37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_1790 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_1790  membrane protein  100 
 
 		 150 aa  301  2.0000000000000002e-81  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0469935  hitchhiker  0.000576942 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4296  DoxX family protein  27.93 
 
 		 133 aa  65.5  0.0000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.479506  normal  0.170558 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0138  hypothetical protein  37.25 
 
 		 117 aa  62  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.620738  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4122  membrane protein-like protein  32.28 
 
 		 150 aa  61.2  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1317  hypothetical protein  32.54 
 
 		 140 aa  58.9  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000855908  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1649  hypothetical protein  32.48 
 
 		 174 aa  55.5  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.37839  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3783  membrane protein-like protein  36.84 
 
 		 137 aa  55.5  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00217188  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2315  hypothetical protein  24.46 
 
 		 148 aa  54.3  0.0000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.20145  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5798  hypothetical protein  29.03 
 
 		 169 aa  53.9  0.0000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.233745 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01390  predicted membrane protein  34.07 
 
 		 148 aa  52.4  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.723159  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1405  hypothetical protein  34.44 
 
 		 141 aa  52  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.78031  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1423  hypothetical protein  34.44 
 
 		 141 aa  52  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2209  hypothetical protein  28.57 
 
 		 116 aa  51.6  0.000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2171  membrane protein-like protein  28.57 
 
 		 116 aa  51.6  0.000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2608  hypothetical protein  31.53 
 
 		 175 aa  50.8  0.000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.253615 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3912  hypothetical protein  34.09 
 
 		 143 aa  50.4  0.000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.326133  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3824  hypothetical protein  32.97 
 
 		 143 aa  50.4  0.000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.161652  normal  0.397741 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3838  hypothetical protein  34.09 
 
 		 162 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0996285  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1803  hypothetical protein  33.33 
 
 		 134 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0443122  normal  0.0591067 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4341  hypothetical protein  26.9 
 
 		 171 aa  47.8  0.00005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.440484  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5136  hypothetical protein  35.14 
 
 		 152 aa  47.8  0.00005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5051  hypothetical protein  30.1 
 
 		 115 aa  47.4  0.00007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.780189 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2150  membrane protein-like  27.83 
 
 		 147 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0271562 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2364  hypothetical protein  31.52 
 
 		 127 aa  46.2  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.773644  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1635  DoxX family protein  27.59 
 
 		 168 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.364562 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4712  hypothetical protein  33.33 
 
 		 156 aa  45.1  0.0004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.880265  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1742  hypothetical protein  31.37 
 
 		 116 aa  43.1  0.001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3912  membrane protein-like protein  26.61 
 
 		 140 aa  43.1  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0622055 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1459  hypothetical protein  33.33 
 
 		 131 aa  43.1  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.340205  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0969  hypothetical protein  26.37 
 
 		 118 aa  42.4  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4384  membrane protein-like protein  24.19 
 
 		 140 aa  42.4  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.764117  normal  0.999315 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0849  hypothetical protein  26.36 
 
 		 127 aa  41.6  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17130  predicted membrane protein  28.75 
 
 		 129 aa  41.6  0.004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0315505  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4279  membrane protein-like protein  26.61 
 
 		 140 aa  40.8  0.006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.566511 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53830  hypothetical protein  29.41 
 
 		 131 aa  40.8  0.006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.623323  normal  0.810149 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0585  hypothetical protein  29.82 
 
 		 138 aa  40.8  0.007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.600246  normal  0.811412 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1829  hypothetical protein  35.29 
 
 		 118 aa  40  0.01  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.470131  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>