296 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_00524 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_00524  preprotein translocase subunit YajC  100 
 
 		 117 aa  234  3e-61  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0168  preprotein translocase subunit YajC  66.67 
 
 		 120 aa  157  5e-38  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0192  preprotein translocase subunit YajC  66.67 
 
 		 120 aa  156  8e-38  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1616  preprotein translocase subunit YajC  69.23 
 
 		 114 aa  154  5.0000000000000005e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0558559  normal  0.288697 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3279  preprotein translocase subunit YajC  55.77 
 
 		 108 aa  116  9.999999999999999e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.198543  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0276  protein translocase subunit yajC  60.87 
 
 		 108 aa  113  7.999999999999999e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.865381  normal  0.0326765 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2834  protein translocase subunit yajC  49.56 
 
 		 109 aa  113  1.0000000000000001e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3408  preprotein translocase subunit YajC  59.14 
 
 		 108 aa  112  1.0000000000000001e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.327995  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2526  preprotein translocase subunit YajC  51.89 
 
 		 109 aa  111  3e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2958  preprotein translocase subunit YajC  54.05 
 
 		 110 aa  111  3e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2548  preprotein translocase subunit YajC  54.05 
 
 		 110 aa  111  3e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0861289 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1304  preprotein translocase, YajC subunit  59.26 
 
 		 109 aa  111  3e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2714  preprotein translocase subunit YajC  60.71 
 
 		 109 aa  110  5e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.191333 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2665  preprotein translocase subunit YajC  51.82 
 
 		 107 aa  110  9e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.423387 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0636  preprotein translocase subunit YajC  51.82 
 
 		 107 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3809  preprotein translocase subunit YajC  51.82 
 
 		 107 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1277  preprotein translocase subunit YajC  59.52 
 
 		 108 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0689  preprotein translocase subunit YajC  51.82 
 
 		 107 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.367207  normal  0.660097 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0237  preprotein translocase subunit YajC  51.82 
 
 		 107 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1217  protein translocase subunit yajC  46.43 
 
 		 168 aa  109  1.0000000000000001e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.38734 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0611  preprotein translocase subunit YajC  51.82 
 
 		 107 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0721  preprotein translocase subunit YajC  51.82 
 
 		 107 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2945  preprotein translocase subunit YajC  57.14 
 
 		 108 aa  108  2.0000000000000002e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1698  preprotein translocase, YajC subunit  49.14 
 
 		 123 aa  108  3e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0302  preprotein translocase subunit YajC  58.33 
 
 		 108 aa  107  4.0000000000000004e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2386  preprotein translocase subunit YajC  58.33 
 
 		 108 aa  107  4.0000000000000004e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2572  preprotein translocase subunit YajC  58.33 
 
 		 108 aa  107  4.0000000000000004e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.933871  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1164  preprotein translocase subunit YajC  58.33 
 
 		 108 aa  107  4.0000000000000004e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3372  preprotein translocase subunit YajC  58.33 
 
 		 108 aa  107  4.0000000000000004e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3329  preprotein translocase subunit YajC  58.33 
 
 		 108 aa  107  4.0000000000000004e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.211385  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3363  preprotein translocase subunit YajC  58.33 
 
 		 108 aa  107  4.0000000000000004e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3991  preprotein translocase subunit YajC  49.06 
 
 		 120 aa  107  5e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.340437  normal  0.209525 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1115  preprotein translocase, YajC subunit  52.78 
 
 		 120 aa  107  6e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.242644  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0700  preprotein translocase subunit YajC  49.06 
 
 		 109 aa  107  6e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1790  preprotein translocase, YajC subunit  53.77 
 
 		 108 aa  107  6e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.645433  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1662  protein translocase subunit yajC  50 
 
 		 109 aa  107  7.000000000000001e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000198451  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4088  preprotein translocase, YajC subunit  51.72 
 
 		 91 aa  107  8.000000000000001e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.310824  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4645  protein translocase subunit yajC  53.49 
 
 		 91 aa  106  8.000000000000001e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4006  protein translocase subunit yajC  50 
 
 		 109 aa  105  3e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0343  preprotein translocase, YajC subunit  52.75 
 
 		 127 aa  104  3e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.23698 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3356  preprotein translocase, YajC subunit  50 
 
 		 110 aa  105  3e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1697  preprotein translocase, YajC subunit  55.42 
 
 		 114 aa  105  3e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2067  preprotein translocase, YajC subunit  55.56 
 
 		 109 aa  104  4e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2809  preprotein translocase subunit YajC  55.95 
 
 		 108 aa  103  6e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5120  preprotein translocase, YajC subunit  55.95 
 
 		 92 aa  103  8e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1507  preprotein translocase, YajC subunit  54.35 
 
 		 108 aa  102  2e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0839  preprotein translocase, YajC subunit  51.11 
 
 		 111 aa  101  3e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4646  protein translocase subunit yajC  51.69 
 
 		 94 aa  101  3e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.479824  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3867  preprotein translocase, YajC subunit  53.01 
 
 		 91 aa  101  4e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0682  preprotein translocase YajC subunit  47.79 
 
 		 118 aa  100  5e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2646  preprotein translocase, YajC subunit  47.57 
 
 		 108 aa  100  7e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000808918  hitchhiker  0.00137205 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1291  preprotein translocase subunit YajC  53.16 
 
 		 112 aa  99.8  1e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14610  preprotein translocase subunit YajC  53.16 
 
 		 112 aa  99.8  1e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1332  preprotein translocase, YajC subunit  44.74 
 
 		 111 aa  99  2e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0235382  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3519  preprotein translocase subunit YajC  45.16 
 
 		 109 aa  98.6  3e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0958686  normal  0.24263 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2183  preprotein translocase, YajC subunit  55.56 
 
 		 113 aa  98.2  3e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2078  protein translocase subunit yajC  51.69 
 
 		 106 aa  97.4  5e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.459618  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1241  protein translocase subunit  46.09 
 
 		 116 aa  95.5  2e-19  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.0000875528  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1292  preprotein translocase, YajC subunit  46.09 
 
 		 116 aa  94.7  3e-19  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  5.005270000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3886  preprotein translocase, YajC subunit  44.94 
 
 		 93 aa  94.7  3e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.305651  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4620  preprotein translocase subunit YajC  46.67 
 
 		 111 aa  93.6  8e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.833484 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1414  preprotein translocase, YajC subunit  49.37 
 
 		 111 aa  92.4  2e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.110073  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1229  preprotein translocase subunit YajC  49.37 
 
 		 111 aa  92.4  2e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0394922  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1765  protein translocase subunit yajC  50 
 
 		 143 aa  92.8  2e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.242653  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0513  protein translocase subunit yajC  50 
 
 		 106 aa  91.3  4e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40470  preprotein translocase subunit YajC  48.1 
 
 		 111 aa  90.9  5e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0834  preprotein translocase subunit YajC  48.1 
 
 		 111 aa  90.5  8e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.550481  normal  0.385632 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0877  preprotein translocase subunit YajC  48.1 
 
 		 111 aa  90.5  8e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.203563 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0864  preprotein translocase subunit YajC  48.1 
 
 		 111 aa  90.5  8e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.226856  normal  0.522349 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4344  preprotein translocase subunit YajC  48.1 
 
 		 111 aa  90.1  8e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000136476 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00355  preprotein translocase subunit YajC  41.59 
 
 		 110 aa  89.4  2e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.324829  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3202  preprotein translocase, YajC subunit  41.59 
 
 		 110 aa  89.4  2e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.463836  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0437  preprotein translocase subunit YajC  41.59 
 
 		 110 aa  89.4  2e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1983  hypothetical protein  46.59 
 
 		 111 aa  89.4  2e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1978  hypothetical protein  46.59 
 
 		 111 aa  89.4  2e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2351  preprotein translocase subunit, YajC  43.75 
 
 		 111 aa  89.4  2e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1716  preprotein translocase, YajC subunit  48.15 
 
 		 111 aa  89  2e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.741067 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2058  preprotein translocase, YajC subunit  48.15 
 
 		 111 aa  89  2e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.674684  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3226  preprotein translocase subunit YajC  41.59 
 
 		 110 aa  89.4  2e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000105955 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0439  preprotein translocase subunit YajC  41.59 
 
 		 110 aa  89.4  2e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0477  preprotein translocase subunit YajC  41.59 
 
 		 110 aa  89.4  2e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00359  hypothetical protein  41.59 
 
 		 110 aa  89.4  2e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.35742  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0487  preprotein translocase subunit YajC  41.59 
 
 		 110 aa  89.4  2e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0326  preprotein translocase subunit YajC  39.82 
 
 		 110 aa  88.6  3e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0271  preprotein translocase subunit YajC  42.34 
 
 		 110 aa  87.4  6e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.253267  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0446  preprotein translocase subunit YajC  40.71 
 
 		 110 aa  86.3  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1179  preprotein translocase subunit, YajC  39.66 
 
 		 111 aa  86.7  1e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.405  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0452  preprotein translocase subunit YajC  40.71 
 
 		 110 aa  86.3  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.654019  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0465  preprotein translocase subunit YajC  40.71 
 
 		 110 aa  86.3  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0506  preprotein translocase subunit YajC  40.71 
 
 		 110 aa  86.3  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0445  preprotein translocase subunit YajC  40.71 
 
 		 110 aa  86.3  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01346  preprotein translocase subunit YajC  51.72 
 
 		 112 aa  85.9  2e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.153767  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1121  preprotein translocase subunit YajC  50 
 
 		 111 aa  85.9  2e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.131891  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3096  preprotein translocase, YajC subunit  45.35 
 
 		 111 aa  85.5  2e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0763389  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3465  preprotein translocase, YajC subunit  46.88 
 
 		 114 aa  85.9  2e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.113386  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2905  preprotein translocase, YajC subunit  45.35 
 
 		 111 aa  84.7  3e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.653173  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1062  preprotein translocase subunit YajC  37.07 
 
 		 110 aa  85.1  3e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.9983  hitchhiker  0.00140347 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1757  preprotein translocase subunit YajC  40.4 
 
 		 110 aa  84  6e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.000000115206  hitchhiker  0.00353276 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2701  preprotein translocase subunit YajC  40.78 
 
 		 110 aa  84  6e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00115009  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2891  preprotein translocase subunit YajC  40.4 
 
 		 110 aa  84  6e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0845715  hitchhiker  0.000439753 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>