27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_3718 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_3718  VirD2 components relaxase  100 
 
 		 70 aa  141  3e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1989  hypothetical protein  87.14 
 
 		 667 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.156539  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1268  hypothetical protein  80 
 
 		 657 aa  117  4.9999999999999996e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0691  hypothetical protein  77.14 
 
 		 662 aa  112  2.0000000000000002e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4171  hypothetical protein  72.86 
 
 		 653 aa  109  2.0000000000000002e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1293  hypothetical protein  94.44 
 
 		 657 aa  107  7.000000000000001e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2625  hypothetical protein  96.15 
 
 		 660 aa  106  9.000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.324937  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0453  hypothetical protein  96.15 
 
 		 678 aa  106  1e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1489  hypothetical protein  94.23 
 
 		 700 aa  104  3e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.685249  normal  0.0298557 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2716  hypothetical protein  92.86 
 
 		 793 aa  103  7e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.322654  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31070  hypothetical protein  92.31 
 
 		 786 aa  103  1e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.0000000153528  unclonable  1.9184199999999998e-21 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35930  hypothetical protein  90.74 
 
 		 661 aa  103  1e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3726  hypothetical protein  94.23 
 
 		 657 aa  103  1e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1883  hypothetical protein  94.23 
 
 		 703 aa  103  1e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.239499  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1259  hypothetical protein  88.57 
 
 		 701 aa  101  4e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0627534 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3520  hypothetical protein  90.38 
 
 		 655 aa  100  5e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3018  hypothetical protein  90.38 
 
 		 658 aa  100  6e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0413354 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2335  hypothetical protein  90.38 
 
 		 665 aa  99.8  1e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0320  hypothetical protein  88.46 
 
 		 661 aa  98.6  2e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2601  hypothetical protein  83.33 
 
 		 683 aa  98.2  3e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2851  hypothetical protein  61.76 
 
 		 654 aa  89  2e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2091  hypothetical protein  54.29 
 
 		 570 aa  84  7e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3523  hypothetical protein  44.93 
 
 		 694 aa  50.4  0.000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00323115 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3007  hypothetical protein  34.85 
 
 		 707 aa  44.7  0.0005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1067  hypothetical protein  42.11 
 
 		 703 aa  43.9  0.0008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0039  hypothetical protein  34.85 
 
 		 294 aa  42.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2330  hypothetical protein  34.85 
 
 		 683 aa  41.6  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.863672  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>