More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_3957 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_3957  glutathione S-transferase-like  100 
 
 		 221 aa  459  9.999999999999999e-129  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2947  glutathione S-transferase domain-containing protein  60.81 
 
 		 222 aa  284  5.999999999999999e-76  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.282557  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00195  Glutathione S-transferase-like protein  57.66 
 
 		 222 aa  273  1.0000000000000001e-72  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3680  glutathione S-transferase domain-containing protein  54.79 
 
 		 233 aa  249  2e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.382886  normal  0.017552 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4517  glutathione S-transferase-like  54.79 
 
 		 233 aa  249  2e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.370294  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3847  glutathione S-transferase domain-containing protein  54.79 
 
 		 233 aa  249  2e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.948042  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2249  glutathione S-transferase-like protein  53.88 
 
 		 222 aa  248  5e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0626984 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0273  putative glutathione S-transferase  53.64 
 
 		 225 aa  248  6e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1107  glutathione S-transferase  52.97 
 
 		 223 aa  247  1e-64  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.300035  normal  0.477541 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5570  glutathione S-transferase domain-containing protein  52.97 
 
 		 222 aa  244  9e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.509468  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7159  Glutathione S-transferase domain  53.18 
 
 		 225 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.218915  normal  0.479865 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3744  glutathione S-transferase domain-containing protein  52.97 
 
 		 222 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.66674  normal  0.0935446 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4634  Glutathione transferase  53.64 
 
 		 224 aa  241  5e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4290  glutathione S-transferase domain-containing protein  52.04 
 
 		 220 aa  239  2.9999999999999997e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.380653 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4433  glutathione S-transferase domain-containing protein  51.6 
 
 		 222 aa  235  3e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0724  glutathione S-transferase-like  52.73 
 
 		 222 aa  230  1e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.4337 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00398  glutathione S-transferase  48.44 
 
 		 232 aa  229  3e-59  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.995047  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1800  glutathione S-transferase domain-containing protein  52.47 
 
 		 232 aa  228  5e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0019  glutathione S-transferase-like  51.6 
 
 		 222 aa  228  6e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0261  glutathione S-transferase domain-containing protein  55.86 
 
 		 221 aa  227  8e-59  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0252994  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1922  Glutathione S-transferase domain protein  52.02 
 
 		 232 aa  226  2e-58  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3813  glutathione S-transferase domain-containing protein  55.71 
 
 		 221 aa  225  3e-58  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.340281  normal  0.596227 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3675  glutathione S-transferase-like protein  46.61 
 
 		 220 aa  222  4e-57  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2196  glutathione S-transferase domain-containing protein  49.32 
 
 		 208 aa  222  4e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.827244 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0021  glutathione S-transferase-like protein  50.91 
 
 		 222 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0024  Glutathione S-transferase domain  49.55 
 
 		 222 aa  218  3.9999999999999997e-56  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4480  glutathione S-transferase domain-containing protein  48.88 
 
 		 229 aa  218  6e-56  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0622605 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1936  Glutathione S-transferase domain protein  47.66 
 
 		 214 aa  217  8.999999999999998e-56  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.247506  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0268  glutathione S-transferase domain-containing protein  49.55 
 
 		 221 aa  217  1e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1665  Glutathione S-transferase domain protein  48.13 
 
 		 214 aa  217  1e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.192716  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1626  Glutathione S-transferase domain  48.88 
 
 		 229 aa  215  4e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.506745  normal  0.230633 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3634  glutathione S-transferase domain-containing protein  47.96 
 
 		 218 aa  212  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.890005  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3927  Glutathione S-transferase domain  47.51 
 
 		 218 aa  211  7e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.253948  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2125  glutathione S-transferase-like protein  45.7 
 
 		 224 aa  211  1e-53  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.850832  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3917  Glutathione S-transferase domain  46.61 
 
 		 218 aa  207  1e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0306349  normal  0.123136 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0318  putative glutathione S-transferase III (GST-III)  48.64 
 
 		 221 aa  205  4e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.894729  normal  0.561156 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1175  glutathione S-transferase  45.7 
 
 		 208 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.275426  normal  0.372199 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1365  glutathione S-transferase  45.7 
 
 		 208 aa  199  3e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.290536  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2631  glutathione S-transferase-like protein  46.58 
 
 		 208 aa  199  3.9999999999999996e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.763244 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2668  glutathione S-transferase-like  46.58 
 
 		 226 aa  198  5e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.111492  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2329  glutathione S-transferase domain-containing protein  48.87 
 
 		 218 aa  197  7.999999999999999e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.435459 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1060  glutathione S-transferase domain-containing protein  44.95 
 
 		 208 aa  197  1.0000000000000001e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.927457 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3116  Glutathione S-transferase protein  42.73 
 
 		 227 aa  184  1.0000000000000001e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.324582  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4662  glutathione S-transferase, N- domain  44.5 
 
 		 222 aa  180  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1722  glutathione S-transferase-like protein  42.86 
 
 		 208 aa  180  2e-44  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4518  glutathione S-transferase, N- domain  44.5 
 
 		 222 aa  179  2.9999999999999997e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4611  glutathione S-transferase, N- domain  44.5 
 
 		 222 aa  179  2.9999999999999997e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.931981  normal  0.250578 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4612  glutathione S-transferase, N- domain  44.5 
 
 		 222 aa  179  2.9999999999999997e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0520156  normal  0.373731 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4526  glutathione S-transferase, N- domain  44.5 
 
 		 222 aa  178  5.999999999999999e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1276  glutathione S-transferase-like  41.01 
 
 		 208 aa  176  2e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.398915  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1722  glutathione S-transferase-like  40.79 
 
 		 222 aa  170  1e-41  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.226504  normal  0.784305 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1542  glutathione S-transferase  41.23 
 
 		 222 aa  168  5e-41  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.172585 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0874  glutathione S-transferase domain-containing protein  40.6 
 
 		 234 aa  166  2.9999999999999998e-40  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000650083 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0510  glutathione S-transferase domain-containing protein  43.89 
 
 		 208 aa  163  2.0000000000000002e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.585126 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05193  glutathione S-transferase III  43.13 
 
 		 205 aa  163  2.0000000000000002e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001312  glutathione S-transferase  41.71 
 
 		 205 aa  162  3e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0806  glutathione S-transferase domain-containing protein  39.73 
 
 		 206 aa  162  3e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0966  Glutathione S-transferase domain protein  39.52 
 
 		 209 aa  158  7e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.262392  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1385  glutathione S-transferase-like protein  38.36 
 
 		 205 aa  157  1e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.742051  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1093  glutathione S-transferase domain-containing protein  38.81 
 
 		 209 aa  156  3e-37  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0269  glutathione S-transferase domain-containing protein  38.36 
 
 		 208 aa  152  2.9999999999999998e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0261  glutathione S-transferase domain-containing protein  38.36 
 
 		 208 aa  152  4e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0269  glutathione S-transferase domain-containing protein  38.36 
 
 		 208 aa  152  4e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_35190  glutathione S-transferase  38.6 
 
 		 245 aa  152  5e-36  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0548873  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0265  Glutathione S-transferase domain protein  38.94 
 
 		 208 aa  151  8.999999999999999e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.850678 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2251  Glutathione transferase  39.15 
 
 		 201 aa  151  1e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3541  glutathione S-transferase  34.7 
 
 		 215 aa  149  2e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.136471  normal  0.509105 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6917  putative glutathione S-transferase  36.99 
 
 		 213 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.522901 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00629  glutathione S-transferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G17010)  36.93 
 
 		 255 aa  147  2.0000000000000003e-34  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0806169  normal  0.869816 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1353  Glutathione S-transferase domain protein  36.49 
 
 		 209 aa  145  3e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.959522  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3593  glutathione S-transferase-like  38.53 
 
 		 221 aa  144  7.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.404871  normal  0.859314 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2474  glutathione S-transferase family protein  36.45 
 
 		 206 aa  137  1e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00158542  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1010  glutathione S-transferase-like  37.44 
 
 		 211 aa  128  8.000000000000001e-29  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2005  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.31 
 
 		 202 aa  114  1.0000000000000001e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0375  glutathione S-transferase domain-containing protein  64.29 
 
 		 121 aa  113  3e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1924  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.18 
 
 		 202 aa  100  2e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.896239 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2200  Glutathione S-transferase domain  29.73 
 
 		 202 aa  100  2e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0508  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.67 
 
 		 213 aa  94.4  1e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.553974 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2222  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.38 
 
 		 207 aa  94.4  1e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.186295 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3264  glutathione S-transferase-like protein  28.17 
 
 		 216 aa  91.7  8e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0652587  normal  0.563491 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_56049  Glutathione S-transferase  28.82 
 
 		 265 aa  89  5e-17  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2200  glutathione S-transferase-like  27.7 
 
 		 216 aa  89  5e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.313039 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0907  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.63 
 
 		 207 aa  88.6  7e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3767  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.91 
 
 		 222 aa  88.6  7e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3640  glutathione S-transferase domain-containing protein  26.27 
 
 		 217 aa  87  2e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.390438 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3513  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.18 
 
 		 207 aa  86.3  3e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.72335  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3181  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.56 
 
 		 207 aa  85.9  5e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2968  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.24 
 
 		 211 aa  85.5  5e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.167267  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0847  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.81 
 
 		 200 aa  85.1  8e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.154484 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3380  glutathione S-transferase-like protein  30.7 
 
 		 201 aa  84.3  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0755  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.94 
 
 		 209 aa  84.7  0.000000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.76216  normal  0.189515 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3463  glutathione S-transferase domain protein  30.23 
 
 		 201 aa  83.6  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0942071  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3183  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.77 
 
 		 209 aa  83.6  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.413955  normal  0.024534 
 
 
-
 
NC_006686  CND00620  glutathione transferase, putative  29.79 
 
 		 249 aa  82.8  0.000000000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.295755  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3561  Glutathione S-transferase domain protein  29.82 
 
 		 210 aa  82.4  0.000000000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.134068  normal  0.24035 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3310  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.73 
 
 		 210 aa  82.4  0.000000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.141117  normal  0.680332 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0681  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.82 
 
 		 210 aa  82.4  0.000000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.052324  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0670  putative glutathione S-transferase (GST)  26.29 
 
 		 218 aa  82  0.000000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.804169  normal  0.0458182 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0783  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.49 
 
 		 209 aa  81.6  0.000000000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.469767 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3752  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.82 
 
 		 210 aa  81.6  0.000000000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0132369  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>