More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_4430 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_4430  threonine dehydratase  100 
 
 		 330 aa  656    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000773933 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3864  threonine dehydratase  57.49 
 
 		 330 aa  353  2e-96  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4376  ectoine utilization protein EutB  65.81 
 
 		 325 aa  350  2e-95  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6145  threonine dehydratase  58.82 
 
 		 323 aa  350  3e-95  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5805  threonine dehydratase  60.13 
 
 		 323 aa  342  4e-93  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6169  threonine dehydratase  60.13 
 
 		 323 aa  342  4e-93  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0794807  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6650  threonine dehydratase  61.75 
 
 		 323 aa  339  4e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.987033  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5774  threonine dehydratase  56.04 
 
 		 323 aa  338  8e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.154998  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6018  threonine dehydratase  56.04 
 
 		 323 aa  337  9.999999999999999e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0056  threonine dehydratase  57.88 
 
 		 344 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.595  hitchhiker  0.00751641 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5519  threonine dehydratase  59.26 
 
 		 333 aa  333  2e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0114285 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3469  threonine dehydratase  56.25 
 
 		 324 aa  323  3e-87  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5240  threonine dehydratase  58.22 
 
 		 333 aa  321  9.999999999999999e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.303967 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3695  threonine dehydratase  57.28 
 
 		 334 aa  319  3e-86  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2151  threonine dehydratase  61.36 
 
 		 319 aa  313  2.9999999999999996e-84  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.232832  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000638  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme beta subunit  51.17 
 
 		 324 aa  279  5e-74  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0285  threonine dehydratase  54.55 
 
 		 318 aa  275  9e-73  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.832074  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3175  threonine dehydratase  58.96 
 
 		 318 aa  241  1e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.465407  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2723  threonine dehydratase  48.12 
 
 		 331 aa  234  1.0000000000000001e-60  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09310  threonine dehydratase  39.31 
 
 		 403 aa  227  2e-58  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000321864  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3597  threonine dehydratase  43.04 
 
 		 403 aa  224  1e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.35441  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0097  threonine dehydratase  40.57 
 
 		 405 aa  222  7e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1014  threonine dehydratase  38.63 
 
 		 403 aa  212  9e-54  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0965  threonine dehydratase  37.38 
 
 		 403 aa  211  2e-53  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1057  threonine dehydratase  41.29 
 
 		 402 aa  208  1e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1474  threonine dehydratase  38.29 
 
 		 403 aa  208  1e-52  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8547  threonine dehydratase  42.02 
 
 		 402 aa  206  4e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1062  threonine dehydratase  39.93 
 
 		 402 aa  206  5e-52  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0280706  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1187  threonine dehydratase  38.02 
 
 		 403 aa  205  7e-52  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.296768  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0865  threonine dehydratase  42.35 
 
 		 406 aa  205  8e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.708894  normal  0.0742081 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3448  L-threonine ammonia-lyase  43.22 
 
 		 403 aa  204  1e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3529  threonine dehydratase  43.04 
 
 		 403 aa  204  2e-51  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.10963  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3556  threonine dehydratase  42.41 
 
 		 403 aa  204  2e-51  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.597428  normal  0.136455 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0915  threonine dehydratase  37.38 
 
 		 403 aa  203  3e-51  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0845  threonine dehydratase  37.38 
 
 		 403 aa  203  4e-51  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1368  threonine dehydratase  36.94 
 
 		 402 aa  201  9.999999999999999e-51  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0833542  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1143  threonine dehydratase  38.06 
 
 		 400 aa  201  1.9999999999999998e-50  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1331  threonine dehydratase  37.62 
 
 		 401 aa  200  1.9999999999999998e-50  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2084  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  40.69 
 
 		 332 aa  200  1.9999999999999998e-50  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.432383  normal  0.0544348 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1181  threonine dehydratase  37.06 
 
 		 402 aa  200  3e-50  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000071198  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0722  threonine ammonia-lyase, biosynthetic  39.17 
 
 		 506 aa  199  5e-50  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.130399  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0870  threonine dehydratase, biosynthetic  39.17 
 
 		 506 aa  199  5e-50  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2979  threonine dehydratase  41.91 
 
 		 415 aa  199  6e-50  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1494  threonine dehydratase  34.28 
 
 		 404 aa  199  6e-50  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3416  threonine dehydratase, biosynthetic  39.07 
 
 		 501 aa  197  2.0000000000000003e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000175327 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1852  threonine dehydratase  35.85 
 
 		 402 aa  195  8.000000000000001e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000042395  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0349  threonine dehydratase  40.32 
 
 		 403 aa  195  1e-48  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.626504  normal  0.139043 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0611  threonine dehydratase  39.94 
 
 		 408 aa  194  2e-48  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0341122  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31840  threonine dehydratase  44.77 
 
 		 401 aa  194  2e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.67382 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0727  threonine dehydratase  43.32 
 
 		 411 aa  193  4e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0405  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  43.15 
 
 		 315 aa  192  7e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0956264  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0743  threonine dehydratase  34.89 
 
 		 403 aa  192  8e-48  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00847234  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0564  threonine dehydratase  39.62 
 
 		 401 aa  192  9e-48  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0579  threonine dehydratase  39.62 
 
 		 401 aa  192  9e-48  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1526  threonine dehydratase  42.19 
 
 		 403 aa  190  2.9999999999999997e-47  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.148383  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1794  threonine dehydratase  39.46 
 
 		 514 aa  190  2.9999999999999997e-47  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.306428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08511  threonine dehydratase  35.5 
 
 		 514 aa  188  1e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.306662  hitchhiker  0.00240564 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0066  threonine dehydratase  40.79 
 
 		 358 aa  188  1e-46  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0128  threonine dehydratase  37.16 
 
 		 503 aa  187  2e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3034  threonine dehydratase  38.54 
 
 		 403 aa  187  2e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5602  putative threonine dehydratase  38.66 
 
 		 363 aa  187  3e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0801  threonine dehydratase  44.19 
 
 		 407 aa  187  3e-46  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.103174  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2736  threonine dehydratase  38.49 
 
 		 507 aa  186  4e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2763  threonine dehydratase  38.16 
 
 		 507 aa  186  4e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1498  threonine dehydratase  40.84 
 
 		 421 aa  186  5e-46  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0935  threonine dehydratase  42.81 
 
 		 412 aa  186  6e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.801427  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6064  threonine dehydratase  38.16 
 
 		 507 aa  185  8e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2124  threonine dehydratase  39.06 
 
 		 507 aa  185  8e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.619437  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0449  threonine dehydratase  36.72 
 
 		 507 aa  184  1.0000000000000001e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.545287 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1720  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  38.15 
 
 		 330 aa  185  1.0000000000000001e-45  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3125  L-threonine ammonia-lyase  36.15 
 
 		 526 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00487268  normal  0.103539 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3112  threonine dehydratase  41.1 
 
 		 404 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.467281  hitchhiker  0.00000283159 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0125  threonine dehydratase  35.42 
 
 		 408 aa  184  2.0000000000000003e-45  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2925  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein subunit beta  40.69 
 
 		 318 aa  184  2.0000000000000003e-45  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.412032 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1068  threonine dehydratase  35.33 
 
 		 509 aa  184  3e-45  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0733  threonine dehydratase  36.68 
 
 		 515 aa  183  3e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.880513  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1075  threonine dehydratase  40.38 
 
 		 405 aa  182  5.0000000000000004e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.986828  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2636  threonine dehydratase  41.18 
 
 		 402 aa  181  1e-44  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2432  threonine dehydratase  38.39 
 
 		 402 aa  181  2e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4230  threonine dehydratase  44.85 
 
 		 412 aa  181  2e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0941557  normal  0.0780597 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0834  threonine dehydratase  38.29 
 
 		 403 aa  181  2e-44  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4707  threonine dehydratase  37.74 
 
 		 414 aa  179  4e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.832283  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0011  threonine dehydratase  38.71 
 
 		 402 aa  179  4e-44  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.059163  normal  0.133507 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3072  threonine dehydratase  37.9 
 
 		 402 aa  180  4e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0067161  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2929  threonine dehydratase  37.21 
 
 		 520 aa  179  4.999999999999999e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.333132 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1165  threonine dehydratase  38.26 
 
 		 412 aa  179  5.999999999999999e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.499375  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1894  threonine dehydratase  39.06 
 
 		 408 aa  179  8e-44  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.878805  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3301  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  41.64 
 
 		 317 aa  178  1e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0872906  normal  0.454353 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1915  threonine dehydratase  35.67 
 
 		 411 aa  178  1e-43  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1660  threonine dehydratase  41.58 
 
 		 403 aa  178  1e-43  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0212485 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0944  threonine dehydratase  34.55 
 
 		 395 aa  178  1e-43  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.463198  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0929  threonine dehydratase  37.21 
 
 		 527 aa  177  1e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.767774 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4419  threonine dehydratase  42.3 
 
 		 403 aa  177  2e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0945  threonine dehydratase  35.62 
 
 		 418 aa  177  2e-43  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2749  serine/threonine dehydratase  34.17 
 
 		 329 aa  177  2e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.976068  normal  0.188122 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0922  threonine dehydratase  42.02 
 
 		 403 aa  177  2e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.411143  normal  0.511297 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0979  threonine dehydratase  41.29 
 
 		 404 aa  177  2e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0644  threonine dehydratase  35.84 
 
 		 549 aa  177  2e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0883544 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2666  threonine dehydratase  34.64 
 
 		 509 aa  177  3e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0175  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  33.98 
 
 		 320 aa  177  3e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.165744  normal  0.392847 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>