  Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  100 
 
 		 134 aa  265  1e-70  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.300206 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1218  negative regulator of sigma-B  85.47 
 
 		 140 aa  202  9e-52  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3767  anti-sigma-factor antagonist  80 
 
 		 128 aa  195  1.0000000000000001e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0691716 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1672  negative regulator of sigma-B  84.35 
 
 		 132 aa  195  2.0000000000000003e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.108561 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3136  anti-sigma-factor antagonist  70.54 
 
 		 132 aa  186  9e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0981532  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3134  anti-sigma-factor antagonist (STAS)  71.93 
 
 		 120 aa  165  2e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.658628 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2415  anti-sigma-factor antagonist  69.3 
 
 		 142 aa  164  2.9999999999999998e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0800  anti-sigma-factor antagonist  68.14 
 
 		 123 aa  160  4.0000000000000004e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0977014  hitchhiker  0.00820415 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5230  anti-sigma-factor antagonist  59.54 
 
 		 133 aa  158  3e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.630052  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0511  anti-sigma-factor antagonist  59.54 
 
 		 133 aa  157  6e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3340  anti-sigma-factor antagonist  59.54 
 
 		 133 aa  157  6e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.43068  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0130  anti-sigma-factor antagonist  66.96 
 
 		 118 aa  156  8e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5778  anti-sigma-factor antagonist  57.72 
 
 		 125 aa  152  2e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2971  anti-sigma-factor antagonist  62.1 
 
 		 124 aa  150  5e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.665055 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1493  anti-sigma-factor antagonist  57.48 
 
 		 134 aa  150  7e-36  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.423658  normal  0.0757983 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2487  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  59.65 
 
 		 123 aa  147  3e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4410  anti-sigma-factor antagonist  60 
 
 		 124 aa  143  1e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.440698  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2268  anti-sigma-factor antagonist  57.98 
 
 		 126 aa  142  2e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.148596 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3743  anti-sigma-factor antagonist  61.06 
 
 		 125 aa  139  9.999999999999999e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2794  anti-sigma-factor antagonist  61.95 
 
 		 125 aa  139  9.999999999999999e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4971  Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  59.29 
 
 		 119 aa  135  2e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0475  anti-sigma-factor antagonist  53.51 
 
 		 120 aa  126  1.0000000000000001e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0163  anti-sigma-factor antagonist  48.03 
 
 		 127 aa  124  3e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.438455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0676  anti-sigma-factor antagonist  48.03 
 
 		 127 aa  124  3e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.483964  normal  0.0105884 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0736  anti-sigma-factor antagonist  48.82 
 
 		 134 aa  123  9e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2683  anti-sigma-factor antagonist  49.55 
 
 		 127 aa  118  1.9999999999999998e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32010  anti-anti-sigma regulatory factor (antagonist of anti-sigma factor)  47.79 
 
 		 119 aa  102  2e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0737154  normal  0.110426 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3438  anti-sigma-factor antagonist  39.17 
 
 		 125 aa  101  3e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0775335  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1474  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  36.84 
 
 		 123 aa  94  7e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000611379  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3858  anti-sigma-factor antagonist  49.51 
 
 		 131 aa  90.9  5e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.680358 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0140  anti-sigma-factor antagonist  39.82 
 
 		 118 aa  90.1  1e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00670241  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1811  anti-sigma-factor antagonist  34.82 
 
 		 124 aa  87.4  6e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6566  anti-sigma-factor antagonist  42.06 
 
 		 129 aa  85.9  2e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.778948  normal  0.044329 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0693  anti-sigma-factor antagonist  33.04 
 
 		 120 aa  82.8  0.000000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0196  anti-sigma-factor antagonist  35.19 
 
 		 126 aa  70.9  0.000000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0995683  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2566  anti-sigma-factor antagonist  35.9 
 
 		 362 aa  58.9  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0550  anti-sigma-factor antagonist  37.93 
 
 		 372 aa  58.2  0.00000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0350  anti-sigma-factor antagonist  36.78 
 
 		 385 aa  56.2  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.341427 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1810  anti-sigma-factor antagonist  28.46 
 
 		 252 aa  56.2  0.0000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2805  anti-sigma-factor antagonist  32.97 
 
 		 275 aa  54.7  0.0000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4158  anti-sigma-factor antagonist  31.76 
 
 		 556 aa  51.6  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.6446  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0590  anti-sigma-factor antagonist  34.12 
 
 		 549 aa  52  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.641897 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1856  anti-sigma-factor antagonist  34.94 
 
 		 365 aa  52  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.616563 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4191  anti-sigma-factor antagonist  32.88 
 
 		 372 aa  51.2  0.000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2509  anti-sigma-factor antagonist  27.68 
 
 		 388 aa  50.4  0.000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.840655 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0116  anti-sigma-factor antagonist  36.49 
 
 		 357 aa  50.1  0.000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00357246  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2484  anti-sigma-factor antagonist  28.38 
 
 		 281 aa  50.1  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.817104  normal  0.435935 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0141  anti-sigma-factor antagonist  27.83 
 
 		 298 aa  49.3  0.00002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0116373  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0963  anti-sigma-factor antagonist  28.83 
 
 		 308 aa  49.3  0.00002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2751  anti-sigma-factor antagonist  27.78 
 
 		 357 aa  49.3  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3527  putative PAS/PAC sensor protein  34.18 
 
 		 667 aa  49.3  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2660  anti-sigma-factor antagonist  36.92 
 
 		 359 aa  48.9  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.627609 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3133  anti-sigma-factor antagonist (STAS)  29.55 
 
 		 283 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.715564 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4192  anti-sigma-factor antagonist  27.96 
 
 		 380 aa  48.5  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2225  putative PAS/PAC sensor protein  33.33 
 
 		 509 aa  48.1  0.00004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00360384  normal  0.281465 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0410  anti-sigma-factor antagonist  27.63 
 
 		 361 aa  47.8  0.00005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.695022  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4193  anti-sigma-factor antagonist  28.57 
 
 		 388 aa  47.4  0.00006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.512657  hitchhiker  0.00496827 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4189  putative PAS/PAC sensor protein  28.75 
 
 		 428 aa  47.4  0.00007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000679447 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3768  anti-sigma-factor antagonist  27.91 
 
 		 284 aa  47.4  0.00007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0315517 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1316  anti-sigma-factor antagonist  30.77 
 
 		 284 aa  47  0.00008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2970  anti-sigma-factor antagonist  31.43 
 
 		 285 aa  47  0.00009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.528649 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3137  anti-sigma-factor antagonist  32.39 
 
 		 283 aa  47  0.00009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.225193  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3859  anti-sigma-factor antagonist  29 
 
 		 295 aa  47  0.00009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1475  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  24.53 
 
 		 272 aa  47  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000603056  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3800  putative PAS/PAC sensor protein  28.75 
 
 		 430 aa  46.6  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32020  anti-anti-sigma regulatory factor (antagonist of anti-sigma factor)  30.3 
 
 		 283 aa  46.6  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.16584  normal  0.174453 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3858  anti-sigma-factor antagonist  25 
 
 		 357 aa  46.6  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3404  anti-sigma-factor antagonist  27.03 
 
 		 361 aa  46.6  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0135  anti-sigma-factor antagonist  26.8 
 
 		 371 aa  45.8  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.167444  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0373  anti-sigma-factor antagonist  28.28 
 
 		 365 aa  45.8  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2421  anti-sigma-factor antagonist  29.17 
 
 		 523 aa  45.8  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4058  anti-sigma-factor antagonist  24.18 
 
 		 370 aa  45.4  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0903  anti-sigma-factor antagonist  27.78 
 
 		 376 aa  45.8  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000110303  hitchhiker  0.00000527056 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1317  anti-sigma-factor antagonist  27.85 
 
 		 286 aa  45.4  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2118  Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  30.99 
 
 		 285 aa  45.1  0.0004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.333632 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4199  putative PAS/PAC sensor protein  29.49 
 
 		 562 aa  43.9  0.0007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00362058 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2307  anti-sigma-factor antagonist  23.66 
 
 		 439 aa  43.9  0.0008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1219  positive regulator of sigma-B  31.43 
 
 		 286 aa  42.7  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.30106  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0221  anti-sigma-factor antagonist  26.19 
 
 		 366 aa  43.5  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1935  anti-sigma-factor antagonist  23.64 
 
 		 421 aa  43.1  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.201597 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3473  anti-sigma-factor antagonist  35.63 
 
 		 422 aa  43.1  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.551903  normal  0.0822697 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0799  anti-sigma-factor antagonist  25.29 
 
 		 286 aa  43.1  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.224753  hitchhiker  0.00639287 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2789  putative PAS/PAC sensor protein  24.71 
 
 		 323 aa  43.5  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4325  anti-sigma-factor antagonist  29.27 
 
 		 359 aa  43.5  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0978917  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2482  anti-sigma-factor antagonist  25.68 
 
 		 293 aa  43.1  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.700951  normal  0.474316 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2483  anti-sigma-factor antagonist  27.03 
 
 		 291 aa  43.1  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.872627  normal  0.455884 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2667  putative PAS/PAC sensor protein  26.67 
 
 		 653 aa  43.1  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000189051 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4970  Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  28.57 
 
 		 284 aa  42.7  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1936  anti-sigma-factor antagonist  32.22 
 
 		 314 aa  42.7  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.729747  normal  0.557199 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3158  anti-sigma-factor antagonist  23.86 
 
 		 445 aa  42.7  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1903  anti-sigma-factor antagonist  25.23 
 
 		 689 aa  42.7  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1962  putative PAS/PAC sensor protein  23.53 
 
 		 538 aa  42.7  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.118262  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3016  anti-sigma-factor antagonist  28.21 
 
 		 510 aa  42.4  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000586353  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0195  putative PAS/PAC sensor protein  25.62 
 
 		 255 aa  42.4  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.1074  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0053  anti-sigma-factor antagonist  29.85 
 
 		 377 aa  41.6  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0493156  normal  0.337885 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1662  anti-sigma-factor antagonist  27.59 
 
 		 290 aa  42  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.80194  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4771  anti-sigma-factor antagonist  28.21 
 
 		 231 aa  41.6  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1492  anti-sigma-factor antagonist  29.58 
 
 		 282 aa  41.6  0.004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0622527 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2322  anti-sigma-factor antagonist  25.42 
 
 		 521 aa  41.6  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4421  anti-sigma-factor antagonist  25.32 
 
 		 271 aa  41.2  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>