288 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_1535 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011059  Paes_1535  chlorophyllide reductase iron protein subunit X  100 
 
 
365 aa  748    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.292172  normal  0.0217876 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0937  chlorophyllide reductase iron protein subunit X  74.05 
 
 
372 aa  548  1e-155  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0897  chlorophyllide reductase iron protein subunit X  73.83 
 
 
365 aa  531  1e-150  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.159363  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1792  chlorophyllide reductase iron protein subunit X  72.13 
 
 
368 aa  512  1e-144  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.344281  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0400  chlorophyllide reductase iron protein subunit X  69.75 
 
 
369 aa  506  9.999999999999999e-143  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0534457  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0979  chlorophyllide reductase iron protein subunit X  69.84 
 
 
370 aa  507  9.999999999999999e-143  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1423  chlorophyllide reductase iron protein subunit X  66.76 
 
 
366 aa  471  1e-132  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3127  chlorophyllide reductase iron protein subunit X  51.03 
 
 
411 aa  297  2e-79  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3260  chlorophyllide reductase iron protein subunit X  43.29 
 
 
392 aa  295  1e-78  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0257772 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3746  chlorophyllide reductase iron protein subunit X  49.66 
 
 
392 aa  288  1e-76  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0605815  hitchhiker  0.0000012212 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3517  bacteriachlorophyllide reductase iron protein subunit X  46.49 
 
 
335 aa  226  3e-58  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.326677 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4001  chlorophyllide reductase iron protein subunit X  45.67 
 
 
332 aa  225  9e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.18225  hitchhiker  0.00239808 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1710  chlorophyllide reductase iron protein subunit X  49.6 
 
 
332 aa  224  1e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2036  chlorophyllide reductase iron protein subunit X  49.21 
 
 
333 aa  224  2e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.128879  normal  0.148477 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2052  chlorophyllide reductase iron protein subunit X  47.04 
 
 
329 aa  223  3e-57  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0401365 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0179  chlorophyllide reductase iron protein subunit X  44.3 
 
 
332 aa  223  4.9999999999999996e-57  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1293  chlorophyllide reductase iron protein subunit X  48.39 
 
 
331 aa  223  4.9999999999999996e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.579367  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0262  chlorophyllide reductase, BchX subunit  47.43 
 
 
333 aa  222  8e-57  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1906  chlorophyllide reductase iron protein subunit X  47.43 
 
 
333 aa  222  8e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.195312  normal  0.342059 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3756  chlorophyllide reductase iron protein subunit X  44.98 
 
 
332 aa  220  3e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00499393 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1610  chlorophyllide reductase iron protein subunit X  47.04 
 
 
308 aa  219  5e-56  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6437  bacteriochlorophyllide reductase subunit  47.84 
 
 
332 aa  218  1e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.967786  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2980  chlorophyllide reductase iron protein subunit X  45.35 
 
 
322 aa  216  5.9999999999999996e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.551452  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2818  chlorophyllide reductase iron protein subunit X  49.6 
 
 
334 aa  211  1e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.292291  normal  0.370983 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2957  chlorophyllide reductase iron protein subunit X  49.6 
 
 
334 aa  210  2e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.562644  normal  0.106043 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2730  chlorophyllide reductase iron protein subunit X  45 
 
 
334 aa  209  6e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.44114  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2852  chlorophyllide reductase iron protein subunit X  50.88 
 
 
334 aa  206  5e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.467181 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3697  chlorophyllide reductase iron protein subunit X  49.34 
 
 
334 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.326081  hitchhiker  0.00364932 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0506  nitrogenase reductase-like protein  39.02 
 
 
290 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0803  nitrogenase reductase-like protein  40.08 
 
 
292 aa  172  6.999999999999999e-42  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.186385  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0237  Nitrogenase  42.92 
 
 
272 aa  172  7.999999999999999e-42  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.848648  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1152  nitrogenase reductase-like protein  43.05 
 
 
292 aa  172  1e-41  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1224  nitrogenase reductase-like protein  40.22 
 
 
278 aa  170  4e-41  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1528  nitrogenase reductase-like protein  40 
 
 
313 aa  169  5e-41  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1815  Nitrogenase  40.78 
 
 
251 aa  169  6e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0774  nitrogenase  38.87 
 
 
290 aa  169  1e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1147  nitrogenase reductase-like protein  39.53 
 
 
292 aa  168  2e-40  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0793  nitrogenase  36.67 
 
 
280 aa  165  9e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00476725  normal  0.0446468 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2083  nitrogenase  38.67 
 
 
270 aa  164  2.0000000000000002e-39  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1616  NifH/frxC-family protein  36.73 
 
 
276 aa  164  3e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1353  nitrogenase iron protein  33.67 
 
 
292 aa  162  1e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000220216  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0795  nitrogenase iron protein  44.27 
 
 
291 aa  162  1e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.835028  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2907  nitrogenase iron protein  45.79 
 
 
289 aa  160  2e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2886  Nitrogenase  43.18 
 
 
290 aa  160  3e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.781168  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0165  nitrogenase iron protein subunit NifH  38.17 
 
 
268 aa  160  3e-38  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0404  NifH/frxC-family protein  40.52 
 
 
731 aa  160  4e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.394931 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1627  nitrogenase reductase  39.61 
 
 
274 aa  160  5e-38  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000481616  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2597  nitrogenase iron protein  44.79 
 
 
289 aa  159  6e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.036256  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1751  nitrogenase reductase  40.93 
 
 
274 aa  159  8e-38  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.555016  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0171  nitrogenase reductase  38.72 
 
 
273 aa  159  1e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.217628  normal  0.670038 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1201  nitrogenase iron protein  36.08 
 
 
273 aa  157  2e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1019  nitrogenase reductase  40.99 
 
 
274 aa  157  2e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.855562  normal  0.490785 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3978  protochlorophyllide reductase iron-sulfur ATP-binding protein  36.73 
 
 
312 aa  156  5.0000000000000005e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.475922  normal  0.178633 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2027  protochlorophyllide reductase iron-sulfur ATP-binding protein  41.26 
 
 
275 aa  156  6e-37  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0592137 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1908  protochlorophyllide reductase iron-sulfur ATP-binding protein  41.52 
 
 
273 aa  155  8e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00331132 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4043  nitrogenase iron protein  34.9 
 
 
273 aa  155  9e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0162942 
 
 
-
 
NC_002936  DET1158  nitrogenase reductase  42.11 
 
 
274 aa  155  1e-36  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1813  protochlorophyllide reductase iron-sulfur ATP-binding protein  34.75 
 
 
276 aa  155  1e-36  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0095  Nitrogenase  44.5 
 
 
299 aa  154  2e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0228262 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1949  nitrogenase reductase  40.09 
 
 
274 aa  154  2e-36  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00645764  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0561  nitrogenase iron protein  36.43 
 
 
276 aa  154  2e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.0000368653  normal  0.199489 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1538  protochlorophyllide reductase iron-sulfur ATP-binding protein  41.07 
 
 
273 aa  155  2e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000698797 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1733  protochlorophyllide reductase iron-sulfur ATP-binding protein  36.36 
 
 
312 aa  155  2e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1041  nitrogenase iron protein subunit NifH  42.66 
 
 
248 aa  154  2e-36  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.343788  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0217  protochlorophyllide reductase iron-sulfur ATP-binding protein  40.18 
 
 
276 aa  154  2.9999999999999998e-36  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1528  nitrogenase reductase  37.79 
 
 
274 aa  154  2.9999999999999998e-36  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1023  nitrogenase iron protein  35.69 
 
 
275 aa  153  4e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1038  nitrogenase iron protein subunit NifH  37.25 
 
 
264 aa  153  5e-36  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000199125  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3203  nitrogenase iron protein  36.82 
 
 
288 aa  153  5e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2258  protochlorophyllide reductase iron-sulfur ATP-binding protein  40.81 
 
 
275 aa  153  5.9999999999999996e-36  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00421326  normal  0.488321 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2192  protochlorophyllide reductase iron-sulfur ATP-binding protein  40.18 
 
 
275 aa  153  5.9999999999999996e-36  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0685  nitrogenase reductase  37.4 
 
 
274 aa  152  7e-36  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1244  nitrogenase reductase  37.4 
 
 
274 aa  152  7e-36  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00000240583  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0326  protochlorophyllide reductase iron-sulfur ATP-binding protein  40.18 
 
 
275 aa  151  1e-35  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0117283  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0744  nitrogenase reductase  37.02 
 
 
274 aa  152  1e-35  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1937  nitrogenase  35.15 
 
 
272 aa  151  2e-35  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.894359  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2008  nitrogenase iron protein  43.01 
 
 
324 aa  150  3e-35  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.221735  normal  0.365396 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0408  nitrogenase  39.37 
 
 
254 aa  150  4e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2386  protochlorophyllide reductase iron-sulfur ATP-binding protein  40.18 
 
 
275 aa  149  5e-35  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2613  nitrogenase reductase  36.88 
 
 
276 aa  149  6e-35  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1218  nitrogenase iron protein  43.46 
 
 
288 aa  148  1.0000000000000001e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2821  nitrogenase iron protein  35.41 
 
 
272 aa  149  1.0000000000000001e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.436411  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1142  nitrogenase iron protein  38.71 
 
 
276 aa  148  1.0000000000000001e-34  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.442855  normal  0.809863 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3537  protochlorophyllide reductase iron-sulfur ATP-binding protein  38.18 
 
 
299 aa  148  1.0000000000000001e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3030  nitrogenase iron protein  42.63 
 
 
288 aa  147  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1178  nitrogenase  39.01 
 
 
264 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2098  nitrogenase iron protein  35.77 
 
 
292 aa  147  3e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1007  protochlorophyllide reductase iron-sulfur ATP-binding protein  38.18 
 
 
297 aa  147  3e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.474133 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0834  nitrogenase reductase  36.86 
 
 
276 aa  147  4.0000000000000006e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3478  protochlorophyllide reductase iron-sulfur ATP-binding protein  40.81 
 
 
273 aa  146  4.0000000000000006e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1395  nitrogenase reductase  39.73 
 
 
275 aa  146  5e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2703  nitrogen fixation protein NifH/NifE  41.04 
 
 
746 aa  146  6e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.15509 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0288  protochlorophyllide reductase iron-sulfur ATP-binding protein  37.73 
 
 
297 aa  146  7.0000000000000006e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1931  protochlorophyllide reductase iron-sulfur ATP-binding protein  37.73 
 
 
297 aa  146  7.0000000000000006e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.47686 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0143  nitrogenase iron protein  34.88 
 
 
280 aa  145  9e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.343179  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0662  nitrogenase iron protein subunit NifH  36.05 
 
 
289 aa  145  1e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.24324  normal  0.221237 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0280  NifH/frxC  38.6 
 
 
728 aa  145  1e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.359044  normal  0.513981 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3467  nitrogenase iron protein  35.27 
 
 
288 aa  145  1e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2610  nitrogenase reductase  37.11 
 
 
275 aa  145  1e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.343866  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1573  nitrogenase iron protein subunit NifH  43.46 
 
 
284 aa  145  1e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>