More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_3141 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_3141  glycogen synthase  100 
 
 		 513 aa  1051    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.335952  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36570  glycogen synthase  96.68 
 
 		 513 aa  1020    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000975999  normal  0.942766 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2277  glycogen synthase  65.47 
 
 		 508 aa  630  1e-179  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.100037  hitchhiker  0.00503982 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3125  glycogen synthase  60.55 
 
 		 484 aa  609  1e-173  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.113633  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2992  glycogen synthase  59.96 
 
 		 532 aa  602  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.840689 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24910  glycogen synthase  62.08 
 
 		 497 aa  590  1e-167  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0688599  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2549  glycogen synthase  59.1 
 
 		 528 aa  580  1e-164  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4050  glycogen synthase  60.54 
 
 		 519 aa  575  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.538974  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1793  glycogen synthase  60.54 
 
 		 519 aa  575  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.834326  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3649  glycogen synthase  60.88 
 
 		 519 aa  573  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0827399  normal  0.458014 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1824  glycogen synthase  59.41 
 
 		 519 aa  568  1e-161  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.142099  normal  0.142129 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3078  glycogen synthase  56.07 
 
 		 509 aa  553  1e-156  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.143266 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5269  glycogen synthase  54.14 
 
 		 513 aa  547  1e-154  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0155  glycogen synthase  55.04 
 
 		 515 aa  542  1e-153  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1596  glycogen synthase  54.37 
 
 		 512 aa  523  1e-147  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0737011 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2025  glycogen synthase  54.09 
 
 		 532 aa  517  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.754717 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2302  glycogen synthase  54.09 
 
 		 510 aa  515  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.207454 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1987  glycogen synthase  52.09 
 
 		 510 aa  510  1e-143  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2800  glycogen synthase  52.64 
 
 		 457 aa  481  1e-134  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.154177  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03376  glycogen synthase  51.18 
 
 		 509 aa  471  1.0000000000000001e-131  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2742  glycogen synthase  42.83 
 
 		 480 aa  369  1e-101  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0716  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  40.21 
 
 		 496 aa  361  2e-98  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.692605  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5024  glycogen synthase  40.85 
 
 		 501 aa  357  2.9999999999999997e-97  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.671586  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1521  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  42.89 
 
 		 481 aa  352  8e-96  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0149677  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0580  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  40.76 
 
 		 485 aa  347  3e-94  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0226  glycogen synthase  40.71 
 
 		 477 aa  342  7e-93  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.239431  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4133  glycogen synthase  40.71 
 
 		 479 aa  341  2e-92  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.638175  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3652  glycogen synthase  39.71 
 
 		 480 aa  341  2e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.577848 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3837  glycogen synthase  41.08 
 
 		 478 aa  339  7e-92  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3350  glycogen synthase  39.42 
 
 		 480 aa  337  2.9999999999999997e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0771  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  40.54 
 
 		 491 aa  337  3.9999999999999995e-91  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2245  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  41.07 
 
 		 485 aa  336  5.999999999999999e-91  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0280  glycogen synthase  40.08 
 
 		 477 aa  336  5.999999999999999e-91  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3934  glycogen synthase  40.71 
 
 		 479 aa  336  7e-91  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0512  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  41.06 
 
 		 494 aa  335  1e-90  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1472  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  39.4 
 
 		 499 aa  335  1e-90  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.176505 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3802  glycogen synthase  40.25 
 
 		 477 aa  333  4e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3844  glycogen synthase  40.25 
 
 		 477 aa  333  4e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.642005 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3725  glycogen synthase  40.25 
 
 		 477 aa  333  4e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3905  glycogen synthase  40.25 
 
 		 477 aa  333  4e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.794179  normal  0.424827 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3736  glycogen synthase  40.25 
 
 		 477 aa  333  4e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1241  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  39.42 
 
 		 476 aa  333  5e-90  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4121  glycogen synthase  41.29 
 
 		 476 aa  331  1e-89  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.533996  normal  0.616678 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0150  glycogen synthase  41.29 
 
 		 476 aa  331  1e-89  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.289574  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3762  glycogen synthase  40.62 
 
 		 478 aa  332  1e-89  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1542  glycogen synthase  41.86 
 
 		 486 aa  331  2e-89  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0874  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  40.86 
 
 		 483 aa  331  2e-89  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.13432  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4644  glycogen synthase  41.13 
 
 		 477 aa  331  2e-89  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.755031 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03281  glycogen synthase  39.87 
 
 		 477 aa  330  5.0000000000000004e-89  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000154159  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0285  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  39.87 
 
 		 477 aa  330  5.0000000000000004e-89  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000266989  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0283  glycogen synthase  39.87 
 
 		 477 aa  330  5.0000000000000004e-89  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0220611  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03234  hypothetical protein  39.87 
 
 		 477 aa  330  5.0000000000000004e-89  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000325312  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3908  glycogen synthase  39.87 
 
 		 477 aa  330  5.0000000000000004e-89  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2057  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  41.94 
 
 		 498 aa  330  5.0000000000000004e-89  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0784111  normal  0.49835 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3629  glycogen synthase  39.87 
 
 		 477 aa  330  5.0000000000000004e-89  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4741  glycogen synthase  39.87 
 
 		 477 aa  330  5.0000000000000004e-89  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3711  glycogen synthase  39.87 
 
 		 477 aa  330  5.0000000000000004e-89  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.23769 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4003  glycogen synthase  41.08 
 
 		 476 aa  329  6e-89  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2120  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  42.18 
 
 		 491 aa  328  1.0000000000000001e-88  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.475623  normal  0.0408655 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3895  glycogen synthase  39.75 
 
 		 477 aa  326  7e-88  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1656  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  41.6 
 
 		 485 aa  325  2e-87  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.902766  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1798  glycogen synthase  41.15 
 
 		 486 aa  322  8e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.135455  normal  0.790238 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2935  glycogen synthase  41.24 
 
 		 486 aa  322  9.000000000000001e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.540363 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5336  glycogen synthase  41.4 
 
 		 544 aa  321  1.9999999999999998e-86  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0149389 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2043  glycogen synthase  42.27 
 
 		 486 aa  319  7e-86  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.405007  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2678  glycogen synthase  40.21 
 
 		 489 aa  313  4.999999999999999e-84  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2303  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  40.21 
 
 		 489 aa  313  4.999999999999999e-84  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0774  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  37.4 
 
 		 489 aa  313  5.999999999999999e-84  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5314  glycogen synthase  41.32 
 
 		 533 aa  312  7.999999999999999e-84  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.713395  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0940  glycogen synthase  40.58 
 
 		 556 aa  311  1e-83  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1435  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  38.2 
 
 		 488 aa  312  1e-83  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0957  glycogen synthase  41.7 
 
 		 483 aa  311  2e-83  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.220032  normal  0.273541 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1465  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  39.29 
 
 		 549 aa  310  5.9999999999999995e-83  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1279  glycogen synthase  40.72 
 
 		 529 aa  308  2.0000000000000002e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0412  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  39.88 
 
 		 495 aa  307  3e-82  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.724768  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2986  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  40.7 
 
 		 508 aa  306  4.0000000000000004e-82  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0599236  normal  0.0755351 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1135  glycogen synthase  38.89 
 
 		 478 aa  306  6e-82  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0344  glycogen synthase  38.72 
 
 		 482 aa  305  1.0000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.496916 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1531  glycogen synthase  38.93 
 
 		 484 aa  304  2.0000000000000002e-81  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.292938 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2885  glycogen synthase  38.93 
 
 		 484 aa  304  2.0000000000000002e-81  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.890574  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0386  glycogen synthase  38.02 
 
 		 483 aa  303  3.0000000000000004e-81  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0512  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  35.92 
 
 		 491 aa  302  8.000000000000001e-81  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0383001  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1476  glycogen synthase  38.85 
 
 		 493 aa  302  9e-81  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0886  glycogen synthase  36.1 
 
 		 479 aa  302  9e-81  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0612  glycogen synthase  39.88 
 
 		 489 aa  301  3e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0441  glycogen synthase  38.3 
 
 		 482 aa  300  5e-80  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3940  glycogen synthase  38.91 
 
 		 543 aa  300  5e-80  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.844931  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4053  glycogen synthase  38.91 
 
 		 543 aa  300  5e-80  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4276  glycogen synthase  38.38 
 
 		 486 aa  299  7e-80  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.377869  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4426  glycogen synthase  40.29 
 
 		 467 aa  297  3e-79  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1890  glycogen synthase  37.7 
 
 		 487 aa  295  1e-78  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.601172 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0213  glycogen synthase  39.75 
 
 		 483 aa  294  2e-78  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1284  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  35.43 
 
 		 488 aa  293  7e-78  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000203443  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2954  glycogen synthase  39.63 
 
 		 484 aa  292  8e-78  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0132  glycogen synthase  37.68 
 
 		 479 aa  291  2e-77  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1107  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  40.74 
 
 		 494 aa  291  2e-77  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.686449  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3115  glycogen synthase  37.73 
 
 		 472 aa  290  5.0000000000000004e-77  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.641899 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0135  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  41.49 
 
 		 475 aa  288  1e-76  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.990604  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1322  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  35.05 
 
 		 500 aa  288  1e-76  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3463  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  35.74 
 
 		 486 aa  287  2.9999999999999996e-76  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>