More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMT9312_1708 on replicon NC_007577
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9312



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008816  A9601_18251  Holliday junction DNA helicase RuvB  91.48 
 
 
352 aa  651    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.159071  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1708  Holliday junction DNA helicase RuvB  100 
 
 
352 aa  711    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18071  Holliday junction DNA helicase RuvB  90.06 
 
 
352 aa  641    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18041  Holliday junction DNA helicase RuvB  75.85 
 
 
352 aa  548  1e-155  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17401  Holliday junction DNA helicase RuvB  52.16 
 
 
348 aa  371  1e-102  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1192  Holliday junction DNA helicase RuvB  51.88 
 
 
356 aa  367  1e-100  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20671  Holliday junction DNA helicase RuvB  51.88 
 
 
356 aa  366  1e-100  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2534  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.92 
 
 
360 aa  348  8e-95  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.113994 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3579  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.92 
 
 
360 aa  348  8e-95  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01931  Holliday junction DNA helicase RuvB  49.42 
 
 
398 aa  342  5.999999999999999e-93  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0162  Holliday junction DNA helicase RuvB  50 
 
 
347 aa  341  1e-92  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1365  Holliday junction DNA helicase RuvB  52.05 
 
 
386 aa  340  2e-92  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.191372  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0835  Holliday junction DNA helicase RuvB  49.3 
 
 
375 aa  339  4e-92  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0909626  normal  0.910265 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1008  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.25 
 
 
366 aa  338  9e-92  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000228051  hitchhiker  0.00140746 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1892  Holliday junction DNA helicase RuvB  47.55 
 
 
371 aa  336  3.9999999999999995e-91  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.912644  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2503  Holliday junction DNA helicase RuvB  50.15 
 
 
370 aa  335  5.999999999999999e-91  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.54699  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0118  Holliday junction DNA helicase RuvB  48.99 
 
 
348 aa  327  1.0000000000000001e-88  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0130464 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1554  Holliday junction DNA helicase RuvB  50.79 
 
 
366 aa  323  3e-87  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0582053 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1454  Holliday junction DNA helicase RuvB  50.65 
 
 
338 aa  317  2e-85  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00617754  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12310  Holliday junction DNA helicase RuvB  47.56 
 
 
342 aa  313  1.9999999999999998e-84  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0273996  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1630  Holliday junction DNA helicase RuvB  48.51 
 
 
347 aa  313  2.9999999999999996e-84  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.952442  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1348  Holliday junction DNA helicase RuvB  49.06 
 
 
335 aa  313  3.9999999999999997e-84  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000729469  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4500  Holliday junction DNA helicase RuvA  46.11 
 
 
541 aa  310  2e-83  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000049576 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0528  Holliday junction DNA helicase RuvB  48.77 
 
 
338 aa  308  6.999999999999999e-83  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2173  Holliday junction DNA helicase RuvB  48.92 
 
 
338 aa  308  9e-83  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4505  Holliday junction DNA helicase RuvB  46.32 
 
 
333 aa  306  2.0000000000000002e-82  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00121958  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4153  Holliday junction DNA helicase RuvB  45.9 
 
 
336 aa  306  2.0000000000000002e-82  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000576232  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4164  Holliday junction DNA helicase RuvB  45.9 
 
 
336 aa  306  2.0000000000000002e-82  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000669292  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3137  Holliday junction DNA helicase RuvB  46.63 
 
 
333 aa  307  2.0000000000000002e-82  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000701371  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4554  Holliday junction DNA helicase RuvB  46.32 
 
 
333 aa  306  2.0000000000000002e-82  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00514849  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1205  Holliday junction DNA helicase RuvB  46.08 
 
 
334 aa  306  3e-82  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0781696  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4315  Holliday junction DNA helicase RuvB  45.9 
 
 
336 aa  306  4.0000000000000004e-82  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0417721  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4539  Holliday junction DNA helicase RuvB  46.32 
 
 
333 aa  306  5.0000000000000004e-82  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000348871  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4267  Holliday junction DNA helicase RuvB  48.85 
 
 
333 aa  306  5.0000000000000004e-82  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000359024  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0696  Holliday junction DNA helicase RuvB  48.52 
 
 
333 aa  306  5.0000000000000004e-82  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000306713  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1796  Holliday junction DNA helicase subunit RuvB  46.39 
 
 
341 aa  305  6e-82  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000827733 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4650  Holliday junction DNA helicase RuvB  46.32 
 
 
333 aa  305  7e-82  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000830982  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0927  Holliday junction DNA helicase RuvB  49.07 
 
 
333 aa  305  9.000000000000001e-82  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1334  Holliday junction DNA helicase RuvB  47.96 
 
 
336 aa  304  1.0000000000000001e-81  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00146189  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2321  Holliday junction DNA helicase RuvB  48.43 
 
 
338 aa  302  5.000000000000001e-81  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0801363  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1116  Holliday junction DNA helicase RuvB  48.28 
 
 
338 aa  301  1e-80  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.848994  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0746  Holliday junction DNA helicase RuvB  48.59 
 
 
338 aa  301  1e-80  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0364799  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2521  Holliday junction DNA helicase RuvB  49.51 
 
 
333 aa  300  2e-80  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000139422  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0182  Holliday junction DNA helicase RuvB  45.92 
 
 
330 aa  300  3e-80  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.107724  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1077  Holliday junction DNA helicase RuvB  50.17 
 
 
338 aa  299  5e-80  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.413326  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0684  Holliday junction DNA helicase RuvB  47.57 
 
 
329 aa  299  5e-80  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0676931  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1731  Holliday junction DNA helicase RuvB  46.39 
 
 
334 aa  298  9e-80  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.707795  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1698  Holliday junction DNA helicase RuvB  46.39 
 
 
334 aa  298  9e-80  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2425  Holliday junction DNA helicase RuvB  49.21 
 
 
347 aa  298  1e-79  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0803389 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1413  Holliday junction DNA helicase RuvB  50.5 
 
 
338 aa  298  1e-79  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000447105  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3053  Holliday junction DNA helicase RuvB  48.58 
 
 
347 aa  297  2e-79  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00505613  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0415  Holliday junction DNA helicase RuvB  49.03 
 
 
339 aa  297  2e-79  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1111  Holliday junction DNA helicase RuvB  49.83 
 
 
336 aa  296  3e-79  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000117425  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0319  Holliday junction DNA helicase RuvB  48.99 
 
 
329 aa  296  3e-79  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.153675  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1431  Holliday junction DNA helicase RuvB  47.85 
 
 
344 aa  296  3e-79  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000941483  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0471  Holliday junction DNA helicase RuvB  50.67 
 
 
343 aa  296  3e-79  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0930  Holliday junction DNA helicase RuvB  49.06 
 
 
337 aa  295  7e-79  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.08899e-19 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1449  Holliday junction DNA helicase RuvB  44.92 
 
 
336 aa  294  1e-78  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1662  Holliday junction DNA helicase RuvB  45.74 
 
 
344 aa  295  1e-78  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.280554  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0894  Holliday junction DNA helicase RuvB  46.73 
 
 
340 aa  294  2e-78  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00558721  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2344  Holliday junction DNA helicase RuvB  49.83 
 
 
345 aa  293  2e-78  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.187034 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15080  Holliday junction DNA helicase subunit RuvB  45.75 
 
 
374 aa  293  2e-78  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.400622  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1362  Holliday junction DNA helicase RuvB  44.58 
 
 
344 aa  294  2e-78  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0922453  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2637  Holliday junction DNA helicase RuvB  46.75 
 
 
346 aa  294  2e-78  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3316  Holliday junction DNA helicase RuvB  47.68 
 
 
337 aa  293  3e-78  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2652  Holliday junction DNA helicase RuvB  47.44 
 
 
340 aa  292  5e-78  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1534  Holliday junction DNA helicase RuvB  45.31 
 
 
336 aa  292  5e-78  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0893  Holliday junction DNA helicase RuvB  47.02 
 
 
355 aa  292  7e-78  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0248566  normal  0.109317 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0868  Holliday junction DNA helicase RuvB  49.5 
 
 
350 aa  292  7e-78  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.281028  normal  0.0371389 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2429  Holliday junction DNA helicase RuvB  47.83 
 
 
336 aa  291  1e-77  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00769793  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1452  Holliday junction DNA helicase RuvB  46.37 
 
 
325 aa  291  2e-77  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00467826  normal  0.361815 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0612  Holliday junction DNA helicase RuvB  47 
 
 
351 aa  290  2e-77  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1702  Holliday junction DNA helicase RuvB  45.03 
 
 
346 aa  290  3e-77  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.131783  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1645  Holliday junction DNA helicase RuvB  45.03 
 
 
346 aa  290  3e-77  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.919299  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0993  Holliday junction DNA helicase RuvB  46.63 
 
 
339 aa  290  3e-77  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0776035  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1889  Holliday junction DNA helicase RuvB  46.15 
 
 
337 aa  289  4e-77  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0384  Holliday junction DNA helicase RuvB  48.83 
 
 
336 aa  289  5.0000000000000004e-77  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0184856  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1213  Holliday junction DNA helicase RuvB  45.34 
 
 
346 aa  289  5.0000000000000004e-77  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1089  Holliday junction DNA helicase RuvB  45.06 
 
 
350 aa  289  6e-77  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.267927  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2338  Holliday junction DNA helicase RuvB  47.83 
 
 
341 aa  288  9e-77  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2145  Holliday junction DNA helicase RuvB  45.14 
 
 
334 aa  288  1e-76  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.189271  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3625  Holliday junction DNA helicase RuvB  44.98 
 
 
348 aa  287  2e-76  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.528643  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2295  Holliday junction DNA helicase RuvB  48.49 
 
 
354 aa  287  2e-76  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.697474  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3516  Holliday junction DNA helicase RuvB  44.89 
 
 
346 aa  287  2e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3221  Holliday junction DNA helicase RuvB  44.89 
 
 
346 aa  287  2e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1678  Holliday junction DNA helicase RuvB  48.66 
 
 
337 aa  286  2.9999999999999996e-76  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4541  Holliday junction DNA helicase RuvB  44.98 
 
 
352 aa  286  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4093  Holliday junction DNA helicase RuvB  45.91 
 
 
354 aa  286  2.9999999999999996e-76  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3832  Holliday junction DNA helicase RuvB  47.12 
 
 
351 aa  286  2.9999999999999996e-76  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2117  Holliday junction DNA helicase RuvB  45.48 
 
 
337 aa  286  4e-76  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51780  Holliday junction DNA helicase RuvB  44.98 
 
 
352 aa  286  5e-76  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000261912 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4269  Holliday junction DNA helicase RuvB  45.37 
 
 
348 aa  285  5.999999999999999e-76  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.812802  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1272  Holliday junction DNA helicase RuvB  44.37 
 
 
350 aa  285  7e-76  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.197391  normal  0.338771 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4407  Holliday junction DNA helicase RuvB  44.83 
 
 
353 aa  285  7e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.010592  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2533  Holliday junction DNA helicase RuvB  44.17 
 
 
344 aa  285  7e-76  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.26511  normal  0.321859 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3694  Holliday junction DNA helicase RuvB  43.7 
 
 
356 aa  285  7e-76  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.500554  normal  0.619697 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0737  Holliday junction DNA helicase RuvB  46.6 
 
 
340 aa  285  9e-76  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0404  Holliday junction DNA helicase RuvB  48.5 
 
 
331 aa  285  9e-76  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2429  Holliday junction DNA helicase RuvB  45.67 
 
 
334 aa  285  1.0000000000000001e-75  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1883  Holliday junction DNA helicase RuvB  43.57 
 
 
337 aa  285  1.0000000000000001e-75  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.679092  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>