More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcryo_0421 on replicon NC_007969
Organism: Psychrobacter cryohalolentis K5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007969  Pcryo_0421  beta-lactamase-like  100 
 
 
450 aa  932    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2729  hydrolase  41.23 
 
 
456 aa  332  1e-89  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.252968  decreased coverage  0.0000538772 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2326  beta-lactamase domain-containing protein  40.22 
 
 
467 aa  320  3.9999999999999996e-86  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0688  beta-lactamase domain-containing protein  39.07 
 
 
450 aa  298  1e-79  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.715713  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1892  beta-lactamase domain protein  38.82 
 
 
453 aa  285  2.0000000000000002e-75  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0875078  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2309  metallo-beta-lactamase family protein  35.51 
 
 
472 aa  259  6e-68  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0047  beta-lactamase domain protein  33.9 
 
 
466 aa  254  3e-66  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2491  beta-lactamase-like  36.38 
 
 
455 aa  250  4e-65  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2631  Rhodanese domain protein  34.32 
 
 
480 aa  249  8e-65  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1354  metallo-beta-lactamase superfamily protein  33.19 
 
 
472 aa  245  9.999999999999999e-64  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.47654  normal  0.245215 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1183  beta-lactamase domain protein  33.54 
 
 
476 aa  244  1.9999999999999999e-63  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0291229  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2913  beta-lactamase domain protein  33.12 
 
 
469 aa  239  1e-61  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6177  beta-lactamase domain protein  35.45 
 
 
470 aa  237  3e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.670762  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2849  beta-lactamase domain-containing protein  35.16 
 
 
480 aa  237  3e-61  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1167  beta-lactamase domain protein  35.21 
 
 
470 aa  236  5.0000000000000005e-61  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.705193  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0543  beta-lactamase domain protein  33.12 
 
 
471 aa  228  2e-58  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000327684 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5172  beta-lactamase domain protein  33.33 
 
 
466 aa  226  5.0000000000000005e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2723  beta-lactamase domain protein  34.39 
 
 
476 aa  223  6e-57  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00124827  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0946  beta-lactamase domain protein  33.99 
 
 
467 aa  223  6e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6932  beta-lactamase domain protein  34.27 
 
 
470 aa  222  9e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3119  beta-lactamase domain protein  33.26 
 
 
463 aa  221  3e-56  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3085  rhodanese-like protein  32.54 
 
 
459 aa  216  7e-55  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5594  beta-lactamase domain protein  33.84 
 
 
470 aa  212  1e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00681465  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1571  metallo-beta-lactamase superfamily protein  33.41 
 
 
471 aa  210  3e-53  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1643  beta-lactamase domain-containing protein  32.66 
 
 
464 aa  210  4e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0383  beta-lactamase domain protein  33.19 
 
 
471 aa  209  1e-52  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4881  beta-lactamase domain-containing protein  30.37 
 
 
471 aa  207  2e-52  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.897195  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06430  metallo-beta-lactamase superfamily protein  31.98 
 
 
471 aa  202  9.999999999999999e-51  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1619  beta-lactamase-like protein  31.7 
 
 
479 aa  198  1.0000000000000001e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.00000199695  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4023  beta-lactamase domain-containing protein  31.56 
 
 
459 aa  198  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.139103  normal  0.561085 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1215  beta-lactamase domain-containing protein  31.42 
 
 
460 aa  198  2.0000000000000003e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0173274 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1830  beta-lactamase domain-containing protein  31.56 
 
 
459 aa  198  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.772754  normal  0.208991 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3176  beta-lactamase domain protein  31.49 
 
 
461 aa  197  3e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00491395  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2319  hydroxyacylglutathione hydrolase  29.47 
 
 
478 aa  197  4.0000000000000005e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.001105  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2552  metallo-beta-lactamase/rhodanese-like domain protein  29.47 
 
 
478 aa  196  1e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.08286e-25 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2277  hydroxyacylglutathione hydrolase  29.47 
 
 
478 aa  194  2e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.95304  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3523  hydroxyacylglutathione hydrolase  28.75 
 
 
478 aa  194  2e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5751  beta-lactamase domain-containing protein  31.26 
 
 
459 aa  194  2e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.469011  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2429  beta-lactamase domain protein  32.46 
 
 
464 aa  194  3e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00447087  normal  0.135271 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2361  metallo-beta-lactamase/rhodanese-like domain-containing protein  29.05 
 
 
484 aa  193  6e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0105565  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2538  metallo-beta-lactamase/rhodanese-like domain-containing protein  29.05 
 
 
484 aa  193  6e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.343645  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0208  beta-lactamase domain protein  31.71 
 
 
470 aa  193  7e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2338  beta-lactamase domain-containing protein  28.48 
 
 
478 aa  191  2e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.415527  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0985  beta-lactamase domain-containing protein  30.97 
 
 
459 aa  191  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1826  beta-lactamase-like protein  32.81 
 
 
457 aa  190  4e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34990  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  32.58 
 
 
453 aa  189  9e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.848513  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1732  hydroxyacylglutathione hydrolase  28.69 
 
 
478 aa  189  1e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00322507 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1707  Rhodanese domain protein  31.2 
 
 
472 aa  187  2e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.140865  normal  0.999922 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2578  beta-lactamase domain protein  33.85 
 
 
471 aa  188  2e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0010585  decreased coverage  0.0000461867 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21680  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  30.57 
 
 
470 aa  186  6e-46  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0980  beta-lactamase domain-containing protein  30.84 
 
 
455 aa  186  8e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28130  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  32.12 
 
 
502 aa  185  1.0000000000000001e-45  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5691  beta-lactamase domain-containing protein  29.84 
 
 
459 aa  183  5.0000000000000004e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5312  beta-lactamase-like protein  29.84 
 
 
459 aa  183  5.0000000000000004e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3839  beta-lactamase domain-containing protein  31.8 
 
 
469 aa  183  5.0000000000000004e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0513  beta-lactamase domain-containing protein  29.3 
 
 
617 aa  183  5.0000000000000004e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5401  beta-lactamase domain-containing protein  29.84 
 
 
459 aa  183  5.0000000000000004e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.854326  normal  0.319128 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2937  beta-lactamase domain-containing protein  32.36 
 
 
452 aa  183  6e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.142956  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0359  beta-lactamase domain protein  32.65 
 
 
476 aa  182  1e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1960  beta-lactamase domain-containing protein  34.02 
 
 
478 aa  181  2e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0558054  normal  0.587362 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5378  beta-lactamase domain protein  32.29 
 
 
462 aa  180  4e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.120982  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2892  beta-lactamase domain-containing protein  33.94 
 
 
452 aa  180  4e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.193457  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21300  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  30.89 
 
 
456 aa  179  5.999999999999999e-44  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.617308  hitchhiker  0.0075618 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2606  beta-lactamase domain protein  29.65 
 
 
444 aa  176  7e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0866757 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0074  beta-lactamase domain-containing protein  29.89 
 
 
444 aa  175  1.9999999999999998e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0076  beta-lactamase domain-containing protein  29.89 
 
 
444 aa  175  1.9999999999999998e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4014  beta-lactamase-like protein  30.53 
 
 
453 aa  174  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4088  beta-lactamase domain-containing protein  30.53 
 
 
453 aa  174  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4244  beta-lactamase domain-containing protein  30.53 
 
 
453 aa  174  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.166116 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5835  beta-lactamase domain-containing protein  30.18 
 
 
450 aa  170  6e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.33754 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1900  metallo-beta-lactamase family protein  30.94 
 
 
446 aa  169  1e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.309949  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0267  beta-lactamase domain protein  31.24 
 
 
484 aa  166  6.9999999999999995e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.30409  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4226  beta-lactamase domain protein  28.26 
 
 
480 aa  165  1.0000000000000001e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2038  beta-lactamase domain protein  30.41 
 
 
451 aa  164  3e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0124329  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2681  beta-lactamase-like  30.15 
 
 
464 aa  161  2e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2435  metallo-beta-lactamase family protein  27.97 
 
 
442 aa  160  5e-38  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11813  Rhodanese-like protein  27.93 
 
 
442 aa  160  6e-38  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.154405  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0108  beta-lactamase domain-containing protein  31.29 
 
 
454 aa  160  6e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12628  hypothetical protein  28.57 
 
 
448 aa  158  2e-37  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.520905  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2225  beta-lactamase domain-containing protein  31.97 
 
 
470 aa  155  1e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.4809 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3632  beta-lactamase domain-containing protein  31.65 
 
 
488 aa  155  2e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.182786  normal  0.236484 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2086  beta-lactamase domain-containing protein  31.84 
 
 
470 aa  154  2.9999999999999998e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.472502  normal  0.029766 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3957  beta-lactamase domain-containing protein  30.38 
 
 
489 aa  152  1e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.381216 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0757  beta-lactamase domain protein  40.91 
 
 
244 aa  146  8.000000000000001e-34  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.717339  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3361  beta-lactamase domain-containing protein  29.37 
 
 
466 aa  134  3.9999999999999996e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.655276  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1014  beta-lactamase domain protein  27.89 
 
 
454 aa  125  2e-27  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.532589  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2790  beta-lactamase domain protein  33.47 
 
 
246 aa  122  1.9999999999999998e-26  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0093  Beta-lactamase-like  37.12 
 
 
244 aa  120  3e-26  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000294531  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2738  putative metallo-beta-lactamase family protein  36.02 
 
 
243 aa  120  4.9999999999999996e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.292941  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4842  beta-lactamase-like  33 
 
 
346 aa  119  1.9999999999999998e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3935  beta-lactamase-like  35.05 
 
 
251 aa  117  6e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.361961 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3258  beta-lactamase domain-containing protein  34.91 
 
 
243 aa  116  8.999999999999998e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0866294  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3773  beta-lactamase-like protein  32.12 
 
 
354 aa  113  7.000000000000001e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.957871  normal 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3467  beta-lactamase domain-containing protein  36.19 
 
 
243 aa  113  9e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.919915  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0381  metallo-beta-lactamase family protein  32.57 
 
 
246 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1570  metallo-beta-lactamase family protein  32.57 
 
 
246 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3284  beta-lactamase domain-containing protein  33.6 
 
 
369 aa  112  1.0000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1223  metallo-beta-lactamase family protein  32.57 
 
 
246 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0424  metallo-beta-lactamase family protein  32.57 
 
 
246 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1757  metallo-beta-lactamase family protein  32.57 
 
 
246 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>