162 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_1777 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009376  Pars_1777  nucleotidyl transferase  100 
 
 		 363 aa  724    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.13003  normal  0.0200486 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0427  nucleotidyl transferase  69.97 
 
 		 363 aa  542  1e-153  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.195694  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1001  nucleotidyl transferase  72.38 
 
 		 363 aa  543  1e-153  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1694  nucleotidyl transferase  68.32 
 
 		 363 aa  520  1e-146  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.00229332  normal  0.012326 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0086  sugar-phosphate nucleotidyl transferase  31.75 
 
 		 377 aa  162  9e-39  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.387197  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0529  hexapaptide repeat-containing transferase  33.43 
 
 		 350 aa  145  1e-33  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1356  Nucleotidyl transferase  29.43 
 
 		 360 aa  144  2e-33  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1604  nucleotidyl transferase  26.03 
 
 		 352 aa  142  9.999999999999999e-33  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0798438  normal  0.128956 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1801  Nucleotidyl transferase  25.13 
 
 		 403 aa  99.4  8e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0230412  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0399  nucleotidyl transferase  24.42 
 
 		 414 aa  97.1  4e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0513  nucleotidyl transferase  23.96 
 
 		 411 aa  94  4e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1583  nucleotidyl transferase  24.74 
 
 		 411 aa  92.8  8e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.605878  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0329  nucleotidyl transferase  23.7 
 
 		 411 aa  91.3  2e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.175272  hitchhiker  0.000673657 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0280  Nucleotidyl transferase  26.89 
 
 		 400 aa  89.7  7e-17  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1083  Nucleotidyl transferase  29.04 
 
 		 402 aa  87  4e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.39401 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1890  nucleotidyl transferase  25 
 
 		 357 aa  87  4e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.661089 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0285  Nucleotidyl transferase  25.59 
 
 		 385 aa  85.5  0.000000000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2874  Nucleotidyl transferase  29.25 
 
 		 402 aa  85.1  0.000000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3048  Nucleotidyl transferase  26.21 
 
 		 393 aa  84  0.000000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.916197  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0642  nucleotidyl transferase  21.15 
 
 		 411 aa  82  0.00000000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.163683  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2020  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  23.19 
 
 		 397 aa  77.4  0.0000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.611525 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0665  glucosamine-1-phosphate N-acetyltransferase / UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase  23.03 
 
 		 374 aa  77.4  0.0000000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0068  nucleotidyl transferase  24.62 
 
 		 404 aa  76.3  0.0000000000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0170821  normal  0.011821 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1202  Nucleotidyl transferase  26.87 
 
 		 393 aa  72  0.00000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1845  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  24.78 
 
 		 349 aa  71.6  0.00000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0548966  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2341  nucleotidyl transferase  22.36 
 
 		 396 aa  69.7  0.00000000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00221584  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2230  nucleotidyl transferase  25.6 
 
 		 383 aa  69.7  0.00000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0505  nucleotidyl transferase  24.29 
 
 		 400 aa  69.7  0.00000000008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2917  Nucleotidyl transferase  25.74 
 
 		 439 aa  68.6  0.0000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.118183  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1293  Nucleotidyl transferase  23.08 
 
 		 361 aa  67  0.0000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.327446  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5109  Nucleotidyl transferase  28.22 
 
 		 393 aa  66.6  0.0000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  decreased coverage  0.000303329  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0313  Nucleotidyl transferase  23.4 
 
 		 384 aa  66.2  0.0000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.414969 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0275  putative acyltransferase  33.97 
 
 		 236 aa  65.5  0.000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1475  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  24.65 
 
 		 353 aa  65.5  0.000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  decreased coverage  0.0000811226  normal  0.134994 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_470  nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase  23.51 
 
 		 400 aa  65.1  0.000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1633  transferase hexapeptide repeat containing protein  33.58 
 
 		 224 aa  63.9  0.000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0991  Nucleotidyl transferase  23.76 
 
 		 397 aa  63.9  0.000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1787  nucleotidyl transferase  24.48 
 
 		 348 aa  63.5  0.000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0529  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  30.51 
 
 		 400 aa  62.8  0.000000009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2065  Nucleotidyl transferase  26.83 
 
 		 393 aa  62.8  0.000000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0901  nucleotidyl transferase  23.28 
 
 		 403 aa  62.4  0.00000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0314  Nucleotidyl transferase  25.23 
 
 		 400 aa  62  0.00000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.42611 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1630  Nucleotidyl transferase  23.15 
 
 		 397 aa  61.2  0.00000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0666  hypothetical protein  22.09 
 
 		 399 aa  61.2  0.00000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2854  nucleotidyl transferase  24.55 
 
 		 388 aa  59.7  0.00000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.233123 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0253  nucleotidyl transferase  25.16 
 
 		 384 aa  59.3  0.00000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2853  nucleotidyl transferase  22.66 
 
 		 401 aa  58.5  0.0000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.218905 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0254  nucleotidyl transferase  26.46 
 
 		 399 aa  58.5  0.0000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1679  nucleotidyl transferase  27.11 
 
 		 374 aa  56.6  0.0000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1784  bifunctional N-acetylglucosamine-1-phosphate uridyltransferase/glucosamine-1-phosphate acetyltransferase  24.46 
 
 		 452 aa  56.2  0.0000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.907512  normal  0.0309291 
 
 
-
 
NC_002936  DET0530  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  26.14 
 
 		 393 aa  54.7  0.000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.911327  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2344  nucleotidyl transferase  22.76 
 
 		 405 aa  54.7  0.000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00861405  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3271  putative UDP-N-acetylglucosamine diphosphorylase  26.49 
 
 		 224 aa  54.7  0.000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000643318  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1310  SMC domain-containing protein  27.33 
 
 		 392 aa  54.7  0.000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2619  nucleotidyl transferase  29.13 
 
 		 387 aa  53.9  0.000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2023  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  24.62 
 
 		 405 aa  53.5  0.000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.562906 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1899  nucleotidyl transferase  29.41 
 
 		 387 aa  53.1  0.000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.399282 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3113  nucleotidyl transferase  24.32 
 
 		 349 aa  52.4  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.409116  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0413  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  32.03 
 
 		 355 aa  51.6  0.00002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0183855  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15980  phosphoglucomutase  22.1 
 
 		 820 aa  52  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_471  nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase  22.82 
 
 		 393 aa  51.2  0.00003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1993  nucleotidyl transferase  29.13 
 
 		 392 aa  51.2  0.00003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.772939  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0506  nucleotidyl transferase  25.66 
 
 		 393 aa  51.2  0.00003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2108  putative UDP-N-acetylglucosamine diphosphorylase  27.14 
 
 		 230 aa  50.4  0.00004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.823728 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1909  bifunctional N-acetylglucosamine-1-phosphate uridyltransferase/glucosamine-1-phosphate acetyltransferase  24.04 
 
 		 453 aa  50.8  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.23479  normal  0.818944 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2168  Nucleotidyl transferase  28 
 
 		 387 aa  50.8  0.00004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2334  nucleotidyl transferase  21.7 
 
 		 828 aa  50.4  0.00004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_74665  Mannose-1-phosphate guanyltransferase (ATP-mannose-1-phosphate guanylyltransferase) (GDP-mannose pyrophosphorylase) (CASRB1)  20.6 
 
 		 362 aa  50.4  0.00005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0126253 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1624  nucleotidyl transferase  22.35 
 
 		 367 aa  50.1  0.00006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.344481  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0628  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  25.66 
 
 		 358 aa  50.1  0.00006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.437993  normal  0.532658 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0233  Nucleotidyl transferase  22.64 
 
 		 712 aa  48.9  0.0001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.779995  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5131  Nucleotidyl transferase  25.33 
 
 		 243 aa  48.9  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.963114 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1725  bifunctional N-acetylglucosamine-1-phosphate uridyltransferase/glucosamine-1-phosphate acetyltransferase  24.03 
 
 		 453 aa  49.3  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.353505  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2464  UDP-3-O-[3-hydroxymyristoyl] glucosamine N-acyltransferase  39.33 
 
 		 373 aa  48.5  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.01352  normal  0.204171 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0894  glucosamine-1-phosphate N-acetyltransferase / UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase  34.88 
 
 		 468 aa  48.5  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.180519  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4080  transferase; LpxA family  27.34 
 
 		 212 aa  48.5  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.796207  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1770  bifunctional N-acetylglucosamine-1-phosphate uridyltransferase/glucosamine-1-phosphate acetyltransferase  24.66 
 
 		 454 aa  47.8  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4120  nucleotidyl transferase  26.09 
 
 		 784 aa  47.8  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4554  bifunctional N-acetylglucosamine-1-phosphate uridyltransferase/glucosamine-1-phosphate acetyltransferase  31.13 
 
 		 452 aa  47.8  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.362258 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2166  Nucleotidyl transferase  21.02 
 
 		 387 aa  47.4  0.0004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4613  Nucleotidyl transferase  33.05 
 
 		 366 aa  47.4  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1040  nucleotidyl transferase  21.32 
 
 		 818 aa  47.4  0.0004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.189081  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2717  hypothetical protein  31.68 
 
 		 457 aa  47.4  0.0004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0384  putative acyltransferase  31.9 
 
 		 146 aa  47.4  0.0004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1488  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  21.8 
 
 		 357 aa  47  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000150762 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1784  bifunctional N-acetylglucosamine-1-phosphate uridyltransferase/glucosamine-1-phosphate acetyltransferase  22.82 
 
 		 452 aa  47  0.0005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0390  putative acyltransferase  31.9 
 
 		 146 aa  47  0.0005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.141633  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2428  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase  23.7 
 
 		 473 aa  47  0.0005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.127202  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3266  putative transferase  31.9 
 
 		 146 aa  47  0.0005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.482396  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0424  putative acyltransferase  31.9 
 
 		 146 aa  47  0.0005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3188  nucleotidyl transferase  28.97 
 
 		 843 aa  46.6  0.0006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00738142 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2649  hypothetical protein  29.01 
 
 		 457 aa  46.6  0.0006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51490  LpxA family transferase  23.19 
 
 		 209 aa  46.6  0.0007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0160  bifunctional N-acetylglucosamine-1-phosphate uridyltransferase/glucosamine-1-phosphate acetyltransferase  24.51 
 
 		 450 aa  46.6  0.0007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3016  UDP-N-acetylglucosamine acyltransferase  29.82 
 
 		 276 aa  46.2  0.0008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4287  nucleotidyl transferase family protein  30.38 
 
 		 784 aa  46.2  0.0008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.268164 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4347  nucleotidyl transferase family protein  31.65 
 
 		 784 aa  46.2  0.0009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.114462  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4400  nucleotidyl transferase family protein  31.65 
 
 		 784 aa  46.2  0.0009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1294  bifunctional N-acetylglucosamine-1-phosphate uridyltransferase/glucosamine-1-phosphate acetyltransferase  23.58 
 
 		 450 aa  46.2  0.0009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.352222 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4491  nucleotidyl transferase family protein  30.38 
 
 		 784 aa  45.4  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>