55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_04295 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_04295  hypothetical protein  100 
 
 		 377 aa  761    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0871  hypothetical protein  36.19 
 
 		 281 aa  54.7  0.000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0021  DNA modification methylase-like protein  44.44 
 
 		 481 aa  53.5  0.000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0038  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  31 
 
 		 257 aa  53.1  0.000007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2450  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  34.65 
 
 		 368 aa  52.4  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2337  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  40.68 
 
 		 334 aa  52.8  0.00001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.628508 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0117  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  47.27 
 
 		 315 aa  52  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00741013  normal  0.263203 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1611  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  48.28 
 
 		 226 aa  48.9  0.0001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.932  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4038  putative RNA methylase  40.98 
 
 		 483 aa  48.9  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00846703 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3593  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  33.64 
 
 		 372 aa  49.3  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.316349  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0525  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  41.82 
 
 		 284 aa  49.3  0.0001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1546  DNA methylase N-4/N-6  35.48 
 
 		 470 aa  48.5  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.572545  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0953  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  28.46 
 
 		 372 aa  47.8  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.752338  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0286  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  49.02 
 
 		 271 aa  48.1  0.0003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.684049  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3164  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  45.28 
 
 		 225 aa  47.8  0.0003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0356148  normal  0.905473 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00415  adenine-specific DNA modification methyltransferase  28.05 
 
 		 374 aa  48.1  0.0003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.530575  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3275  adenine-specific DNA methylase  32.56 
 
 		 596 aa  47.4  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.762851  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1456  putative RNA methylase  40.82 
 
 		 463 aa  47.4  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.270738 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0844  hypothetical protein  36.99 
 
 		 441 aa  47  0.0006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.506962 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3357  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  45.28 
 
 		 225 aa  46.6  0.0007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.363885 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2104  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  40.54 
 
 		 269 aa  46.6  0.0007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.636734  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0988  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  46.55 
 
 		 225 aa  46.2  0.0008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0151076  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0534  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  35.19 
 
 		 239 aa  46.2  0.0008  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000146587 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2276  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  40.68 
 
 		 403 aa  45.8  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.265094  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0872  nuclease  31.25 
 
 		 684 aa  46.2  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0022  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  40 
 
 		 412 aa  45.4  0.001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6722  putative RNA methylase  46 
 
 		 292 aa  46.2  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.121582  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2731  methyltransferase DNA modification enzyme  40.28 
 
 		 410 aa  45.1  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0639  DNA methylase N-4/N-6  30.19 
 
 		 852 aa  45.4  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.028356 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0120  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  43.4 
 
 		 225 aa  45.4  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0225106 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3216  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  40.74 
 
 		 425 aa  45.1  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.676977  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2277  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  45.1 
 
 		 421 aa  45.4  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0946567  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0806  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  44 
 
 		 488 aa  45.1  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1658  adenine-specific DNA methylase  34 
 
 		 416 aa  45.1  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000448906  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0737  hypothetical protein  45.1 
 
 		 407 aa  44.7  0.003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00870561  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1070  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  47.17 
 
 		 223 aa  44.7  0.003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1670  DNA methylase  47.27 
 
 		 378 aa  44.7  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000519085  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4192  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  40.82 
 
 		 267 aa  44.3  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.291791 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1578  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  45.1 
 
 		 483 aa  44.7  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0790  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  35.29 
 
 		 293 aa  44.3  0.004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0073  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  41.51 
 
 		 429 aa  43.9  0.004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6933  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  42.59 
 
 		 327 aa  44.3  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0266817  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0828  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  36.84 
 
 		 323 aa  44.3  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.238994 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2010  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  42.55 
 
 		 370 aa  43.9  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.393522  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2655  prophage LambdaMc01, DNA methyltransferase  46 
 
 		 421 aa  43.5  0.006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0875  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  38.78 
 
 		 281 aa  43.5  0.006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.0000314247  unclonable  0.00000000054829 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3051  methyltransferase DNA modification enzyme  42.31 
 
 		 421 aa  43.1  0.007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1099  DNA modification methylase-like  38.46 
 
 		 413 aa  43.1  0.007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000152418  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0375  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  44.44 
 
 		 373 aa  43.1  0.008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.984822  hitchhiker  0.00505908 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1626  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  46.81 
 
 		 284 aa  43.1  0.008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3798  putative RNA methylase  39.13 
 
 		 495 aa  43.1  0.008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0054  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  41.18 
 
 		 416 aa  43.1  0.009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.549481  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1005  Methyltransferase type 11  31.97 
 
 		 249 aa  42.7  0.009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0263  prophage LambdaW1, DNA methylase  35.29 
 
 		 409 aa  42.7  0.009  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1810  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  42.86 
 
 		 329 aa  42.7  0.01  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.729703  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>