115 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_3224 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_3224  hypothetical protein  100 
 
 		 71 aa  144  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2365  4-oxalocrotonate tautomerase  72.31 
 
 		 68 aa  100  1e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.710003  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3415  4-oxalocrotonate tautomerase  71.64 
 
 		 74 aa  99  2e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2281  4-oxalocrotonate tautomerase  69.7 
 
 		 68 aa  96.3  1e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.680097  normal  0.165271 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2051  4-oxalocrotonate tautomerase  69.7 
 
 		 72 aa  95.5  2e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0855  4-oxalocrotonate tautomerase  70.31 
 
 		 67 aa  94.7  4e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1550  4-oxalocrotonate tautomerase family protein  67.19 
 
 		 67 aa  92.8  1e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0970  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  65.62 
 
 		 76 aa  91.7  3e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.926455  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4060  4-oxalocrotonate tautomerase  64.06 
 
 		 66 aa  91.7  3e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1969  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  61.54 
 
 		 67 aa  91.7  3e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45080  4-oxalocrotonate tautomerase  65.15 
 
 		 71 aa  91.7  3e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.16237  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0732  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  64.06 
 
 		 68 aa  90.5  7e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.151508  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0011  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  64.62 
 
 		 67 aa  90.5  7e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.369132  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0360  4-oxalocrotonate tautomerase  64.62 
 
 		 67 aa  90.1  8e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000450156 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4071  4-oxalocrotonate tautomerase  62.5 
 
 		 66 aa  90.1  9e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.193506 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0102  4-oxalocrotonate tautomerase  62.5 
 
 		 66 aa  90.1  9e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3098  4-oxalocrotonate tautomerase  64.62 
 
 		 67 aa  90.1  1e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.268479  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2301  4-oxalocrotonate tautomerase  60.94 
 
 		 67 aa  89  2e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.607987  normal  1 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3903  4-oxalocrotonate tautomerase  63.08 
 
 		 65 aa  88.2  4e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4749  4-oxalocrotonate tautomerase  61.9 
 
 		 67 aa  87.8  4e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2575  4-oxalocrotonate tautomerase  55.71 
 
 		 81 aa  87.8  5e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.773055  normal  0.0111474 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2346  4-oxalocrotonate tautomerase  62.32 
 
 		 73 aa  87.4  6e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.141179 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2671  4-oxalocrotonate tautomerase  53.03 
 
 		 68 aa  86.7  9e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4074  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  57.58 
 
 		 67 aa  86.3  1e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0310  4-oxalocrotonate tautomerase  61.54 
 
 		 67 aa  85.9  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1135  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  58.46 
 
 		 68 aa  85.5  2e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0321  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  61.54 
 
 		 67 aa  85.9  2e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.501106  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0332  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  61.54 
 
 		 67 aa  85.9  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.192785  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0762  4-oxalocrotonate tautomerase  53.85 
 
 		 69 aa  84.7  4e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1640  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  59.38 
 
 		 67 aa  84.7  4e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00039965  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1584  4-oxalocrotonate tautomerase  56.92 
 
 		 66 aa  80.9  0.000000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0595401  normal  0.151595 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4577  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  58.46 
 
 		 72 aa  80.9  0.000000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0985205  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2504  4-oxalocrotonate tautomerase  52.24 
 
 		 69 aa  79.7  0.00000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3995  4-oxalocrotonate tautomerase  55.38 
 
 		 72 aa  77.4  0.00000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3281  4-oxalocrotonate tautomerase  54.17 
 
 		 73 aa  77  0.00000000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.324694  normal  0.650212 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0469  hypothetical protein  49.28 
 
 		 69 aa  76.3  0.0000000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0159737  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1271  hypothetical protein  49.28 
 
 		 69 aa  75.5  0.0000000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0377038  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0078  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  47.83 
 
 		 73 aa  75.1  0.0000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.678819  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5684  4-oxalocrotonate tautomerase  57.53 
 
 		 78 aa  72.8  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0576297 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0300  4-oxalocrotonate tautomerase  47.83 
 
 		 72 aa  72  0.000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.457407  normal  0.238672 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1472  hypothetical protein  47.89 
 
 		 71 aa  71.6  0.000000000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1455  hypothetical protein  48.48 
 
 		 76 aa  71.2  0.000000000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.134745  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0818  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  50 
 
 		 76 aa  70.9  0.000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7095  4-oxalocrotonate tautomerase  52.78 
 
 		 78 aa  70.5  0.000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.629117  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0857  hypothetical protein  49.23 
 
 		 76 aa  70.1  0.00000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00289876  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4145  4-oxalocrotonate tautomerase  51.39 
 
 		 78 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.711569  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3914  4-oxalocrotonate tautomerase  47.95 
 
 		 79 aa  66.2  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6827  4-oxalocrotonate tautomerase  43.84 
 
 		 78 aa  62.4  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.484906 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0200  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  45.16 
 
 		 61 aa  59.7  0.00000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1270  4-oxalocrotonate tautomerase  41.07 
 
 		 62 aa  53.5  0.0000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2113  hypothetical protein  40.62 
 
 		 67 aa  52.8  0.000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.867892  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0859  hypothetical protein  28.12 
 
 		 67 aa  50.8  0.000006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5693  4-oxalocrotonate tautomerase  40.62 
 
 		 63 aa  50.1  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2265  putative 4-oxalocrotonate isomerase protein  39.06 
 
 		 63 aa  50.1  0.00001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1403  4-oxalocrotonate tautomerase family protein  32.31 
 
 		 68 aa  49.7  0.00001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4605  4-oxalocrotonate tautomerase  41.07 
 
 		 71 aa  49.3  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1700  4-oxalocrotonate tautomerase family protein  35.38 
 
 		 68 aa  49.7  0.00002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2780  4-oxalocrotonate tautomerase  42.19 
 
 		 63 aa  48.5  0.00003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0155282 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0227  4-oxalocrotonate tautomerase  39.06 
 
 		 63 aa  47.8  0.00005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1805  4-oxalocrotonate tautomerase  40.35 
 
 		 61 aa  47.8  0.00006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0297  4-oxalocrotonate tautomerase family protein  36.92 
 
 		 68 aa  47.4  0.00006  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3104  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  42.19 
 
 		 63 aa  47.4  0.00007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.0069349  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0319  4-oxalocrotonate tautomerase family protein  36.92 
 
 		 68 aa  46.6  0.0001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4616  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  39.06 
 
 		 63 aa  46.6  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.954755  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3540  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  39.06 
 
 		 63 aa  46.6  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.963519  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3339  4-oxalocrotonate tautomerase  39.06 
 
 		 63 aa  45.8  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3465  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  36.67 
 
 		 64 aa  46.2  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0807  4-oxalocrotonate tautomerase  41.07 
 
 		 62 aa  45.1  0.0004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.986407  normal  0.739239 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1138  4-oxalocrotonate tautomerase  36.84 
 
 		 62 aa  45.1  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.412705  normal  0.250867 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1424  4-oxalocrotonate tautomerase  39.29 
 
 		 62 aa  43.9  0.0007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.738733  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1453  4-oxalocrotonate tautomerase  39.29 
 
 		 62 aa  43.9  0.0007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1419  4-oxalocrotonate tautomerase  37.1 
 
 		 74 aa  43.9  0.0007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.910696 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1308  4-oxalocrotonate tautomerase  32.84 
 
 		 70 aa  43.9  0.0008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.11419 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1617  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  41.38 
 
 		 69 aa  43.1  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3847  4-oxalocrotonate tautomerase  34.43 
 
 		 130 aa  43.5  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.544573 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1993  4-oxalocrotonate tautomerase  33.87 
 
 		 69 aa  43.5  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.130331 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4924  4-oxalocrotonate tautomerase  34.43 
 
 		 130 aa  43.5  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4901  4-oxalocrotonate tautomerase  30.3 
 
 		 72 aa  42.4  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3262  4-oxalocrotonate tautomerase  30.3 
 
 		 72 aa  42.4  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.104892 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0336  4-oxalocrotonate tautomerase  36.84 
 
 		 62 aa  42.7  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.796496 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0663  4-oxalocrotonate tautomerase  35.09 
 
 		 62 aa  42.4  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.282079  normal  0.114033 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0325  4-oxalocrotonate tautomerase  36.84 
 
 		 62 aa  42.7  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08790  4-oxalocrotonate tautomerase  41.38 
 
 		 63 aa  42.4  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.86271  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3780  4-oxalocrotonate tautomerase  35.94 
 
 		 63 aa  41.6  0.003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00700044  decreased coverage  0.000166532 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3686  4-oxalocrotonate tautomerase  35.09 
 
 		 62 aa  42  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4681  4-oxalocrotonate tautomerase  35.09 
 
 		 62 aa  42  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.037067 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4012  4-oxalocrotonate tautomerase  33.33 
 
 		 62 aa  42  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.84694 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5619  4-oxalocrotonate tautomerase  35.09 
 
 		 62 aa  42  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.856115  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4534  4-oxalocrotonate tautomerase  35.09 
 
 		 62 aa  41.6  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.199758 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5507  4-oxalocrotonate tautomerase  33.33 
 
 		 61 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5226  4-oxalocrotonate tautomerase  33.33 
 
 		 61 aa  41.6  0.004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5057  4-oxalocrotonate tautomerase  33.33 
 
 		 61 aa  41.6  0.004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5074  4-oxalocrotonate tautomerase  33.33 
 
 		 61 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5626  4-oxalocrotonate tautomerase  33.33 
 
 		 61 aa  41.6  0.004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3899  4-oxalocrotonate tautomerase  33.33 
 
 		 61 aa  41.6  0.004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3427  4-oxalocrotonate tautomerase  31.15 
 
 		 72 aa  41.6  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4872  4-oxalocrotonate tautomerase  37.5 
 
 		 61 aa  41.6  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00584359  normal  0.808556 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5556  4-oxalocrotonate tautomerase  33.33 
 
 		 61 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5500  4-oxalocrotonate tautomerase  33.33 
 
 		 61 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5450  4-oxalocrotonate tautomerase  33.33 
 
 		 61 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>