More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcryo_1908 on replicon NC_007969
Organism: Psychrobacter cryohalolentis K5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007969  Pcryo_1908  transport system permease protein  100 
 
 
368 aa  726    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0955975  normal  0.119635 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0660  transport system permease protein  65.96 
 
 
352 aa  406  1.0000000000000001e-112  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3798  transport system permease protein  54.67 
 
 
320 aa  305  6e-82  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0676  iron compound ABC transporter, permease protein  52.67 
 
 
320 aa  299  4e-80  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0633  iron compound ABC transporter, permease protein  52.67 
 
 
320 aa  299  4e-80  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4397  transport system permease protein  45.42 
 
 
325 aa  284  1.0000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.533217 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3786  transport system permease protein  49.33 
 
 
335 aa  276  3e-73  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34410  ABC-type enterochelin transport system, permease component  43.84 
 
 
336 aa  276  4e-73  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2367  transport system permease protein  46.34 
 
 
346 aa  272  9e-72  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.711313  normal  0.0413639 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4144  iron chelate ABC transporter permease  46.86 
 
 
319 aa  271  1e-71  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0880665  normal  0.0124759 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0070  transport system permease protein  46.86 
 
 
319 aa  271  1e-71  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0020  transport system permease protein  48.11 
 
 
331 aa  271  1e-71  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4092  iron chelate ABC transporter, permease protein  46.86 
 
 
319 aa  271  1e-71  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.664807  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2626  transport system permease protein  47.65 
 
 
325 aa  267  2.9999999999999995e-70  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.404652  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0299  transport system permease protein  45.69 
 
 
318 aa  258  1e-67  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04590  ABC-type enterochelin transport system, permease component  42.31 
 
 
339 aa  256  5e-67  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.279632  normal  0.137174 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3220  ABC ferric siderophore transporter, inner membrane subunit  48.1 
 
 
315 aa  256  5e-67  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.436019  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1112  iron chelate ABC transporter, permease protein  47.01 
 
 
318 aa  256  7e-67  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2036  transport system permease protein  47.28 
 
 
319 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1764  transport system permease protein  51.1 
 
 
319 aa  252  8.000000000000001e-66  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.218639  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1394  transport system permease protein  45.86 
 
 
344 aa  252  9.000000000000001e-66  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0453205  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30530  ABC-type enterochelin transport system, permease component  44.29 
 
 
336 aa  249  5e-65  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1006  transport system permease protein  42.76 
 
 
349 aa  248  2e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16590  ABC-type enterochelin transport system, permease component  37.6 
 
 
352 aa  248  2e-64  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1541  enterochelin ABC transporter, permease protein  40.7 
 
 
322 aa  244  1.9999999999999999e-63  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.567393  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3959  transport system permease protein  47.06 
 
 
315 aa  243  3e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2403  transport system permease protein  47.32 
 
 
328 aa  242  9e-63  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0598875  hitchhiker  0.0045509 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1351  enterochelin ABC transporter, permease protein  40 
 
 
322 aa  241  1e-62  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0731  transport system permease protein  39.87 
 
 
320 aa  237  3e-61  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000021523  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5027  transport system permease protein  46.01 
 
 
344 aa  236  4e-61  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.503728  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4265  ABC-type multidrug transport system ATPase component-like protein  48.64 
 
 
274 aa  236  5.0000000000000005e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2662  transport system permease protein  41.76 
 
 
336 aa  231  1e-59  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2915  transport system permease protein  37.86 
 
 
337 aa  231  2e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0212375  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4794  iron compound ABC transporter, permease  39.78 
 
 
338 aa  231  2e-59  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000637239  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4814  iron compound ABC transporter, permease  39.78 
 
 
338 aa  230  2e-59  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.216332  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5233  iron compound ABC transporter, permease protein  38.28 
 
 
338 aa  231  2e-59  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.727492  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0008  iron compound ABC transporter, permease protein  40.29 
 
 
282 aa  230  2e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0400  iron compound ABC transporter, permease protein  41.48 
 
 
324 aa  229  7e-59  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4917  transport system permease protein  37.27 
 
 
338 aa  228  1e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.966018  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1629  transport system permease protein  39.67 
 
 
313 aa  227  2e-58  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.287852  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0774  transport system permease protein  39.06 
 
 
323 aa  227  2e-58  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.848187  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1000  vibriobactin and enterobactin ABC transporter, permease protein  39.22 
 
 
312 aa  227  2e-58  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000321439  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5196  iron compound ABC transporter, permease protein  40.07 
 
 
280 aa  228  2e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0757  transport system permease protein  39.06 
 
 
323 aa  227  2e-58  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5225  iron compound ABC transporter, permease protein  39.63 
 
 
338 aa  226  5.0000000000000005e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4952  iron compound ABC transporter permease  39.26 
 
 
338 aa  225  9e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5329  iron compound ABC transporter permease protein  39.26 
 
 
334 aa  224  1e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0318732  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5246  iron compound ABC transporter, permease protein  39.78 
 
 
280 aa  224  2e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000331  iron(III) ABC transporter permease protein  39.15 
 
 
289 aa  223  4.9999999999999996e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000000524649  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06134  ABC-type enterochelin transport system permease  38.13 
 
 
311 aa  221  1.9999999999999999e-56  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25340  ABC-type enterochelin transport system, permease component  40 
 
 
332 aa  220  3.9999999999999997e-56  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2594  ferric siderophore ABC transporter, permease protein  37.71 
 
 
313 aa  215  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0873282  normal  0.0594882 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0635  transport system permease protein  36.71 
 
 
320 aa  213  4.9999999999999996e-54  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000008766  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3669  transport system permease protein  38.49 
 
 
313 aa  210  3e-53  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3703  transport system permease protein  42.41 
 
 
325 aa  210  3e-53  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.162159  normal  0.98704 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1010  iron compound ABC transporter, permease protein  34.82 
 
 
320 aa  208  1e-52  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0653713  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3470  transport system permease protein  38.49 
 
 
313 aa  207  3e-52  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0100224 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2664  transport system permease protein  38.03 
 
 
322 aa  206  5e-52  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3343  transport system permease protein  38.11 
 
 
313 aa  205  1e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.199124  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1931  transport system permease protein  37.5 
 
 
321 aa  197  2.0000000000000003e-49  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.109589 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02108  hypothetical protein  36.6 
 
 
314 aa  197  2.0000000000000003e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0359  transport system permease protein  35.87 
 
 
278 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00496311  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1028  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  34.31 
 
 
317 aa  181  1e-44  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.000116719  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2408  transport system permease protein  27.54 
 
 
335 aa  126  5e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00436362  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5063  ferrichrome ABC transporter, permease  28.86 
 
 
351 aa  126  7e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5080  ferrichrome transport system, permease  28.86 
 
 
351 aa  126  7e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.118042  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5475  iron compound ABC transporter, permease protein  28.86 
 
 
351 aa  126  7e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5512  iron compound ABC transporter, permease protein  28.57 
 
 
351 aa  125  1e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5176  transport system permease protein  28.57 
 
 
351 aa  124  2e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5445  iron compound ABC transporter, permease protein  28.29 
 
 
351 aa  123  4e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5561  iron compound ABC transporter, permease protein  28.29 
 
 
351 aa  124  4e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3786  iron compound ABC transporter, permease protein  26.73 
 
 
335 aa  123  6e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.223523  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5506  iron compound ABC transporter, permease protein  28 
 
 
351 aa  123  6e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1104  iron-hydroxamate transporter permease subunit  29.3 
 
 
694 aa  122  8e-27  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3770  iron compound ABC transporter, permease protein  26.73 
 
 
335 aa  122  9e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3494  iron(III) dicitrate transport system permease  26.73 
 
 
335 aa  122  9e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3482  iron(III) dicitrate transport system, permease  26.73 
 
 
335 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.155404  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3748  iron compound ABC transporter, permease protein  26.73 
 
 
335 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000332198 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3904  transport system permease protein  27.49 
 
 
350 aa  120  3e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0256  transport system permease protein  27.33 
 
 
329 aa  118  1.9999999999999998e-25  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000493486  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3582  iron compound ABC transporter permease  26.07 
 
 
335 aa  115  8.999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3866  iron compound ABC transporter permease protein  26.07 
 
 
335 aa  115  8.999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3505  transport system permease protein  26.4 
 
 
335 aa  114  3e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3836  iron compound ABC transporter, permease protein  26.07 
 
 
335 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1871  iron(III) dicitrate transport system permease protein  29.71 
 
 
356 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.71238  normal  0.187048 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1463  iron compound ABC transporter, permease protein  26.07 
 
 
335 aa  113  5e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000336086 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0186  transport system permease protein  27.56 
 
 
362 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.129161  normal  0.828954 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3271  transport system permease protein  29.87 
 
 
370 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00536194 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3566  transport system permease protein  30.55 
 
 
354 aa  110  3e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2330  transport system permease protein  31.12 
 
 
370 aa  110  3e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.970298  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0329  transport system permease protein  28.22 
 
 
336 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00182989  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4371  transport system permease protein  31.16 
 
 
358 aa  110  5e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0808  putative ferrichrome ABC transporter, permease protein FhuB  28.1 
 
 
337 aa  109  6e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0795  iron compound ABC transporter, permease protein  27.45 
 
 
337 aa  109  6e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0863815  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3036  transport system permease protein  28.03 
 
 
346 aa  109  7.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0247  transport system permease protein  29.72 
 
 
359 aa  109  7.000000000000001e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0151644  normal  0.610007 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0671  cell wall anchor domain-containing protein  28.06 
 
 
334 aa  109  9.000000000000001e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0686  cell wall anchor domain-containing protein  28.06 
 
 
334 aa  109  9.000000000000001e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3085  transport system permease protein  27.71 
 
 
346 aa  108  1e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.543898  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0250  transport system permease protein  29.74 
 
 
340 aa  108  1e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>