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for query gene Pfl01_0142 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



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Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_1271  major facilitator transporter  69.2 
 
 		 513 aa  666    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4577  major facilitator transporter  68.99 
 
 		 513 aa  669    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.487464  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0872  major facilitator transporter  70.02 
 
 		 513 aa  666    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0142  major facilitator transporter  100 
 
 		 511 aa  1005    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4454  major facilitator transporter  68.99 
 
 		 513 aa  642    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.544324  normal  0.740147 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2320  major facilitator transporter  63.35 
 
 		 544 aa  613  9.999999999999999e-175  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0793665  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27430  putative multidrug efflux MFS transporter  63.35 
 
 		 530 aa  614  9.999999999999999e-175  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0744165  normal  0.700486 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3380  major facilitator superfamily MFS_1  65.91 
 
 		 509 aa  608  1e-173  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.188058 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2125  major facilitator superfamily MFS_1  59.66 
 
 		 537 aa  569  1e-161  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1697  major facilitator superfamily MFS_1  60.29 
 
 		 499 aa  570  1e-161  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5000  major facilitator transporter  54.41 
 
 		 535 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.159102 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4488  major facilitator transporter  57.4 
 
 		 541 aa  529  1e-149  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1705  major facilitator superfamily MFS_1  55.06 
 
 		 553 aa  513  1e-144  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46380  major facilitator superfamily protein  54.16 
 
 		 518 aa  511  1e-143  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2500  major facilitator transporter  47.57 
 
 		 577 aa  489  1e-137  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.706515  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2303  major facilitator superfamily MFS_1  47.62 
 
 		 545 aa  488  1e-136  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.292812  normal  0.0663224 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1333  major facilitator transporter  52.06 
 
 		 535 aa  474  1e-132  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1156  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  45.09 
 
 		 524 aa  387  1e-106  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.783022  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2527  major facilitator superfamily MFS_1  41.25 
 
 		 522 aa  365  1e-100  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6435  major facilitator superfamily MFS_1  41.77 
 
 		 509 aa  353  4e-96  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00900  inner membrane multidrug resistance transmembrane protein  44.24 
 
 		 498 aa  342  1e-92  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.976104 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1820  putative transporter protein  40.35 
 
 		 457 aa  313  3.9999999999999997e-84  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.398976  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1814  major facilitator superfamily MFS_1  33.18 
 
 		 522 aa  248  2e-64  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0912576 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3991  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.37 
 
 		 527 aa  232  2e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1506  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.33 
 
 		 516 aa  230  4e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3785  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.48 
 
 		 516 aa  224  4e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0929459  normal  0.428314 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1975  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.66 
 
 		 516 aa  223  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.211725  hitchhiker  0.00374336 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1623  putative transport protein (permease)  33.25 
 
 		 545 aa  221  3e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1876  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.49 
 
 		 516 aa  217  4e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.803136  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5997  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.51 
 
 		 529 aa  216  5.9999999999999996e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.378354  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1991  MFS family transporter  30.57 
 
 		 519 aa  213  7e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.332362  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0523  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.7 
 
 		 535 aa  211  2e-53  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4522  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.19 
 
 		 526 aa  212  2e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.121498 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0524  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.18 
 
 		 535 aa  211  2e-53  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23520  putative MFS transporter  31.19 
 
 		 499 aa  211  2e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0341451 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0525  drug resistance transporter, EmrB/QacA family protein  30.96 
 
 		 539 aa  211  3e-53  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3508  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.5 
 
 		 535 aa  210  5e-53  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.87525  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2736  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.71 
 
 		 517 aa  206  6e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.545703 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2981  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.08 
 
 		 540 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2017  MFS transporter  28.74 
 
 		 534 aa  201  3e-50  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.775296  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0835  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.5 
 
 		 536 aa  200  3.9999999999999996e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.861502 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0955  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.97 
 
 		 539 aa  200  3.9999999999999996e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3278  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.05 
 
 		 539 aa  199  7e-50  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.629429  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3842  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.74 
 
 		 542 aa  197  5.000000000000001e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6487  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.11 
 
 		 527 aa  197  5.000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3786  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.74 
 
 		 542 aa  196  6e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0483  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.74 
 
 		 542 aa  196  7e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3968  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.74 
 
 		 542 aa  196  8.000000000000001e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0500  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.16 
 
 		 543 aa  194  2e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.667013  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3405  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.93 
 
 		 538 aa  194  4e-48  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0453  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.72 
 
 		 526 aa  192  1e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6362  major facilitator transporter  29.85 
 
 		 526 aa  187  4e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0208  major facilitator transporter  29.05 
 
 		 527 aa  187  4e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.639267 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1466  major facilitator transporter  29.85 
 
 		 526 aa  187  4e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0127999  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1607  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.6 
 
 		 535 aa  187  5e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.798645  hitchhiker  0.000105098 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7029  major facilitator transporter  29.57 
 
 		 526 aa  184  3e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.97831  normal  0.626046 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2067  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.65 
 
 		 527 aa  182  1e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.851411 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2113  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.23 
 
 		 514 aa  181  2e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3676  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.4 
 
 		 504 aa  180  4.999999999999999e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3453  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28 
 
 		 519 aa  179  1e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4968  major facilitator transporter  29.31 
 
 		 529 aa  177  4e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0130308 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0403  drug resistance transporter, EmrB/QacA family protein  28.57 
 
 		 529 aa  176  9.999999999999999e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6590  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.77 
 
 		 523 aa  169  1e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.236346 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5591  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter EmrB/QacA subfamily  26.15 
 
 		 524 aa  164  3e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48300  putative MFS transporter  27.31 
 
 		 503 aa  161  2e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.966541  normal  0.132172 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1714  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.32 
 
 		 532 aa  159  1e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.140819  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4286  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.71 
 
 		 527 aa  157  6e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.146244  normal  0.252791 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3627  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.25 
 
 		 528 aa  157  6e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.126338  normal  0.617009 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3900  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.25 
 
 		 528 aa  157  6e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.645893  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4466  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.25 
 
 		 528 aa  157  6e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.87368  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4967  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.9 
 
 		 527 aa  155  1e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.13795  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3193  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.9 
 
 		 527 aa  155  1e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4512  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.9 
 
 		 523 aa  154  2.9999999999999998e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.215591  normal  0.994671 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2192  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.12 
 
 		 528 aa  154  5e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.024166  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3794  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.31 
 
 		 530 aa  152  1e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.14668  normal  0.421617 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3794  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.86 
 
 		 528 aa  152  1e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.354181 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4683  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.85 
 
 		 529 aa  152  1e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.20572  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3275  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.86 
 
 		 528 aa  152  1e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00460  transport protein  26.15 
 
 		 528 aa  150  7e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0564548  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0954  major facilitator superfamily MFS_1  30.83 
 
 		 517 aa  148  2.0000000000000003e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2706  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.17 
 
 		 537 aa  148  2.0000000000000003e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3414  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  25.87 
 
 		 532 aa  147  4.0000000000000006e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.248992  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3712  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  25.48 
 
 		 532 aa  147  4.0000000000000006e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.368579 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3596  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.54 
 
 		 516 aa  147  6e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.692302 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1981  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.25 
 
 		 528 aa  147  7.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0426587  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0239  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.15 
 
 		 536 aa  145  2e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4417  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.33 
 
 		 523 aa  144  3e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.022578  normal  0.743863 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2927  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.92 
 
 		 530 aa  144  4e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.401426  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1631  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.19 
 
 		 521 aa  143  8e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4495  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.57 
 
 		 526 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0608194  normal  0.157501 
 
 
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NC_007952  Bxe_B0737  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  26.8 
 
 		 523 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.299859  normal  0.9016 
 
 
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NC_008609  Ppro_2635  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.53 
 
 		 520 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.723891  n/a   
 
 
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NC_012918  GM21_1604  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.59 
 
 		 515 aa  141  1.9999999999999998e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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NC_010623  Bphy_3361  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.52 
 
 		 535 aa  141  3e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.182834  hitchhiker  0.000000000000491163 
 
 
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NC_011146  Gbem_2631  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.52 
 
 		 515 aa  141  3e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.383083  n/a   
 
 
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NC_011004  Rpal_4060  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27 
 
 		 530 aa  141  3.9999999999999997e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.236372  n/a   
 
 
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NC_003295  RSc2727  multidrug resistance transmembrane protein  27.97 
 
 		 511 aa  139  1e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007517  Gmet_1374  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.36 
 
 		 517 aa  139  1e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.511847  hitchhiker  0.000280107 
 
 
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NC_007925  RPC_2181  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.95 
 
 		 531 aa  138  2e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008554  Sfum_3317  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.1 
 
 		 526 aa  138  3.0000000000000003e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.135478 
 
 
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