78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_2359 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013421  Pecwa_2359  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  100 
 
 		 201 aa  409  1e-113  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.4596  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2011  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  72.82 
 
 		 201 aa  304  5.0000000000000004e-82  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.326145  normal  0.231246 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1623  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  71.79 
 
 		 201 aa  300  8.000000000000001e-81  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2237  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  73.33 
 
 		 201 aa  283  1.0000000000000001e-75  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.282734  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1764  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  72.31 
 
 		 201 aa  282  3.0000000000000004e-75  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.464665  hitchhiker  0.000964827 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01375  hypothetical protein  72.82 
 
 		 201 aa  281  4.0000000000000003e-75  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01363  predicted inner membrane protein  72.82 
 
 		 201 aa  281  4.0000000000000003e-75  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1491  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  72.82 
 
 		 201 aa  281  4.0000000000000003e-75  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2250  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  72.31 
 
 		 201 aa  279  2e-74  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1589  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  70.77 
 
 		 201 aa  276  2e-73  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1287  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  57.95 
 
 		 200 aa  229  2e-59  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0130341  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3084  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  57.95 
 
 		 200 aa  229  2e-59  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.855556  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3006  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  56.99 
 
 		 198 aa  224  6e-58  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.171368  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2879  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  46.19 
 
 		 203 aa  176  2e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0926857 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1176  phosphomethylpyrimidine kinase  48.98 
 
 		 197 aa  173  9.999999999999999e-43  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.792926  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4658  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  47.74 
 
 		 200 aa  172  3.9999999999999995e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5536  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  46.97 
 
 		 205 aa  166  2e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2882  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  50 
 
 		 201 aa  160  9e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.156757  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1580  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  39.7 
 
 		 201 aa  157  1e-37  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.12737  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3841  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  50.75 
 
 		 205 aa  156  2e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4519  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  45.5 
 
 		 228 aa  149  3e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0424052  normal  0.656597 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06020  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  46.97 
 
 		 230 aa  148  4e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4011  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  44.72 
 
 		 209 aa  148  5e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1374  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  44.22 
 
 		 201 aa  147  8e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.0055276  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0892  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  44.22 
 
 		 201 aa  147  8e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1352  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  44.22 
 
 		 201 aa  147  8e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.642809  normal  0.111178 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31700  putative CDP-alcohol phosphatidyltransferase  45.05 
 
 		 211 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2696  putative CDP-alcohol phosphatidyltransferase  45.05 
 
 		 211 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.731154  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1725  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  46.19 
 
 		 203 aa  147  2.0000000000000003e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1252  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  45.23 
 
 		 201 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0010  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  52.2 
 
 		 201 aa  145  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1277  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  44.72 
 
 		 201 aa  145  4.0000000000000006e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.184378 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1100  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  45.89 
 
 		 211 aa  141  6e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3513  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  50.64 
 
 		 201 aa  136  2e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0430214  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2777  phosphatidylglycerophosphate synthase  48.76 
 
 		 201 aa  136  2e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.786395  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3660  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  42.42 
 
 		 205 aa  126  3e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1250  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  25.31 
 
 		 203 aa  71.2  0.00000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2135  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  28.4 
 
 		 198 aa  61.2  0.000000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1524  hypothetical protein  27.74 
 
 		 252 aa  58.5  0.00000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0365  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  29.41 
 
 		 213 aa  58.2  0.00000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2373  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  28.98 
 
 		 202 aa  57.8  0.0000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.486813  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1228  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  30.77 
 
 		 200 aa  57.8  0.0000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2209  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  24.88 
 
 		 202 aa  57  0.0000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.000000000779527  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1126  hypothetical protein  27.75 
 
 		 212 aa  57  0.0000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1904  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  26.49 
 
 		 200 aa  57  0.0000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1902  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  26.14 
 
 		 204 aa  56.6  0.0000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0310  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  22.81 
 
 		 204 aa  53.1  0.000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19600  hypothetical protein  29.38 
 
 		 209 aa  53.1  0.000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0605  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  23.53 
 
 		 203 aa  51.2  0.00001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.566054  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0561  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  27.78 
 
 		 195 aa  50.8  0.00001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0331  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  32.26 
 
 		 192 aa  48.9  0.00005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0065  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  24.87 
 
 		 197 aa  48.1  0.00008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.364844  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2405  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  28.48 
 
 		 205 aa  48.1  0.00008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.468661  normal  0.0258334 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6361  CDP-diacylglycerol-glycerol-3-phosphate 3-phosphatidyltransferase protein  32.91 
 
 		 209 aa  47.8  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.368915  normal  0.164318 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1362  CDP-diacylglycerol inositol 3-phosphatidyltransferase  28.97 
 
 		 265 aa  47.8  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.724418  normal  0.592258 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0545  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  26.67 
 
 		 195 aa  48.1  0.0001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3918  CDP-diacylglycerol--glycerol-3-phosphate 3-phosphatidyltransferase  28.17 
 
 		 225 aa  47  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1342  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  24.7 
 
 		 200 aa  47  0.0002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6182  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  32.91 
 
 		 209 aa  47  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.130047  normal  0.343003 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2978  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  29.45 
 
 		 201 aa  46.2  0.0003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4949  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  28.57 
 
 		 247 aa  45.8  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12631  phosphatidylinositol synthase pgsA1  25.63 
 
 		 217 aa  46.2  0.0004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1447  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  30.84 
 
 		 193 aa  45.1  0.0007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000162704  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_850  phosphatidylglycerophosphate synthase  26.55 
 
 		 193 aa  44.3  0.001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000490596  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4806  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  25.9 
 
 		 216 aa  43.5  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0122  CDP-diacylglycerol--glycerol-3-phosphate 3-phosphatidyltransferase  27.48 
 
 		 199 aa  43.5  0.002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.025729  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02967  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  32.53 
 
 		 100 aa  43.5  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1060  CDP-diacylglycerol/glycerol-3-phosphate3- phospha tidyltransferase  31 
 
 		 180 aa  43.1  0.003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0782  CDP-diacylglycerol--glycerol-3-phosphate 3-phosphatidyltransferase  31.37 
 
 		 181 aa  42.4  0.004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0948  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  34.21 
 
 		 186 aa  42.4  0.004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1058  CDP-diacylglycerol--serine O-phosphatidyltransferase  32.5 
 
 		 216 aa  42.4  0.005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.10041  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1397  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  25.32 
 
 		 210 aa  42  0.005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3631  CDP-diacylglycerol--glycerol-3-phosphate 3-phosphatidyltransferase  32.04 
 
 		 223 aa  41.6  0.007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.232474 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2074  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  27.46 
 
 		 202 aa  41.6  0.008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.922495  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0180  CDP-diacylglycerol--glycerol-3-phosphate 3-phosphatidyltransferase  31.18 
 
 		 202 aa  41.6  0.008  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.856562  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3249  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  29.91 
 
 		 229 aa  41.6  0.008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.64355  normal  0.467888 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0868  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  25.32 
 
 		 194 aa  41.6  0.008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.00000000176842  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5154  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  30.1 
 
 		 301 aa  41.6  0.009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.113865  decreased coverage  0.000103616 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>