41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_1368 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_1368  hypothetical protein  100 
 
 		 330 aa  639    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.180848 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4355  hypothetical protein  99.39 
 
 		 330 aa  636    Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00100984  normal  0.0179088 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4446  hypothetical protein  90.76 
 
 		 330 aa  545  1e-154  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000651496  hitchhiker  0.0000161544 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1008  hypothetical protein  83.03 
 
 		 330 aa  539  9.999999999999999e-153  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00036444  hitchhiker  0.0000000000115467 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4434  hypothetical protein  61.74 
 
 		 332 aa  363  2e-99  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.113493  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56050  hypothetical protein  58.33 
 
 		 333 aa  350  2e-95  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4881  hypothetical protein  60 
 
 		 333 aa  349  4e-95  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.562243  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17930  hypothetical protein  58.64 
 
 		 330 aa  259  5.0000000000000005e-68  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00558926  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1222  hypothetical protein  49.68 
 
 		 330 aa  230  2e-59  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.997837  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1651  hypothetical protein  36.16 
 
 		 334 aa  163  4.0000000000000004e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0104013  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1712  hypothetical protein  26.77 
 
 		 352 aa  79.7  0.00000000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0961  hypothetical protein  23.4 
 
 		 340 aa  68.9  0.0000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1781  hypothetical protein  25.57 
 
 		 346 aa  67.4  0.0000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2070  hypothetical protein  23.01 
 
 		 338 aa  66.6  0.0000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.161421  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2216  integral membrane protein  23.36 
 
 		 347 aa  65.1  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0546223 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17180  conserved hypothetical protein TIGR00374  22.73 
 
 		 342 aa  62.4  0.00000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1276  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha and beta chains-like protein  22.33 
 
 		 347 aa  62  0.00000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.868596 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1275  hypothetical protein  21.78 
 
 		 347 aa  60.1  0.00000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1443  hypothetical protein  21.25 
 
 		 340 aa  58.9  0.0000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1230  hypothetical protein  27.04 
 
 		 337 aa  58.9  0.0000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000527304 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2249  hypothetical protein  21.56 
 
 		 344 aa  57.8  0.0000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3520  hypothetical protein  25.49 
 
 		 339 aa  57.4  0.0000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09870  conserved hypothetical protein TIGR00374  21.26 
 
 		 352 aa  57.4  0.0000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1257  hypothetical protein  21.75 
 
 		 366 aa  57  0.0000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00000018752  normal  0.209027 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1115  hypothetical protein  21.79 
 
 		 337 aa  54.7  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2008  integral membrane protein  32.71 
 
 		 348 aa  53.5  0.000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000264184  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0389  integral membrane protein  24.83 
 
 		 345 aa  51.2  0.00002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0650  integral membrane protein  30.4 
 
 		 342 aa  50.1  0.00005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.182615  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1947  hypothetical protein  27.47 
 
 		 315 aa  49.7  0.00007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.789852  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0782  hypothetical protein  34.78 
 
 		 339 aa  48.1  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1012  hypothetical protein  28.14 
 
 		 323 aa  48.5  0.0002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.58279 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0199  hypothetical protein  24.82 
 
 		 330 aa  47.8  0.0002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.383692  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3529  hypothetical protein  27.59 
 
 		 327 aa  47  0.0004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2791  hypothetical protein  33.86 
 
 		 309 aa  46.6  0.0006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0043  hypothetical protein  22.36 
 
 		 363 aa  46.2  0.0008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0622  hypothetical protein  25.17 
 
 		 358 aa  45.4  0.001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1965  hypothetical protein  31.36 
 
 		 320 aa  45.8  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2758  hypothetical protein  28.67 
 
 		 301 aa  45.4  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.823957  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1321  hypothetical protein  30.09 
 
 		 337 aa  45.8  0.001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000273017  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2537  hypothetical protein  32.26 
 
 		 341 aa  43.1  0.007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4029  hypothetical protein  24.82 
 
 		 326 aa  42.4  0.01  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.579086 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>