More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_0202 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009376  Pars_0202  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  100 
 
 		 291 aa  586  1e-166  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.630911 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0185  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  75.78 
 
 		 335 aa  472  1e-132  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.374978  normal  0.703771 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1238  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  74.91 
 
 		 331 aa  461  1e-129  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0675  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  72.16 
 
 		 333 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.14429 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1605  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  44.48 
 
 		 382 aa  201  9.999999999999999e-51  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.119603  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1761  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  41.06 
 
 		 392 aa  200  3e-50  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1333  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  40.34 
 
 		 297 aa  188  7e-47  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.206464  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1607  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  38.28 
 
 		 293 aa  183  2.0000000000000003e-45  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.553132 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1593  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  40.21 
 
 		 291 aa  169  5e-41  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.516871  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0094  cysteine synthase/cystathionine beta-synthase family protein  31.03 
 
 		 302 aa  91.7  1e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6440  cysteine synthase B  29.9 
 
 		 294 aa  91.7  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.417307  normal  0.797565 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0717  cysteine synthase A  31.53 
 
 		 321 aa  91.7  1e-17  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.00067142  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0162  cysteine synthase  32.54 
 
 		 305 aa  92  1e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0081  cysteine synthase A  31.85 
 
 		 301 aa  90.9  2e-17  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.130263  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0567  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  33.22 
 
 		 301 aa  90.1  4e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.000000159646  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2362  cysteine synthase B  27.12 
 
 		 290 aa  89.4  7e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.688309  normal  0.140538 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0720  cysteine synthase  30.19 
 
 		 321 aa  89  8e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00814603  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12320  cysteine synthase  34.57 
 
 		 309 aa  88.6  1e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.154234  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0535  cysteine synthase A  30.43 
 
 		 310 aa  88.2  2e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.775182  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0548  cysteine synthase A  30.43 
 
 		 310 aa  88.2  2e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0264  cysteine synthase A  31.65 
 
 		 290 aa  87  3e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0316091  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0266  cysteine synthase A  32.34 
 
 		 291 aa  87  4e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0459085  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0154  cysteine synthase K/M/A  29.53 
 
 		 307 aa  86.7  4e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00000000054726  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1899  cysteine synthase B  29.93 
 
 		 295 aa  84.7  0.000000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.512952  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1840  cysteine synthase  32.01 
 
 		 311 aa  84.3  0.000000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000292185  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0315  cysteine synthase  30.95 
 
 		 318 aa  83.6  0.000000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.70232  normal  0.0509531 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0670  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein subunit beta  29.41 
 
 		 330 aa  83.2  0.000000000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1228  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  29.19 
 
 		 302 aa  82.8  0.000000000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0768  cysteine synthase B  28.74 
 
 		 293 aa  82.4  0.000000000000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1231  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  32.65 
 
 		 285 aa  82  0.000000000000009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2678  cysteine synthase  27.39 
 
 		 318 aa  81.6  0.00000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0478  cysteine synthases  30.93 
 
 		 773 aa  82  0.00000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00249553  hitchhiker  0.000140585 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0494  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  29.07 
 
 		 318 aa  80.5  0.00000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00183291  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0481  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  29.07 
 
 		 318 aa  80.5  0.00000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00000231361  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0684  cysteine synthase B  27.4 
 
 		 294 aa  80.5  0.00000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2709  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  30.16 
 
 		 307 aa  80.1  0.00000000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0952  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  30.38 
 
 		 309 aa  79.7  0.00000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1303  cysteine synthase B  28.62 
 
 		 292 aa  79.7  0.00000000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.498371  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2765  cysteine synthase B  28.62 
 
 		 292 aa  79.7  0.00000000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.288853  hitchhiker  0.00234405 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0152  cysteine synthase  29.55 
 
 		 310 aa  79.7  0.00000000000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1005  cysteine synthase B  27.97 
 
 		 294 aa  79.3  0.00000000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.817675  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1412  cysteine synthase B  28.62 
 
 		 292 aa  79.7  0.00000000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.203131  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3005  cysteine synthase B  28.1 
 
 		 308 aa  79  0.00000000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.951108  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1240  cysteine synthase B  28.42 
 
 		 303 aa  79  0.0000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0351057  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1332  cysteine synthase A  29.5 
 
 		 309 aa  78.6  0.0000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000281475  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3277  cysteine synthase B  28.79 
 
 		 293 aa  78.6  0.0000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000158492  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2365  cysteine synthase  30.28 
 
 		 322 aa  78.6  0.0000000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1636  cysteine synthase B  30.31 
 
 		 298 aa  78.6  0.0000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0832  cystathionine beta-synthase (acetylserine-dependent)  31.58 
 
 		 306 aa  78.2  0.0000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00340267  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1314  cysteine synthase  27 
 
 		 322 aa  77.8  0.0000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1150  cysteine synthase A  30 
 
 		 312 aa  77.4  0.0000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.197095  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1251  cysteine synthase B  28.43 
 
 		 297 aa  77.4  0.0000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.122681  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0463  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  31.16 
 
 		 327 aa  78.2  0.0000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.227946  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0763  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  31.54 
 
 		 321 aa  78.2  0.0000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0168407  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3192  cysteine synthase  31.16 
 
 		 323 aa  78.2  0.0000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0763679  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3252  cysteine synthase B  28.95 
 
 		 291 aa  78.2  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.163683 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4578  cysteine synthase B  29.01 
 
 		 299 aa  77.4  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0797  cysteine synthase B  29.23 
 
 		 299 aa  76.6  0.0000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1311  cysteine synthase  28.76 
 
 		 302 aa  76.6  0.0000000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.933049  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3091  cysteine synthase B  31.06 
 
 		 292 aa  76.6  0.0000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0134095  normal  0.472051 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3188  cysteine synthase B  31.06 
 
 		 292 aa  76.6  0.0000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.124444  normal  0.617635 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3199  cysteine synthase B  27.49 
 
 		 293 aa  76.3  0.0000000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.707785  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2504  cysteine synthase B  28.34 
 
 		 295 aa  76.3  0.0000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0746  cysteine synthases  28.43 
 
 		 305 aa  76.3  0.0000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1285  cysteine synthase  29.92 
 
 		 300 aa  76.3  0.0000000000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3651  cysteine synthase B  28.42 
 
 		 303 aa  75.9  0.0000000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.370065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0588  cysteine synthase  31.68 
 
 		 303 aa  75.9  0.0000000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0475794 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2707  cysteine synthase B  28.07 
 
 		 303 aa  75.5  0.000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.397465  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1697  cysteine synthase A  29.97 
 
 		 305 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.516314  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3085  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  29.3 
 
 		 307 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.520498  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5857  cysteine synthase B  28 
 
 		 290 aa  75.1  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1831  cysteine synthase A  29.97 
 
 		 305 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1352  cysteine synthase B  28.67 
 
 		 297 aa  75.1  0.000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.078483  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02140  cysteine synthase  31.18 
 
 		 317 aa  75.1  0.000000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.445604  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1677  cysteine synthase  29.59 
 
 		 317 aa  75.5  0.000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0771  cysteine synthase A  29.87 
 
 		 312 aa  74.7  0.000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1678  cysteine synthase A  29.97 
 
 		 305 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.423565  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1653  cysteine synthase A  29.64 
 
 		 305 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1837  cysteine synthase A  29.97 
 
 		 305 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1954  cysteine synthase A  29.97 
 
 		 305 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.221871  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2576  cysteine synthase B  27.72 
 
 		 303 aa  74.3  0.000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.717552  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1875  cysteine synthase A  29.97 
 
 		 305 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000101872 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08106  putative cystathionine beta-synthase  26.33 
 
 		 345 aa  74.7  0.000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.434389  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3506  cysteine synthase A  29.64 
 
 		 305 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2140  cysteine synthase A  29.15 
 
 		 342 aa  74.7  0.000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.433095  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02321  cysteine synthase B (O-acetylserine sulfhydrolase B)  27.72 
 
 		 303 aa  73.9  0.000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1067  cysteine synthase B  30.08 
 
 		 292 aa  73.6  0.000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000450075  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1919  cysteine synthase A  29.64 
 
 		 305 aa  73.9  0.000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.468327  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2676  cysteine synthase B  27.56 
 
 		 303 aa  73.9  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1087  cysteine synthase  29.5 
 
 		 303 aa  73.9  0.000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.542203  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2793  cysteine synthase B  27.72 
 
 		 303 aa  73.9  0.000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1258  cysteine synthase B  27.72 
 
 		 303 aa  73.9  0.000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00111513 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1100  cysteine synthase B  30.08 
 
 		 292 aa  73.9  0.000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00123647  normal  0.0556364 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2557  cysteine synthase B  27.72 
 
 		 303 aa  73.9  0.000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3011  cysteine synthase B  30.68 
 
 		 292 aa  73.9  0.000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.421236  normal  0.0437724 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0269  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  28.57 
 
 		 331 aa  73.9  0.000000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02282  hypothetical protein  27.72 
 
 		 303 aa  73.9  0.000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1100  cysteine synthase B  28.73 
 
 		 297 aa  73.2  0.000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0902  cysteine synthase A  27.08 
 
 		 299 aa  73.6  0.000000000004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  decreased coverage  0.00000000036612  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1111  cysteine synthase A  31.27 
 
 		 311 aa  73.2  0.000000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0492008  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>