More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_0687 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008686  Pden_0687  OmpA domain-containing protein  100 
 
 
173 aa  354  3.9999999999999996e-97  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.182199  normal  0.103402 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0563  OmpA domain-containing protein  63.64 
 
 
182 aa  181  3e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.570179  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2321  OmpA domain-containing protein  62.88 
 
 
182 aa  179  2e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.149229  normal  0.659387 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0668  OmpA/MotB family protein  62.88 
 
 
182 aa  179  2e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.942269  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2364  OmpA/MotB  55.77 
 
 
167 aa  169  2e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.550372 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1112  peptidoglycan-associated lipoprotein  58.2 
 
 
175 aa  160  6e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.248876  normal  0.324066 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5389  peptidoglycan-associated lipoprotein  51.25 
 
 
170 aa  159  1e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1815  OmpA/MotB  51.22 
 
 
165 aa  159  2e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.336374  normal  0.544468 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4144  OmpA/MotB  48.78 
 
 
165 aa  158  3e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4748  OmpA/MotB  49.41 
 
 
166 aa  158  4e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3509  OmpA/MotB  49.69 
 
 
164 aa  158  4e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.140214  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2123  peptidoglycan-associated lipoprotein  51.22 
 
 
166 aa  153  1e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.089577  normal  0.358435 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0976  OmpA/MotB  66.39 
 
 
172 aa  151  5e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.105437  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1314  peptidoglycan-associated lipoprotein  47.56 
 
 
165 aa  150  5.9999999999999996e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6878  Outer membrane lipoprotein omp16 precursor (peptidoglycan-associated lipoprotein)  50.33 
 
 
149 aa  150  8.999999999999999e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.401181  normal  0.0290754 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3400  peptidoglycan-associated lipoprotein  51.52 
 
 
172 aa  149  2e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.374002 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4332  peptidoglycan-associated lipoprotein  54.2 
 
 
164 aa  148  3e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0932864 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0783  peptidoglycan-associated lipoprotein  50.62 
 
 
169 aa  148  5e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.106723 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1095  OmpA/MotB  48.77 
 
 
161 aa  147  7e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.159839  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3080  peptidoglycan-associated lipoprotein  56.78 
 
 
164 aa  147  7e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.430069  normal  0.685943 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2714  OmpA/MotB  55.93 
 
 
167 aa  147  8e-35  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.358472  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4843  peptidoglycan-associated lipoprotein  54.17 
 
 
170 aa  144  9e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.678153  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5311  peptidoglycan-associated lipoprotein  54.17 
 
 
170 aa  144  9e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5488  peptidoglycan-associated lipoprotein  56.52 
 
 
172 aa  141  4e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.429117  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3622  peptidoglycan-associated lipoprotein  50.38 
 
 
177 aa  139  9.999999999999999e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.595111  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1638  outer membrane lipoprotein Omp16 (minor outer membraneprotein omp16) (16 kDa OMP) (16.5 kDa minor OMP)  49.62 
 
 
168 aa  139  1.9999999999999998e-32  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1695  Pal family lipoprotein  49.62 
 
 
168 aa  139  1.9999999999999998e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1220  peptidoglycan-associated lipoprotein  48.87 
 
 
168 aa  139  1.9999999999999998e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.427658  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0327  OmpA/MotB  47.59 
 
 
170 aa  138  4.999999999999999e-32  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.927231  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0165  peptidoglycan-associated lipoprotein  50.82 
 
 
174 aa  135  2e-31  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3170  OmpA/MotB  52.46 
 
 
172 aa  135  2e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.190216  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1018  OmpA/MotB  55.08 
 
 
170 aa  130  1.0000000000000001e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0280  peptidoglycan-associated lipoprotein  55.17 
 
 
168 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0118022 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3199  peptidoglycan-associated lipoprotein  45.93 
 
 
177 aa  127  8.000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2415  OmpA/MotB domain-containing protein  42.35 
 
 
173 aa  125  3e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4426  peptidoglycan-associated lipoprotein  43.79 
 
 
185 aa  124  9e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.651872 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2626  peptidoglycan-associated lipoprotein  51.64 
 
 
176 aa  122  2e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2209  peptidoglycan-associated lipoprotein  52.34 
 
 
181 aa  119  1.9999999999999998e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000116436  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2132  peptidoglycan-associated lipoprotein  47.06 
 
 
175 aa  117  9.999999999999999e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.250962  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0388  OmpA/MotB  46.97 
 
 
174 aa  115  1.9999999999999998e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2159  peptidoglycan-associated lipoprotein  56.07 
 
 
173 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00109799  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3494  peptidoglycan-associated lipoprotein  52.14 
 
 
177 aa  114  6e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.373664  normal  0.13836 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0615  Outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)proteins-like  50.94 
 
 
154 aa  113  2.0000000000000002e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0124381  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0225  peptidoglycan-associated lipoprotein  40.12 
 
 
154 aa  112  3e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000120265  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0861  OmpA/MotB domain-containing protein  39.13 
 
 
162 aa  112  3e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0437517  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1210  peptidoglycan-associated lipoprotein  42.86 
 
 
158 aa  111  5e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.240268  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1277  OmpA/MotB domain-containing protein  38.24 
 
 
172 aa  110  7.000000000000001e-24  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1710  peptidoglycan-associated lipoprotein  50.49 
 
 
158 aa  108  3e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.0000000475645  decreased coverage  0.0000694892 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0616  peptidoglycan-associated lipoprotein  43.97 
 
 
171 aa  108  4.0000000000000004e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0805483  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0749  peptidoglycan-associated lipoprotein  47.79 
 
 
169 aa  106  1e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000395754  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1584  peptidoglycan-associated lipoprotein  47.79 
 
 
199 aa  106  2e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.904402  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0860  OmpA/MotB domain-containing protein  48.11 
 
 
152 aa  105  3e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.128552  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2160  peptidoglycan-associated lipoprotein  48.11 
 
 
157 aa  105  4e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000805861  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1428  peptidoglycan-associated lipoprotein  47.57 
 
 
172 aa  104  5e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000158382  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2901  peptidoglycan-associated outer membrane lipoprotein  37.5 
 
 
168 aa  104  5e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000125837  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4535  peptidoglycan associated lipoprotein OprL precursor  46.51 
 
 
169 aa  104  7e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51710  peptidoglycan associated lipoprotein OprL precursor  46.51 
 
 
168 aa  104  7e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000147686  hitchhiker  0.00068918 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1157  peptidoglycan-associated outer membrane lipoprotein  37.5 
 
 
168 aa  104  8e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1732  peptidoglycan-associated lipoprotein  49.02 
 
 
184 aa  103  2e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.110246  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1698  OmpA/MotB domain-containing protein  48.54 
 
 
189 aa  102  2e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.000544254  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1509  OmpA/MotB  35.76 
 
 
172 aa  102  2e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.152591  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1039  Outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)proteins-like  47.96 
 
 
183 aa  102  3e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.872127  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01611  hypothetical protein  46.6 
 
 
173 aa  102  3e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0748  peptidoglycan-associated lipoprotein  44.86 
 
 
153 aa  102  3e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.00000000000000605399  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1854  OmpA/MotB  44.55 
 
 
177 aa  101  4e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0466  OmpA/MotB domain-containing protein  49.04 
 
 
203 aa  101  5e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.651077 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1899  peptidoglycan-associated lipoprotein precursor  47.57 
 
 
185 aa  101  5e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.640623  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003912  OmpA precursor  45.63 
 
 
174 aa  101  6e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0204489  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1278  OmpA domain-containing protein  45.74 
 
 
166 aa  100  7e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0630955  normal  0.378402 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1416  OmpA/MotB  45.74 
 
 
167 aa  100  7e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0389621  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2593  peptidoglycan-associated lipoprotein  47 
 
 
176 aa  101  7e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.00000000155055  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1250  peptidoglycan-associated outer membrane lipoprotein  46.15 
 
 
169 aa  100  1e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000441417  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4195  peptidoglycan-associated lipoprotein  44.96 
 
 
166 aa  100  1e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.678066  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2085  peptidoglycan-associated lipoprotein  44.23 
 
 
178 aa  100  1e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000014342  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3992  peptidoglycan-associated lipoprotein  44.96 
 
 
165 aa  100  1e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.603171  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3086  peptidoglycan-associated outer membrane lipoprotein  46.15 
 
 
169 aa  100  1e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00000103923  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1239  peptidoglycan-associated outer membrane lipoprotein  34.68 
 
 
173 aa  100  1e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000216334  normal  0.113587 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1223  peptidoglycan-associated lipoprotein OprL  44.96 
 
 
166 aa  99.8  2e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3971  peptidoglycan-associated lipoprotein  44.96 
 
 
166 aa  99.8  2e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.17828  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2563  peptidoglycan-associated lipoprotein  34.08 
 
 
179 aa  99.4  2e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000637753  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4401  OmpA/MotB  44.96 
 
 
165 aa  99.8  2e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0950269  normal  0.949799 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1252  peptidoglycan-associated lipoprotein  44.96 
 
 
166 aa  99.8  2e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0470873  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36630  peptidoglycan-associated outer membrane lipoprotein  51.52 
 
 
179 aa  99.8  2e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.668034  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0908  OmpA/MotB family outer membrane protein  36.36 
 
 
172 aa  99  3e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.975322  normal  0.906995 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0363  OmpA/MotB domain-containing protein  40.16 
 
 
167 aa  99  3e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.658698  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2747  peptidoglycan-associated lipoprotein  45.1 
 
 
177 aa  98.6  4e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1608  OmpA domain-containing protein  46.08 
 
 
178 aa  98.6  4e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000000267608  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0751  peptidoglycan-associated lipoprotein  44.76 
 
 
153 aa  98.6  4e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.0000000000145376  normal  0.0872971 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2530  OmpA/MotB domain-containing protein  45.1 
 
 
178 aa  98.2  5e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000768197  normal  0.037684 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2367  OmpA/MotB domain-containing protein  45.1 
 
 
178 aa  98.2  5e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000270429  normal  0.157295 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2439  OmpA/MotB domain-containing protein  45.1 
 
 
178 aa  98.2  5e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000107401  normal  0.228998 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1280  peptidoglycan-associated outer membrane lipoprotein  43.81 
 
 
171 aa  97.4  9e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.000000000137851  hitchhiker  0.0000238774 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2894  peptidoglycan-associated lipoprotein  33.53 
 
 
173 aa  97.1  1e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  1.67676e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0908  peptidoglycan-associated outer membrane lipoprotein  42.31 
 
 
174 aa  96.7  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00670429  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0795  peptidoglycan-associated outer membrane lipoprotein  33.53 
 
 
173 aa  97.1  1e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  2.12965e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0764  peptidoglycan-associated outer membrane lipoprotein  33.53 
 
 
173 aa  97.1  1e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000000105937  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0844  peptidoglycan-associated outer membrane lipoprotein  33.53 
 
 
173 aa  97.1  1e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000018572  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0770  peptidoglycan-associated outer membrane lipoprotein  33.53 
 
 
173 aa  97.1  1e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000156204  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0845  peptidoglycan-associated outer membrane lipoprotein  42.31 
 
 
174 aa  96.7  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00372041  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2914  peptidoglycan-associated outer membrane lipoprotein  33.53 
 
 
173 aa  97.1  1e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000121586  normal  0.464909 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>