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for query gene PSPA7_2320 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



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Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_2320  major facilitator transporter  100 
 
 
544 aa  1069    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0793665  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27430  putative multidrug efflux MFS transporter  93.01 
 
 
530 aa  970    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0744165  normal  0.700486 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0142  major facilitator transporter  64.37 
 
 
511 aa  580  1e-164  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1271  major facilitator transporter  60.28 
 
 
513 aa  572  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4577  major facilitator transporter  59.68 
 
 
513 aa  572  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.487464  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0872  major facilitator transporter  60.2 
 
 
513 aa  570  1e-161  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46380  major facilitator superfamily protein  59.06 
 
 
518 aa  569  1e-161  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4454  major facilitator transporter  60.08 
 
 
513 aa  550  1e-155  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.544324  normal  0.740147 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5000  major facilitator transporter  54.73 
 
 
535 aa  548  1e-154  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.159102 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3380  major facilitator superfamily MFS_1  56.46 
 
 
509 aa  542  1e-153  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.188058 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2125  major facilitator superfamily MFS_1  55.43 
 
 
537 aa  537  1e-151  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1697  major facilitator superfamily MFS_1  55.65 
 
 
499 aa  535  1e-151  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1705  major facilitator superfamily MFS_1  55.3 
 
 
553 aa  517  1.0000000000000001e-145  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4488  major facilitator transporter  51.58 
 
 
541 aa  506  9.999999999999999e-143  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2303  major facilitator superfamily MFS_1  48.68 
 
 
545 aa  508  9.999999999999999e-143  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.292812  normal  0.0663224 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2500  major facilitator transporter  47.85 
 
 
577 aa  484  1e-135  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.706515  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1333  major facilitator transporter  50.68 
 
 
535 aa  467  9.999999999999999e-131  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2527  major facilitator superfamily MFS_1  41.83 
 
 
522 aa  380  1e-104  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1156  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  42.97 
 
 
524 aa  378  1e-103  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.783022  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6435  major facilitator superfamily MFS_1  43.25 
 
 
509 aa  340  2.9999999999999998e-92  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00900  inner membrane multidrug resistance transmembrane protein  44.53 
 
 
498 aa  338  1.9999999999999998e-91  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.976104 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1820  putative transporter protein  40.74 
 
 
457 aa  307  3e-82  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.398976  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3991  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.07 
 
 
527 aa  263  8.999999999999999e-69  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1814  major facilitator superfamily MFS_1  31.35 
 
 
522 aa  231  3e-59  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0912576 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1506  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.64 
 
 
516 aa  228  2e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1975  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.25 
 
 
516 aa  222  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.211725  hitchhiker  0.00374336 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3785  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.25 
 
 
516 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0929459  normal  0.428314 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1623  putative transport protein (permease)  33.13 
 
 
545 aa  218  2e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1991  MFS family transporter  32.1 
 
 
519 aa  218  2e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.332362  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2736  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.59 
 
 
517 aa  217  5e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.545703 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23520  putative MFS transporter  32.06 
 
 
499 aa  216  9.999999999999999e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0341451 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1876  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.96 
 
 
516 aa  214  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.803136  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5997  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30 
 
 
529 aa  213  1e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.378354  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0525  drug resistance transporter, EmrB/QacA family protein  29.96 
 
 
539 aa  211  2e-53  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0523  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.42 
 
 
535 aa  209  1e-52  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0524  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.3 
 
 
535 aa  207  4e-52  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3508  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.1 
 
 
535 aa  204  4e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.87525  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0483  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.86 
 
 
542 aa  202  9e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4522  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.66 
 
 
526 aa  202  9.999999999999999e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.121498 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0453  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.49 
 
 
526 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3786  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.86 
 
 
542 aa  201  3e-50  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3842  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.86 
 
 
542 aa  201  3e-50  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3968  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.86 
 
 
542 aa  201  3e-50  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2017  MFS transporter  26.04 
 
 
534 aa  198  2.0000000000000003e-49  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.775296  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3405  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.84 
 
 
538 aa  196  7e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3278  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.21 
 
 
539 aa  194  3e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.629429  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6487  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.94 
 
 
527 aa  191  2e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0500  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.08 
 
 
543 aa  191  2.9999999999999997e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.667013  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0835  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.31 
 
 
536 aa  186  1.0000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.861502 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6362  major facilitator transporter  30.71 
 
 
526 aa  185  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1466  major facilitator transporter  30.71 
 
 
526 aa  185  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0127999  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0955  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.51 
 
 
539 aa  185  2.0000000000000003e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2981  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.91 
 
 
540 aa  183  7e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1607  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.34 
 
 
535 aa  182  1e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.798645  hitchhiker  0.000105098 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7029  major facilitator transporter  30.5 
 
 
526 aa  182  1e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.97831  normal  0.626046 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0403  drug resistance transporter, EmrB/QacA family protein  27.87 
 
 
529 aa  182  1e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5591  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter EmrB/QacA subfamily  28.89 
 
 
524 aa  182  1e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0208  major facilitator transporter  29.01 
 
 
527 aa  182  2e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.639267 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3453  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.42 
 
 
519 aa  172  2e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4286  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.71 
 
 
527 aa  171  3e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.146244  normal  0.252791 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3193  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.17 
 
 
527 aa  171  3e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4967  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.17 
 
 
527 aa  171  3e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.13795  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6590  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.78 
 
 
523 aa  168  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.236346 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2113  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.4 
 
 
514 aa  164  3e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4968  major facilitator transporter  29.28 
 
 
529 aa  162  1e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0130308 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2067  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.39 
 
 
527 aa  161  2e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.851411 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2927  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.77 
 
 
530 aa  160  7e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.401426  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4020  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.16 
 
 
518 aa  159  1e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.490791  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3676  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.06 
 
 
504 aa  158  2e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3794  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.9 
 
 
530 aa  155  1e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.14668  normal  0.421617 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2415  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.24 
 
 
517 aa  155  2e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4313  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter EmrB/QacA subfamily  28.97 
 
 
519 aa  155  2e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.221142 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3627  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.87 
 
 
528 aa  154  4e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.126338  normal  0.617009 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3900  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.87 
 
 
528 aa  154  4e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.645893  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2192  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.54 
 
 
528 aa  154  4e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.024166  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4466  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.87 
 
 
528 aa  154  4e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.87368  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3794  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.83 
 
 
528 aa  153  8.999999999999999e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.354181 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3275  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.63 
 
 
528 aa  153  8.999999999999999e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3584  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  29.08 
 
 
531 aa  152  1e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00201825  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2631  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.5 
 
 
515 aa  152  1e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.383083  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6206  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.23 
 
 
520 aa  151  3e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3596  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.19 
 
 
516 aa  151  3e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.692302 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2706  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.96 
 
 
537 aa  151  3e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4683  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.11 
 
 
529 aa  150  4e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.20572  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1604  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.28 
 
 
515 aa  150  5e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3361  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.85 
 
 
535 aa  149  9e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.182834  hitchhiker  0.000000000000491163 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1714  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.67 
 
 
532 aa  149  2.0000000000000003e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.140819  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0239  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.74 
 
 
536 aa  147  4.0000000000000006e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7472  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  25.15 
 
 
543 aa  146  9e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1631  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  25.39 
 
 
521 aa  145  2e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1516  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.69 
 
 
527 aa  144  4e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_010557  BamMC406_5573  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.35 
 
 
517 aa  144  4e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2025  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.35 
 
 
533 aa  143  8e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4495  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.49 
 
 
526 aa  143  9e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0608194  normal  0.157501 
 
 
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NC_010717  PXO_00460  transport protein  26 
 
 
528 aa  143  9.999999999999999e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0564548  n/a   
 
 
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NC_008392  Bamb_5791  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.72 
 
 
517 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0859755  normal  0.838213 
 
 
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NC_010623  Bphy_5195  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.73 
 
 
577 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.440847  normal  0.0484708 
 
 
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NC_008009  Acid345_3094  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.35 
 
 
532 aa  141  3e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_010681  Bphyt_2022  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.31 
 
 
520 aa  141  3e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00497968 
 
 
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NC_008463  PA14_48300  putative MFS transporter  28.22 
 
 
503 aa  141  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.966541  normal  0.132172 
 
 
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