34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_2723 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_2723  hypothetical protein  100 
 
 		 197 aa  393  1e-108  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0488  hypothetical protein  46.56 
 
 		 190 aa  111  7.000000000000001e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0261  hypothetical protein  33.99 
 
 		 202 aa  104  9e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00149007 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1616  hypothetical protein  39.57 
 
 		 188 aa  102  5e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0165903  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1412  hypothetical protein  36.04 
 
 		 203 aa  98.6  5e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0927892  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0548  hypothetical protein  34.66 
 
 		 195 aa  97.1  1e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.203729  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1491  Lipoprotein LpqB, GerMN domain protein  40 
 
 		 192 aa  96.7  2e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15500  hypothetical protein  34.32 
 
 		 173 aa  96.7  2e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.308262  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0516  spore germination protein-like  40.88 
 
 		 200 aa  95.9  3e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0346133  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2833  hypothetical protein  33.33 
 
 		 197 aa  94.4  9e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.458262  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2922  hypothetical protein  33.73 
 
 		 197 aa  94.4  9e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0276  hypothetical protein  34.3 
 
 		 187 aa  94.4  1e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0748556  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2543  spore germination protein-like protein  30.5 
 
 		 465 aa  84  0.000000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000191345  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1084  cytochrome b5  40.74 
 
 		 169 aa  80.9  0.00000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.194541  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2736  hypothetical protein  32.92 
 
 		 165 aa  73.9  0.000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000414813  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0362  cytochrome b5  35.82 
 
 		 245 aa  70.9  0.00000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.063504  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2614  putative lipoprotein  33.59 
 
 		 184 aa  66.6  0.0000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1942  hypothetical protein  28.96 
 
 		 299 aa  65.1  0.0000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.141052  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2508  hypothetical protein  44.44 
 
 		 197 aa  62.8  0.000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.193081 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1229  spore germination protein-like protein  30.83 
 
 		 205 aa  61.6  0.000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0403693  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3344  PT repeat-containing protein  33.93 
 
 		 514 aa  49.3  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2479  spore germination protein-like protein  29.66 
 
 		 190 aa  48.9  0.00004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0441  hypothetical protein  24.38 
 
 		 484 aa  48.9  0.00005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000131637  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0447  putative germination protein GerM  27.86 
 
 		 195 aa  48.1  0.00008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1052  spore germination protein-like protein  35.63 
 
 		 288 aa  47.8  0.0001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1956  hypothetical protein  27.94 
 
 		 309 aa  47  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.173181  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4218  spore germination protein-like protein  26.57 
 
 		 195 aa  46.6  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000199131  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4407  hypothetical protein  29.37 
 
 		 239 aa  46.6  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1954  hypothetical protein  29.85 
 
 		 335 aa  45.4  0.0006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.508711  normal  0.643926 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07940  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  32.1 
 
 		 383 aa  45.1  0.0007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1351  hypothetical protein  28.24 
 
 		 397 aa  44.3  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.033419  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0187  hypothetical protein  37.21 
 
 		 390 aa  43.9  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00032944  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1550  hypothetical protein  30.71 
 
 		 177 aa  43.5  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.403206  hitchhiker  0.00759922 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2506  spore germination protein-like  32.99 
 
 		 328 aa  41.2  0.009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0523043 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>