67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_03495 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_03495  peptidase, S54 (rhomboid) family, putative  100 
 
 		 241 aa  473  1e-132  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4037  Rhomboid family protein  65.42 
 
 		 256 aa  277  1e-73  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.6253 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2190  rhomboid-like protein  40.38 
 
 		 256 aa  154  1e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0020  Rhomboid family protein  42.16 
 
 		 242 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.430888  normal  0.257082 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2355  rhomboid family protein  41.83 
 
 		 225 aa  107  2e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.481734  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11367  hypothetical protein  43.71 
 
 		 240 aa  103  3e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000159255  normal  0.565329 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4290  rhomboid family protein  38.01 
 
 		 225 aa  100  2e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.235195 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0870  rhomboid family protein  36.54 
 
 		 217 aa  100  2e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.474351  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1292  Rhomboid family protein  39.62 
 
 		 218 aa  98.2  1e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1968  Rhomboid family protein  37.5 
 
 		 209 aa  97.1  2e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.579025  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0409  rhomboid family protein  31.61 
 
 		 254 aa  96.3  4e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.48547  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1166  rhomboid family protein  44.94 
 
 		 203 aa  95.5  6e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.270459  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0816  rhomboid family protein  35.44 
 
 		 217 aa  94.4  1e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0338425 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2931  hypothetical protein  35.5 
 
 		 209 aa  94.7  1e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1014  Rhomboid family protein  42.19 
 
 		 211 aa  90.1  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05645  hypothetical protein  32.74 
 
 		 243 aa  90.9  2e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3847  rhomboid-like protein  38.3 
 
 		 229 aa  90.1  3e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.706998  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3833  rhomboid family protein  38.3 
 
 		 229 aa  90.1  3e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.123516 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3921  rhomboid family protein  38.3 
 
 		 229 aa  90.1  3e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2687  Rhomboid family protein  35.88 
 
 		 195 aa  89.4  4e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0458  Rhomboid family protein  37.5 
 
 		 199 aa  89.7  4e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.365759  normal  0.0342055 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0445  Rhomboid family protein  37.5 
 
 		 199 aa  89.7  4e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4537  Rhomboid family protein  36.96 
 
 		 211 aa  89.4  5e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1699  Rhomboid family protein  33.87 
 
 		 238 aa  85.5  7e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0109717  normal  0.288911 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0999  membrane protein-like protein  36.25 
 
 		 214 aa  84.7  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1835  hypothetical protein  40 
 
 		 208 aa  82.8  0.000000000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.210618 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1218  rhomboid-like protein  36.36 
 
 		 192 aa  82.8  0.000000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05140  uncharacterized membrane protein  40.79 
 
 		 215 aa  82.8  0.000000000000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0193508  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2245  Rhomboid family protein  33.33 
 
 		 208 aa  82.8  0.000000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.927336  normal  0.19661 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29150  uncharacterized membrane protein  36.81 
 
 		 192 aa  82.4  0.000000000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.77593 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3288  rhomboid family protein  33.33 
 
 		 188 aa  80.5  0.00000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.419904  normal  0.14136 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0267  Rhomboid family protein  37.78 
 
 		 224 aa  80.5  0.00000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0637  rhomboid-like protein  30 
 
 		 191 aa  80.1  0.00000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00193081 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1238  Rhomboid family protein  42.77 
 
 		 211 aa  78.6  0.00000000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000294506 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0518  rhomboid family protein  43.94 
 
 		 210 aa  75.5  0.0000000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.137461  normal  0.0721678 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0810  Rhomboid family protein  32.89 
 
 		 258 aa  73.9  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3473  hypothetical protein  34.12 
 
 		 174 aa  72.8  0.000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000477638  normal  0.0111497 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1781  rhomboid-like protein protein  37.25 
 
 		 214 aa  71.2  0.00000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.138273  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0440  Rhomboid family protein  36.3 
 
 		 194 aa  68.6  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0836383  normal  0.594708 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0855  hypothetical protein  30.81 
 
 		 199 aa  67  0.0000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01334  Rhomboid-like protein  31.71 
 
 		 179 aa  65.9  0.0000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.902393  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0886  hypothetical protein  34.39 
 
 		 199 aa  65.5  0.0000000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3385  rhomboid family protein  40.14 
 
 		 183 aa  65.5  0.0000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.861601 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3785  rhomboid family protein  31.76 
 
 		 185 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1694  rhomboid-like protein  31.55 
 
 		 184 aa  60.5  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.534876  normal  0.239545 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2531  rhomboid family protein  30.98 
 
 		 263 aa  52.8  0.000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.751924 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0760  hypothetical protein  34 
 
 		 180 aa  52.4  0.000006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0020  Rhomboid family protein  34.03 
 
 		 315 aa  52  0.000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2134  rhomboid family protein  36.17 
 
 		 198 aa  49.3  0.00006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00873022  decreased coverage  0.000000167975 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0013  rhomboid family protein  32.8 
 
 		 287 aa  48.5  0.00009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0069  Rhomboid family protein  28.86 
 
 		 292 aa  48.1  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17631  rhomboid family protein  32.87 
 
 		 193 aa  47  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.97289 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0012  Rhomboid family protein  35.66 
 
 		 282 aa  47  0.0002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3861  putative intramembrane serine protease  32.05 
 
 		 554 aa  47.8  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1899  hypothetical protein  32.89 
 
 		 179 aa  46.2  0.0004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.173429  normal  0.681573 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3068  rhomboid family protein  32.64 
 
 		 298 aa  46.2  0.0005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.000231601  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1705  rhomboid family protein  28.26 
 
 		 342 aa  44.7  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.745116  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0023  Rhomboid family protein  35.87 
 
 		 278 aa  44.7  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.816086  normal  0.0542249 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0919  membrane-associated serine protease  24.16 
 
 		 236 aa  43.9  0.002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.473127  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0044  Rhomboid family protein  27.21 
 
 		 356 aa  43.5  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0014  Rhomboid family protein  35.66 
 
 		 298 aa  43.1  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1860  Rhomboid family protein  27.87 
 
 		 519 aa  43.1  0.004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000892671  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21960  uncharacterized membrane protein  25.41 
 
 		 267 aa  42.7  0.005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00559972  decreased coverage  0.002494 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5244  Rhomboid family protein  35.2 
 
 		 306 aa  42.7  0.005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.159225  hitchhiker  0.00568338 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5753  rhomboid family protein  32.59 
 
 		 290 aa  42.4  0.007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0172846 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4481  rhomboid family protein  36.57 
 
 		 303 aa  41.6  0.01  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.46562  normal  0.0126709 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4995  rhomboid family protein  35.07 
 
 		 303 aa  41.6  0.01  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.295556  decreased coverage  0.00000450745 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>