More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_2063 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_2063  hypothetical protein  100 
 
 		 242 aa  505  9.999999999999999e-143  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0215338  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1873  amidotransferase  93.36 
 
 		 242 aa  473  1e-132  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1741  amidotransferase  81.01 
 
 		 240 aa  410  1e-114  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1842  amidotransferase  75.54 
 
 		 244 aa  372  1e-102  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1451  amidotransferase  75.54 
 
 		 244 aa  373  1e-102  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.410018  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3868  amidotransferase  73.86 
 
 		 244 aa  372  1e-102  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.160036 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2587  amidotransferase  74.27 
 
 		 241 aa  372  1e-102  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0493752 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1420  amidotransferase  71.49 
 
 		 243 aa  369  1e-101  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.388788  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42010  amidotransferase  73 
 
 		 240 aa  363  1e-99  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3566  amidotransferase  72.57 
 
 		 240 aa  360  8e-99  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2694  amidotransferase  47.23 
 
 		 233 aa  218  8.999999999999998e-56  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2104  glutamine amidotransferase class-I  36.8 
 
 		 232 aa  182  4.0000000000000006e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.503763 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4674  amidotransferase, putative  36.36 
 
 		 234 aa  181  7e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.623837 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1182  glutamine amidotransferase class-I  38.82 
 
 		 243 aa  171  6.999999999999999e-42  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0770  glutamine amidotransferase class I  37.71 
 
 		 231 aa  168  7e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2529  GMP synthase glutamine amidotransferase subunit  34.93 
 
 		 232 aa  165  6.9999999999999995e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.777754 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2203  hypothetical protein  35.06 
 
 		 232 aa  164  1.0000000000000001e-39  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2175  hypothetical protein  34.2 
 
 		 232 aa  161  1e-38  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0721  glutamine amidotransferase class-I  39.06 
 
 		 230 aa  160  2e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.31334 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0692  glutamine amidotransferase class-I  38.2 
 
 		 230 aa  159  5e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.767227  normal  0.956702 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0734  glutamine amidotransferase class-I  38.98 
 
 		 233 aa  156  3e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0888  glutamine amidotransferase class-I  38.1 
 
 		 251 aa  153  2e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3519  glutamine amidotransferase class-I  34.75 
 
 		 236 aa  148  1.0000000000000001e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.307649 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0696  glutamine amidotransferase class-I  35.74 
 
 		 231 aa  144  9e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.156781  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0299  glutamine amidotransferase class-I  33.2 
 
 		 240 aa  128  7.000000000000001e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1837  glutamine amidotransferase, class I  33.77 
 
 		 226 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0599314  normal  0.354168 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1126  glutamine amidotransferase, class I  33.04 
 
 		 237 aa  119  3.9999999999999996e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.527906  normal  0.244414 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2916  glutamine amidotransferase class-I  29.57 
 
 		 244 aa  115  5e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.186988 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0865  glutamine amidotransferase class-I  33 
 
 		 225 aa  106  4e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1396  glutamine amidotransferase class-I  34.34 
 
 		 238 aa  103  3e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.187754 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0376  glutamine amidotransferase class-I  33.67 
 
 		 225 aa  102  4e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2020  glutamine amidotransferase class-I  33.67 
 
 		 225 aa  102  6e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00200  conserved hypothetical protein  28.8 
 
 		 252 aa  98.2  9e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.45844 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3722  glutamine amidotransferase class-I  28.57 
 
 		 239 aa  89.7  4e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.777464  normal  0.508189 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2225  putative glutamine amidotransferase class-I  30.26 
 
 		 236 aa  88.2  1e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.987752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3149  glutamine amidotransferase class-I  34.25 
 
 		 278 aa  87  2e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08975  conserved hypothetical protein  29.89 
 
 		 284 aa  83.6  0.000000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0643563  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1753  glutamine amidotransferase class-I  32.14 
 
 		 249 aa  83.6  0.000000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1121  glutamine amidotransferase class-I  28.91 
 
 		 239 aa  84  0.000000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.997537 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2155  glutamine amidotransferase  27 
 
 		 243 aa  81.3  0.00000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2614  glutamine amidotransferase class-I  30.06 
 
 		 238 aa  80.1  0.00000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.223861  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3672  glutamine amidotransferase class-I  34.24 
 
 		 236 aa  79.3  0.00000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3619  glutamine amidotransferase class-I  29.9 
 
 		 235 aa  79  0.00000000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0041  glutamine amidotransferase class-I  27.57 
 
 		 246 aa  78.6  0.00000000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0721  glutamine amidotransferase class-I  27.55 
 
 		 238 aa  72.8  0.000000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.706458  normal  0.650481 
 
 
-
 
NC_006682  CNM00680  cytoplasm protein, putative  28.95 
 
 		 357 aa  72.4  0.000000000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.822893  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1607  glutamine amidotransferase class-I  30 
 
 		 258 aa  71.2  0.00000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.471476  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0325  glutamine amidotransferase class-I  30.91 
 
 		 250 aa  71.2  0.00000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.193734 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2745  glutamine amidotransferase  33.53 
 
 		 240 aa  70.5  0.00000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.562281  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1523  glutamine amidotransferase  34.13 
 
 		 240 aa  69.7  0.00000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2584  glutamine amidotransferase class-I  27.37 
 
 		 241 aa  68.2  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0213  glutamine amidotransferase  25.5 
 
 		 238 aa  67  0.0000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.486178 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1359  glutamine amidotransferase class-I  29.59 
 
 		 247 aa  67.8  0.0000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1762  glutamine amidotransferase  28.65 
 
 		 250 aa  67.8  0.0000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_34923  predicted protein  27.6 
 
 		 312 aa  66.6  0.0000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.366717  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2563  glutamine amidotransferase  28.83 
 
 		 237 aa  66.2  0.0000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.703088  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1637  glutamine amidotransferase class-I  32.32 
 
 		 245 aa  65.9  0.0000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.419704  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1937  GMP synthase large subunit  32.95 
 
 		 508 aa  65.5  0.0000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000487266 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3627  glutamine amidotransferase class-I  32.88 
 
 		 223 aa  64.7  0.000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1432  GMP synthase  34.91 
 
 		 511 aa  64.7  0.000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0118817  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3619  glutamine amidotransferase-like protein  26.88 
 
 		 229 aa  64.7  0.000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.681505 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2184  GMP synthase, large subunit  34.29 
 
 		 507 aa  63.9  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.255738  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4466  glutamine amidotransferase class-I  29.56 
 
 		 241 aa  63.5  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.397563 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0677  GMP synthase, large subunit  32.79 
 
 		 522 aa  63.2  0.000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.476602  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0817  GMP synthase [glutamine-hydrolyzing]  29.41 
 
 		 228 aa  63.2  0.000000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1742  glutamine amidotransferase  31.79 
 
 		 240 aa  63.2  0.000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1583  GMP synthase  34.56 
 
 		 513 aa  62  0.000000008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2875  glutamine amidotransferase class-I  24.74 
 
 		 235 aa  62  0.000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.511003  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3458  GMP synthase, large subunit  34.75 
 
 		 525 aa  62  0.000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.160895 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_47463  Predicted glutamine synthetase glutamine amidotransferase  28.57 
 
 		 301 aa  61.2  0.00000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.881138 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1179  glutamine amidotransferase, class I  28.82 
 
 		 228 aa  61.2  0.00000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3785  glutamine amidotransferase class-I  25 
 
 		 258 aa  61.2  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.134927  normal  0.284097 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1260  glutamine amidotransferase class-I  29.93 
 
 		 249 aa  61.2  0.00000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.201229 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2216  GMP synthase  33.85 
 
 		 528 aa  61.2  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.285654 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0844  glutamine amidotransferase class-I  30.73 
 
 		 253 aa  60.5  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.113234  normal  0.319271 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5138  GMP synthase - Glutamine amidotransferase domain- like protein  28.49 
 
 		 238 aa  60.8  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.127338  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01005  bifunctional GMP synthase/glutamine amidotransferase protein  28.74 
 
 		 509 aa  60.5  0.00000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0220  GMP synthase  29.49 
 
 		 522 aa  60.5  0.00000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2617  glutamine amidotransferase class-I  30.6 
 
 		 233 aa  59.7  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0800  glutamine amidotransferase class-I  23.41 
 
 		 251 aa  59.7  0.00000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.172582 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1509  glutamine amidotransferase class-I  26.57 
 
 		 241 aa  59.3  0.00000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4317  glutamine amidotransferase class-I  32.03 
 
 		 243 aa  59.3  0.00000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1670  glutamine amidotransferase  31.74 
 
 		 240 aa  59.3  0.00000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1727  GMP synthase  36.61 
 
 		 525 aa  58.9  0.00000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.865891  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2388  glutamine amidotransferase class-I  32.26 
 
 		 254 aa  58.9  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1184  GMP synthase  36.36 
 
 		 519 aa  58.5  0.00000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.550912  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0694  GMP synthase  33.96 
 
 		 542 aa  58.5  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0722  GMP synthase  33.96 
 
 		 542 aa  58.5  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0373308  normal  0.160767 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2989  hypothetical protein  26.95 
 
 		 229 aa  58.2  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.721184  normal  0.0157229 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1557  GMP synthase, large subunit  34.21 
 
 		 512 aa  58.2  0.0000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000239894  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1264  GMP synthase  27.53 
 
 		 510 aa  58.2  0.0000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2917  glutamine amidotransferase class-I domain protein  26.73 
 
 		 237 aa  57  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3985  glutamine amidotransferase  28.24 
 
 		 248 aa  57.4  0.0000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.759173 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19600  GMP synthase family protein  32.62 
 
 		 249 aa  57.8  0.0000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0435043 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1054  GMP synthase  32.41 
 
 		 540 aa  57.4  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0138128  hitchhiker  0.000561419 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1556  GMP synthase large subunit  32.74 
 
 		 540 aa  57.8  0.0000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.185236  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0445  GMP synthase  32.62 
 
 		 524 aa  57.4  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.323324  normal  0.382919 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2532  glutamine amidotransferase class-I  26.73 
 
 		 237 aa  57  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03836  glutamine amidotransferase  26.79 
 
 		 250 aa  57  0.0000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.172302  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1837  glutamine amidotransferase (class I)  28.93 
 
 		 243 aa  57  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>