190 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_1324 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009073  Pcal_1324  xanthine dehydrogenase accessory factor  100 
 
 
255 aa  492  9.999999999999999e-139  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.996684 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0253  xanthine dehydrogenase accessory factor  56.64 
 
 
260 aa  269  4e-71  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0909345  normal  0.275043 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0679  protein of unknown function DUF182  40.08 
 
 
267 aa  174  9.999999999999999e-43  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.350419  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2647  hypothetical protein  33.71 
 
 
281 aa  70.9  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.645074  normal  0.670591 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2247  conserved hypothetical protein  46.99 
 
 
191 aa  70.1  0.00000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2211  protein of unknown function DUF182  28.14 
 
 
265 aa  69.7  0.00000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000212868  normal  0.0832425 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0864  protein of unknown function DUF182  32.52 
 
 
386 aa  68.9  0.00000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0137317  normal  0.0522719 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1387  xanthine and Co dehydrogenase maturation factor  38.22 
 
 
191 aa  68.9  0.00000000008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.0079429  hitchhiker  0.00000598776 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2076  protein of unknown function DUF182  35.16 
 
 
381 aa  68.6  0.00000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.46378  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1385  hypothetical protein  31.53 
 
 
366 aa  67.4  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0830102 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1880  protein of unknown function DUF182  32.98 
 
 
370 aa  67.4  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0633  hypothetical protein  32.5 
 
 
397 aa  66.6  0.0000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1569  hypothetical protein  34.5 
 
 
271 aa  66.2  0.0000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0106179  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1256  xanthine and Co dehydrogenase maturation factor  35.91 
 
 
248 aa  65.9  0.0000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1528  xanthine dehydrogenase  32.65 
 
 
365 aa  65.5  0.0000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.971858  normal  0.542398 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0501  xanthine and Co dehydrogenase maturation factor  35.88 
 
 
244 aa  65.5  0.0000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1631  hypothetical protein  31.32 
 
 
357 aa  64.7  0.000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.494051  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1376  hypothetical protein  31.32 
 
 
354 aa  64.3  0.000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.403864 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13100  xanthine and CO dehydrogenases maturation factor, XdhC/CoxF family  31.08 
 
 
374 aa  64.3  0.000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4952  protein of unknown function DUF182  34.52 
 
 
373 aa  63.5  0.000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1696  protein of unknown function DUF182  27.22 
 
 
277 aa  63.5  0.000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4205  alanine dehydrogenase  26.83 
 
 
379 aa  63.5  0.000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.289956  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0103  Alanine dehydrogenase  30.18 
 
 
385 aa  63.2  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.529042 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2793  protein of unknown function DUF182  34.34 
 
 
338 aa  63.2  0.000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000291153 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0635  protein of unknown function DUF182  33.33 
 
 
362 aa  62.8  0.000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0965219 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2033  hypothetical protein  31.77 
 
 
390 aa  62.4  0.000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0106371  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3138  protein of unknown function DUF182  30.86 
 
 
398 aa  62.4  0.000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.238524  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1316  hypothetical protein  29.03 
 
 
346 aa  62.4  0.000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.150193  hitchhiker  0.000189083 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2186  protein of unknown function DUF182  27.44 
 
 
295 aa  61.2  0.00000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0709  alanine dehydrogenase  29.12 
 
 
332 aa  61.6  0.00000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.116894 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2392  hypothetical protein  32.2 
 
 
425 aa  61.6  0.00000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.097794  normal  0.0809801 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1555  protein of unknown function DUF182  31.7 
 
 
341 aa  61.6  0.00000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.324004  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02708  conserved protein with NAD(P)-binding Rossman fold  26.9 
 
 
541 aa  60.5  0.00000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0817  selenium-dependent molybdenum hydroxylase system protein, YqeB family  26.9 
 
 
541 aa  60.5  0.00000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2978  protein of unknown function DUF182  30.93 
 
 
385 aa  60.5  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000478076  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3200  putative xanthine dehydrogenase accessory factor  26.9 
 
 
541 aa  60.8  0.00000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0865  hypothetical protein  29.41 
 
 
375 aa  61.2  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000040151  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3008  putative xanthine dehydrogenase accessory factor  26.9 
 
 
541 aa  60.5  0.00000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4165  putative xanthine dehydrogenase accessory factor  26.9 
 
 
541 aa  60.8  0.00000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0833  selenium-dependent molybdenum hydroxylase system protein  26.9 
 
 
541 aa  60.5  0.00000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3035  putative xanthine dehydrogenase accessory factor  26.9 
 
 
541 aa  60.5  0.00000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02670  hypothetical protein  26.9 
 
 
541 aa  60.5  0.00000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1485  hypothetical protein  30.26 
 
 
374 aa  60.5  0.00000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.682746  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1138  xanthine and Co dehydrogenase maturation factor  27.5 
 
 
384 aa  60.1  0.00000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.764413  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2006  sulfurylase large subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis  29.09 
 
 
249 aa  59.7  0.00000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.88376  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2038  hypothetical protein  34.69 
 
 
301 aa  59.7  0.00000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0608424  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2236  protein of unknown function DUF182  30.43 
 
 
356 aa  59.7  0.00000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.0000000550671  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0231  hypothetical protein  33.92 
 
 
299 aa  59.7  0.00000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2701  Xanthine dehydrogenase  31.72 
 
 
372 aa  59.3  0.00000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.752366 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3433  protein of unknown function DUF182  27.88 
 
 
354 aa  58.9  0.00000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6196  hypothetical protein  34.13 
 
 
389 aa  58.9  0.00000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0286136 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0488  hypothetical protein  32.22 
 
 
386 aa  58.9  0.00000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0499  hypothetical protein  32.22 
 
 
386 aa  58.9  0.00000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.730315 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0477  hypothetical protein  32.22 
 
 
386 aa  58.9  0.00000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2845  xanthine dehydrogenase accessory factor, putative  31.5 
 
 
368 aa  58.5  0.00000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0937322  normal  0.0201878 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4732  protein of unknown function DUF182  43.68 
 
 
483 aa  58.2  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0200  hypothetical protein  31.52 
 
 
369 aa  58.5  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0521133  normal  0.0102473 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5182  hypothetical protein  33.88 
 
 
373 aa  58.2  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.409064 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2770  protein of unknown function DUF182  31.56 
 
 
345 aa  58.2  0.0000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4312  protein of unknown function DUF182  43.84 
 
 
372 aa  57.4  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.252346  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0125  hypothetical protein  35.92 
 
 
386 aa  57.8  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.1278  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1688  protein of unknown function DUF182  31.16 
 
 
372 aa  57.8  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.121365  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0381  protein of unknown function DUF182  24.11 
 
 
367 aa  57.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1734  hypothetical protein  29.17 
 
 
282 aa  57.8  0.0000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0315  xanthine dehydrogenase accessory factor  31.37 
 
 
269 aa  57.4  0.0000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10381  hypothetical protein  29.48 
 
 
380 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000724106  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1381  protein of unknown function DUF182  26.61 
 
 
263 aa  57  0.0000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10377  hypothetical protein  40.4 
 
 
251 aa  56.6  0.0000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000697611  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3546  xanthine dehydrogenase accessory factor  30.32 
 
 
353 aa  56.6  0.0000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.692521  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0385  hypothetical protein  33.92 
 
 
370 aa  56.6  0.0000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3212  hypothetical protein  31.53 
 
 
369 aa  56.6  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.420632  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1574  hypothetical protein  33.84 
 
 
363 aa  56.6  0.0000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.187445  normal  0.510338 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2200  hypothetical protein  29.61 
 
 
382 aa  56.6  0.0000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00707411 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3868  protein of unknown function DUF182  32.8 
 
 
389 aa  56.6  0.0000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1581  hypothetical protein  30.52 
 
 
376 aa  56.2  0.0000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1005  hypothetical protein  32.03 
 
 
351 aa  56.2  0.0000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4137  Xanthine dehydrogenase  28.33 
 
 
372 aa  55.5  0.0000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00996475 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2657  xanthine dehydrogenase accessory factor XdhC, putative  31.48 
 
 
322 aa  55.5  0.0000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.158327  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1815  hypothetical protein  31.14 
 
 
344 aa  55.5  0.0000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0674  xanthine and Co dehydrogenase maturation factor  25.95 
 
 
186 aa  55.5  0.0000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2772  Alanine dehydrogenase  45.33 
 
 
395 aa  55.1  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5288  protein of unknown function DUF182  37.5 
 
 
372 aa  55.1  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1752  carbon monoxide dehydrogenase, coxF accessory protein  33.52 
 
 
271 aa  54.7  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.348042 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5191  protein of unknown function DUF182  28.31 
 
 
400 aa  55.1  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.337929 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2391  hypothetical protein  31.48 
 
 
322 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0816384  normal  0.376452 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4321  hypothetical protein  31.11 
 
 
233 aa  53.9  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2411  protein of unknown function DUF182  30.52 
 
 
307 aa  54.3  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0029  hypothetical protein  28.48 
 
 
278 aa  54.3  0.000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.180579  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2839  xanthine and Co dehydrogenase maturation factor  31.33 
 
 
240 aa  54.3  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0492  hypothetical protein  33.09 
 
 
256 aa  53.5  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.690138  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0503  hypothetical protein  33.09 
 
 
256 aa  53.5  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.512548 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0481  hypothetical protein  33.09 
 
 
256 aa  53.5  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5194  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  30.06 
 
 
364 aa  52.8  0.000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1468  protein of unknown function DUF182  23.78 
 
 
345 aa  52.4  0.000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1215  protein of unknown function DUF182  31.69 
 
 
270 aa  52  0.000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.516897  normal  0.921927 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0531  hypothetical protein  31.58 
 
 
323 aa  52.4  0.000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.916734  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35530  hypothetical protein  30.59 
 
 
326 aa  51.6  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1787  xanthine dehydrogenase accessory factor  29.67 
 
 
233 aa  51.2  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.112917  normal  0.243533 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1293  sulfurylase large subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis  30.1 
 
 
235 aa  51.6  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.126009  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0241  putative xanthine dehydrogenase accessory factor  29.65 
 
 
341 aa  51.2  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>