More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_2398 on replicon NC_011061
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007484  Noc_0448  Type I site-specific deoxyribonuclease HsdR  82.69 
 
 
872 aa  1477    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0363122  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1088  HsdR family type I site-specific deoxyribonuclease  63.37 
 
 
1025 aa  1330    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0870888  normal 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2398  type I site-specific deoxyribonuclease, HsdR family  100 
 
 
1015 aa  2103    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.632036  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0929  type I site-specific deoxyribonuclease, HsdR family  69.36 
 
 
990 aa  1470    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.379173  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0447  type I site-specific deoxyribonuclease, HsdR family  70.43 
 
 
989 aa  1495    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.926177  hitchhiker  0.0000000581329 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2012  type I site-specific deoxyribonuclease, HsdR family  68.59 
 
 
1032 aa  1457    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0743  type I site-specific deoxyribonuclease, HsdR family  68.91 
 
 
999 aa  1467    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.575824  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1215  HsdR family type I site-specific deoxyribonuclease  69.16 
 
 
990 aa  1456    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2381  type I restriction-modification system, R subunit  68.59 
 
 
1032 aa  1457    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0134  HsdR family type I site-specific deoxyribonuclease  76.43 
 
 
1015 aa  1637    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.363012 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3719  HsdR family type I site-specific deoxyribonuclease  70.07 
 
 
1023 aa  1487    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3553  HsdR family type I site-specific deoxyribonuclease  70.29 
 
 
984 aa  1475    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0897  HsdR-like, putative type I restriction deoxyribonuclease  37.17 
 
 
1294 aa  541  9.999999999999999e-153  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1841  HsdR family type I site-specific deoxyribonuclease  36.48 
 
 
953 aa  536  1e-151  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5242  type I site-specific deoxyribonuclease, HsdR family  35.62 
 
 
974 aa  531  1e-149  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2474  type I restriction-modification system, R subunit  37.25 
 
 
930 aa  504  1e-141  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.081777  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0185  HsdR family type I site-specific deoxyribonuclease  34.43 
 
 
929 aa  500  1e-140  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0180  HsdR family type I site-specific deoxyribonuclease  34.43 
 
 
929 aa  500  1e-140  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.634319  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3349  type I restriction-modification system R subunit  34.32 
 
 
963 aa  492  1e-137  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.531995  normal  0.015033 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2424  HsdR family type I site-specific deoxyribonuclease  33.11 
 
 
1016 aa  454  1.0000000000000001e-126  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.831432  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1107  HsdR family type I site-specific deoxyribonuclease  33.07 
 
 
1013 aa  454  1.0000000000000001e-126  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1543  type I site-specific deoxyribonuclease, HsdR family  33.15 
 
 
1033 aa  453  1.0000000000000001e-126  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1501  type I site-specific deoxyribonuclease, HsdR family  32.6 
 
 
1034 aa  444  1e-123  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.573056  normal  0.735582 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0502  type I site-specific deoxyribonuclease, HsdR family  33.56 
 
 
1015 aa  445  1e-123  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.840857 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2179  HsdR family type I site-specific deoxyribonuclease  33.8 
 
 
1007 aa  440  9.999999999999999e-123  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3473  type I site-specific deoxyribonuclease, HsdR family  33.99 
 
 
1037 aa  441  9.999999999999999e-123  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1956  type I site-specific deoxyribonuclease, HsdR family protein  33.95 
 
 
1037 aa  439  1e-121  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.160894  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2271  type I restriction-modification system endonuclease  32.6 
 
 
1009 aa  432  1e-119  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0775  HsdR family type I site-specific deoxyribonuclease  33.66 
 
 
1041 aa  429  1e-118  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1410  type I restriction enzyme EcoR124II R protein (R.EcoR124II)  33.85 
 
 
1031 aa  424  1e-117  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.643236  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1853  type I restriction enzyme EcoR124II R protein  32.51 
 
 
989 aa  423  1e-117  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0082  HsdR family type I site-specific deoxyribonuclease  33.06 
 
 
1014 aa  416  1e-114  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0348133  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3053  HsdR family type I site-specific deoxyribonuclease  33.26 
 
 
1038 aa  410  1e-113  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4396  HsdR family type I site-specific deoxyribonuclease  32.78 
 
 
1038 aa  397  1e-109  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.806316  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01119  type I restriction enzyme, R subunit  30.41 
 
 
1174 aa  330  1.0000000000000001e-88  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0747  type I restriction-modification system restriction subunit  29.81 
 
 
996 aa  327  5e-88  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2726  type I site-specific deoxyribonuclease, HsdR family  32.99 
 
 
1041 aa  317  8e-85  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3674  HsdR family type I site-specific deoxyribonuclease  31.6 
 
 
1075 aa  313  7.999999999999999e-84  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4084  HsdR family type I site-specific deoxyribonuclease  33.71 
 
 
1061 aa  309  2.0000000000000002e-82  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3538  HsdR family type I site-specific deoxyribonuclease  29.36 
 
 
1082 aa  309  2.0000000000000002e-82  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0228194  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4384  HsdR family type I site-specific deoxyribonuclease  29.37 
 
 
1061 aa  307  6e-82  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4164  HsdR family type I site-specific deoxyribonuclease  32.02 
 
 
1076 aa  307  6e-82  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0160364 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1913  type I site-specific deoxyribonuclease, HsdR family  32.99 
 
 
1039 aa  297  8e-79  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.0328667 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1962  type I site-specific restriction-modification system R subunit  31.18 
 
 
1095 aa  295  2e-78  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03160  type I site-specific deoxyribonuclease, HsdR family  30.08 
 
 
1077 aa  294  6e-78  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000937778 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3955  type I site-specific deoxyribonuclease, HsdR family  33.12 
 
 
1042 aa  290  8e-77  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0447  type I restriction-modification system endonuclease  84.66 
 
 
163 aa  284  6.000000000000001e-75  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00337855  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0559  type I site-specific deoxyribonuclease, restriction subunit  30.19 
 
 
1066 aa  276  2.0000000000000002e-72  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.193671  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3666  Type I site-specific deoxyribonuclease  30.9 
 
 
881 aa  273  9e-72  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.616224  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0616  HsdR family type I site-specific deoxyribonuclease  29.01 
 
 
1024 aa  185  3e-45  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.945786  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0985  type I site-specific deoxyribonuclease HsdR  27.6 
 
 
1023 aa  167  1.0000000000000001e-39  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.271239  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0008  type I site-specific deoxyribonuclease, HsdR family  24.74 
 
 
1099 aa  163  2e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0402  HsdR family type I site-specific deoxyribonuclease  25.62 
 
 
1055 aa  162  2e-38  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0861  type I site-specific deoxyribonuclease, HsdR family  24.26 
 
 
1031 aa  161  5e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0948  Type I site-specific deoxyribonuclease HsdR  25.84 
 
 
1030 aa  160  8e-38  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000221808  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2674  HsdR family type I site-specific deoxyribonuclease  24.61 
 
 
1027 aa  159  3e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3081  type I site-specific deoxyribonuclease, HsdR family  25.27 
 
 
1027 aa  155  2.9999999999999998e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4202  type I site-specific deoxyribonuclease, HsdR family  26.25 
 
 
1034 aa  153  2e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1804  Type I site-specific deoxyribonuclease HsdR  24.21 
 
 
1068 aa  152  3e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1156  Type I site-specific deoxyribonuclease HsdR  26.51 
 
 
974 aa  152  4e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.159677  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1775  type I restriction-modification system restriction subunit  23.21 
 
 
1041 aa  151  6e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0366  type I restriction-modification system, R subunit  25.07 
 
 
1039 aa  149  2.0000000000000003e-34  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4621  type I site-specific deoxyribonuclease, HsdR family  25.57 
 
 
1028 aa  150  2.0000000000000003e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.250071 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0430  type I site-specific deoxyribonuclease, HsdR family  25.13 
 
 
1030 aa  149  2.0000000000000003e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4244  HsdR family type I site-specific deoxyribonuclease  24.05 
 
 
1084 aa  149  2.0000000000000003e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00104553 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3386  HsdR family type I site-specific deoxyribonuclease  24.72 
 
 
1052 aa  150  2.0000000000000003e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1115  HsdR family type I site-specific deoxyribonuclease  26.75 
 
 
1107 aa  149  3e-34  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0986  HsdR family type I site-specific deoxyribonuclease  24.25 
 
 
1040 aa  148  6e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2793  type I site-specific deoxyribonuclease, HsdR family  25.77 
 
 
1012 aa  148  7.0000000000000006e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.81193  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2283  Type I site-specific deoxyribonuclease  25.67 
 
 
1044 aa  144  9.999999999999999e-33  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0157  HsdR family type I site-specific deoxyribonuclease  24.78 
 
 
1096 aa  144  9.999999999999999e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1893  type I restriction-modification system, R subunit  23.6 
 
 
1069 aa  142  3e-32  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0842  type I restriction-modification enzyme, R subunit  25.56 
 
 
967 aa  141  7e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.156677  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0790  type I restriction-modification enzyme, R subunit  25.56 
 
 
967 aa  141  7e-32  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.225053  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1790  restriction enzyme  23.26 
 
 
1072 aa  140  1e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1944  HsdR family type I site-specific deoxyribonuclease  24.97 
 
 
1034 aa  140  1e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.31477 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0289  HsdR family type I site-specific deoxyribonuclease  25.65 
 
 
1044 aa  140  1e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0037  HsdR family type I site-specific deoxyribonuclease  24.92 
 
 
1061 aa  140  1e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3131  HsdR family type I site-specific deoxyribonuclease  24.94 
 
 
1060 aa  140  1e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.789076  normal  0.0879634 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0017  HsdR family type I site-specific deoxyribonuclease  25.33 
 
 
1032 aa  140  2e-31  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.13213  hitchhiker  0.00259353 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3755  HsdR family type I site-specific deoxyribonuclease  25.22 
 
 
1029 aa  139  2e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0174443  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1093  type I site-specific deoxyribonuclease, HsdR family  25.32 
 
 
1074 aa  140  2e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2281  type I site-specific deoxyribonuclease, HsdR family  25.3 
 
 
986 aa  139  3.0000000000000003e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000865916 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0948  HsdR family type I site-specific deoxyribonuclease  23.29 
 
 
1054 aa  139  3.0000000000000003e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  unclonable  0.0000568458 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2197  HsdR family type I site-specific deoxyribonuclease  23.14 
 
 
1063 aa  139  3.0000000000000003e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.511328  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2218  type I site-specific deoxyribonuclease, HsdR family  24.63 
 
 
975 aa  138  7.000000000000001e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4470  type I site-specific deoxyribonuclease, HsdR family  24.27 
 
 
1084 aa  137  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.566129  normal  0.610404 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1089  type I restriction-modification enzyme, R subunit, putative  22.36 
 
 
1040 aa  136  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.340753  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0245  HsdR family type I site-specific deoxyribonuclease  25.35 
 
 
1038 aa  136  1.9999999999999998e-30  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0288  type I site-specific deoxyribonuclease, HsdR family  25.61 
 
 
1003 aa  137  1.9999999999999998e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7554  HsdR family type I site-specific deoxyribonuclease  25.26 
 
 
1072 aa  136  3e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4782  HsdR family type I site-specific deoxyribonuclease  24.67 
 
 
1029 aa  135  3.9999999999999996e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0380  type I restriction-modification system, R subunit  24.48 
 
 
1033 aa  135  5e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2740  type I restriction-modification system endonuclease  24.4 
 
 
1051 aa  135  5e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3549  HsdR family type I site-specific deoxyribonuclease  25.46 
 
 
1092 aa  134  6e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.276779  normal  0.254191 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2912  HsdR family type I site-specific deoxyribonuclease  24.04 
 
 
1045 aa  134  9e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0011  type I site-specific deoxyribonuclease  24.26 
 
 
1061 aa  134  1.0000000000000001e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.386666 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0099  type I site-specific deoxyribonuclease HsdR  25.39 
 
 
1089 aa  133  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.26483  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0222  Type I site-specific deoxyribonuclease HsdR  24.57 
 
 
1028 aa  133  2.0000000000000002e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2543  type I site-specific deoxyribonuclease, HsdR family  23.84 
 
 
1070 aa  133  2.0000000000000002e-29  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.111804  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>