38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_5565 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_5565  hypothetical protein  100 
 
 		 251 aa  517  1e-146  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.769998 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5211  hypothetical protein  48.21 
 
 		 131 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5207  hypothetical protein  45.38 
 
 		 131 aa  115  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0112  hypothetical protein  36.04 
 
 		 136 aa  92  7e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5226  hypothetical protein  30.77 
 
 		 133 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.545011  normal  0.0279561 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0393  hypothetical protein  33.33 
 
 		 136 aa  66.6  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4785  hypothetical protein  31.48 
 
 		 136 aa  65.5  0.0000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.898894  normal  0.0913989 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0328  hypothetical protein  30.39 
 
 		 138 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.355398  normal  0.357964 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0307  hypothetical protein  27.97 
 
 		 143 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00224199 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3894  hypothetical protein  34.17 
 
 		 134 aa  57  0.0000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0330  hypothetical protein  23.14 
 
 		 133 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4773  hypothetical protein  28.81 
 
 		 135 aa  53.9  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4900  hypothetical protein  25.42 
 
 		 138 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.418097  normal  0.436154 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1197  hypothetical protein  29.46 
 
 		 131 aa  53.5  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1082  putative secreted protein  29.46 
 
 		 131 aa  53.1  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1187  putative secreted protein  29.46 
 
 		 131 aa  53.1  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.252053  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1232  putative secreted protein  29.46 
 
 		 131 aa  53.1  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.565671 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1217  putative secreted protein  29.46 
 
 		 131 aa  52.4  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.446531 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2321  hypothetical protein  26.76 
 
 		 144 aa  51.6  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.395744 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4365  hypothetical protein  32.99 
 
 		 128 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.751601  normal  0.995062 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1540  hypothetical protein  29.63 
 
 		 131 aa  50.8  0.00002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0815668 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2385  hypothetical protein  30.36 
 
 		 140 aa  49.7  0.00004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.953868  normal  0.33796 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2195  hypothetical protein  29.91 
 
 		 142 aa  49.7  0.00005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0365  protein of unknown function DUF1311  32.71 
 
 		 134 aa  48.5  0.0001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.12825 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4257  hypothetical protein  30.17 
 
 		 135 aa  48.5  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.1125  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3773  hypothetical protein  30.39 
 
 		 134 aa  47  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.574363  normal  0.482694 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5990  hypothetical protein  30.65 
 
 		 134 aa  46.6  0.0004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1653  hypothetical protein  28.32 
 
 		 134 aa  45.4  0.0008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.186504  normal  0.287849 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4364  hypothetical protein  30.09 
 
 		 134 aa  45.1  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.765035  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4003  hypothetical protein  30.09 
 
 		 134 aa  45.1  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.806978  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4247  hypothetical protein  29.41 
 
 		 134 aa  45.1  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0712  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2967  hypothetical protein  27.73 
 
 		 125 aa  44.7  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.03291  normal  0.134443 
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4780  hypothetical protein  32.26 
 
 		 133 aa  44.7  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.533353  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0862  hypothetical protein  26.8 
 
 		 128 aa  43.5  0.004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2486  hypothetical protein  29.13 
 
 		 135 aa  43.1  0.004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.635228  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1843  hypothetical protein  30.65 
 
 		 128 aa  43.1  0.004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.308935 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0821  hypothetical protein  27.84 
 
 		 136 aa  43.1  0.004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.163557  normal  0.0923221 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0848  hypothetical protein  27.84 
 
 		 128 aa  42.7  0.005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.796587 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>