More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMT9312_0172 on replicon NC_007577
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9312



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009091  P9301_01901  NifS-like aminotransferase class-V  89.5 
 
 		 381 aa  699    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01881  NifS-like aminotransferase class-V  89.5 
 
 		 381 aa  697    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0172  nifS-like aminotransferase class-V  100 
 
 		 381 aa  768    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01991  NifS-like aminotransferase class-V  74.8 
 
 		 381 aa  595  1e-169  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.117256  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01881  NifS-like aminotransferase class-V  51.18 
 
 		 390 aa  409  1e-113  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27201  NifS-like aminotransferase class-V  48.41 
 
 		 402 aa  400  9.999999999999999e-111  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1538  NifS-like aminotransferase class-V  53.54 
 
 		 382 aa  394  1e-108  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02451  NifS-like aminotransferase class-V  53.28 
 
 		 382 aa  394  1e-108  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2429  NifS-like aminotransferase class-V  48.88 
 
 		 354 aa  367  1e-100  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0534136  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2109  NifS-like aminotransferase class-V  46.63 
 
 		 354 aa  350  2e-95  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2558  cysteine desulfurase NifS  43.34 
 
 		 388 aa  327  2.0000000000000001e-88  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.947611  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1063  aminotransferase class V  42.23 
 
 		 388 aa  306  5.0000000000000004e-82  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1092  Cysteine desulfurase  42.23 
 
 		 388 aa  304  2.0000000000000002e-81  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.793736 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3449  cysteine desulfurase  42.23 
 
 		 389 aa  303  4.0000000000000003e-81  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2217  cysteine desulfurase  41.73 
 
 		 407 aa  301  1e-80  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1708  cysteine desulfurase  41.73 
 
 		 407 aa  301  1e-80  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3103  cysteine desulfurase  41.73 
 
 		 407 aa  301  1e-80  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.412431  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2733  cysteine desulfurase  41.99 
 
 		 407 aa  301  1e-80  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2655  cysteine desulfurase  41.73 
 
 		 407 aa  301  1e-80  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1489  cysteine desulfurase  41.73 
 
 		 407 aa  301  1e-80  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.71249  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1019  pyridoxal-phosphate-dependent aminotransferase (NIFS protein)  41.73 
 
 		 405 aa  300  3e-80  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.103423  normal  0.217288 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2144  cysteine desulfurase IscS  41.99 
 
 		 406 aa  300  3e-80  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00124025 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0673  cysteine desulfurase IscS  41.73 
 
 		 407 aa  300  3e-80  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.752721  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2599  cysteine desulfurase  41.73 
 
 		 407 aa  300  3e-80  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.129174  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1458  cysteine desulfurase  41.73 
 
 		 407 aa  299  6e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0822  cysteine desulfurase IscS  41.73 
 
 		 421 aa  299  6e-80  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.02372  normal  0.880264 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1553  cysteine desulfurase  42.45 
 
 		 407 aa  299  6e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0484493  normal  0.0430953 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3823  cysteine desulfurase IscS  40.52 
 
 		 403 aa  298  1e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.474065 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6331  cysteine desulfurase IscS  41.56 
 
 		 405 aa  298  1e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.134755  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2412  cysteine desulfurase IscS  40.52 
 
 		 403 aa  298  1e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2579  cysteine desulfurase  42.97 
 
 		 407 aa  298  1e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.120053  hitchhiker  0.000683499 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2290  cysteine desulfurase IscS  41.73 
 
 		 405 aa  298  1e-79  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00326388  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2177  cysteine desulfurase IscS  41.47 
 
 		 430 aa  298  1e-79  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00159504  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2036  cysteine desulfurase  41.67 
 
 		 407 aa  297  2e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.639443  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0437  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  41.71 
 
 		 388 aa  297  2e-79  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00696357  normal  0.223385 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2142  cysteine desulfurase IscS  41.99 
 
 		 406 aa  297  2e-79  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.456248  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1144  cysteine desulfurase  41.15 
 
 		 407 aa  298  2e-79  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.282524  normal  0.237339 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4665  cysteine desulfurase IscS  40.52 
 
 		 436 aa  297  2e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3698  cysteine desulfurase IscS  40.52 
 
 		 436 aa  297  2e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.789582  normal  0.356633 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0717  cysteine desulfurase  42.75 
 
 		 406 aa  297  2e-79  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4044  aminotransferase, class V  41.75 
 
 		 389 aa  297  2e-79  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.159236 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2163  cysteine desulfurase  41.67 
 
 		 407 aa  297  2e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.675105  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004360  cysteine desulfurase  42.23 
 
 		 404 aa  296  4e-79  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.591204  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1638  cysteine desulfurase IscS  41.99 
 
 		 406 aa  296  4e-79  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1875  cysteine desulfurase  41.21 
 
 		 407 aa  296  4e-79  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.795233  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5432  cysteine desulfurase  41.41 
 
 		 407 aa  296  6e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.116144  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2178  cysteine desulfurase IscS  41.47 
 
 		 405 aa  296  6e-79  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000963732  normal  0.389244 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2143  cysteine desulfurase  41.41 
 
 		 407 aa  295  1e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.950908 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5951  cysteine desulfurase  41.41 
 
 		 407 aa  295  1e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.350283  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2126  cysteine desulfurase  41.41 
 
 		 407 aa  295  1e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1360  cysteine desulfurase IscS  42.56 
 
 		 408 aa  294  2e-78  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1950  cysteine desulfurase IscS  41.73 
 
 		 405 aa  293  4e-78  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00000000843977  normal  0.404205 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2205  cysteine desulfurase IscS  41.56 
 
 		 403 aa  293  4e-78  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00230458  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1025  cysteine desulfurase  41.21 
 
 		 406 aa  292  6e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00998384  normal  0.30784 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2262  cysteine desulfurase  41.73 
 
 		 406 aa  291  1e-77  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.626751 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0884  cysteine desulfurase IscS  40.68 
 
 		 405 aa  291  1e-77  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.293282  normal  0.187166 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0949  cysteine desulfurase IscS  40.68 
 
 		 405 aa  291  1e-77  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0399375 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1058  cysteine desulfurase  41.51 
 
 		 405 aa  291  2e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0834623  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1047  cysteine desulfurase IscS  41.47 
 
 		 411 aa  291  2e-77  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3416  aminotransferase class V  39.9 
 
 		 399 aa  290  4e-77  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.425221  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01055  cysteine desulfurase  41.78 
 
 		 404 aa  290  4e-77  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0808  cysteine desulfurase IscS  41.67 
 
 		 405 aa  290  4e-77  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000772731  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0277  cysteine desulfurase  41.78 
 
 		 404 aa  289  7e-77  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0284858  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2443  cysteine desulfurase IscS  40.42 
 
 		 406 aa  288  1e-76  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2059  cysteine desulfurase IscS  40.93 
 
 		 407 aa  288  2e-76  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0733618  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3999  cysteine desulfurase IscS  42.48 
 
 		 406 aa  286  4e-76  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.102036  normal  0.0133564 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1487  cysteine desulfurase IscS  40.89 
 
 		 406 aa  286  4e-76  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.000124631  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0041  aminotransferase class V  43.26 
 
 		 389 aa  285  5.999999999999999e-76  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0247  cysteine desulfurase  41.99 
 
 		 403 aa  285  1.0000000000000001e-75  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0207  cysteine desulfurase NifS  39.58 
 
 		 388 aa  285  1.0000000000000001e-75  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000531678  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0281  cysteine desulfurase  42.04 
 
 		 404 aa  285  1.0000000000000001e-75  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.910551  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2373  cysteine desulfurase IscS  40.68 
 
 		 406 aa  284  2.0000000000000002e-75  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.934758  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0637  cysteine desulfurase  39.58 
 
 		 404 aa  280  2e-74  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.273964 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02508  cysteine desulfurase, alanine biosynthesis, putative (Eurofung)  40.26 
 
 		 507 aa  279  5e-74  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1238  cysteine desulfurase IscS  42.04 
 
 		 407 aa  279  5e-74  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.01856  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0830  cysteine desulfurase IscS  39.9 
 
 		 407 aa  279  5e-74  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.184128 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2264  cysteine desulfurase  40.99 
 
 		 404 aa  279  7e-74  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_45194  predicted protein  39.52 
 
 		 395 aa  278  9e-74  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0622302  normal  0.609433 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0592  cysteine desulfurase  40.1 
 
 		 404 aa  278  9e-74  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0627  cysteine desulfurase  40.1 
 
 		 404 aa  277  2e-73  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1324  cysteine desulfurase IscS  40.73 
 
 		 403 aa  277  2e-73  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00549463  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0410  cysteine desulfurase  41.3 
 
 		 422 aa  277  3e-73  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2190  Cysteine desulfurase  39.06 
 
 		 406 aa  276  4e-73  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.980213  normal  0.0116553 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3031  cysteine desulfurase  41.24 
 
 		 404 aa  276  5e-73  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.563846  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1164  cysteine desulfurase IscS  41.84 
 
 		 402 aa  276  5e-73  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.000196201  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0629  cysteine desulfurase  40.78 
 
 		 410 aa  275  7e-73  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0616  aminotransferase class V  37.99 
 
 		 408 aa  275  9e-73  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.327538  normal  0.0437001 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3581  cysteine desulfurase NifS  40.16 
 
 		 400 aa  273  2.0000000000000002e-72  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.345313  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1132  cysteine desulfurase  40.93 
 
 		 404 aa  274  2.0000000000000002e-72  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2149  cysteine desulfurase  41.51 
 
 		 404 aa  274  2.0000000000000002e-72  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00291634  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1164  cysteine desulfurase  40.37 
 
 		 384 aa  274  2.0000000000000002e-72  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0618  cysteine desulfurase  39.58 
 
 		 404 aa  274  2.0000000000000002e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2397  cysteine desulfurase  41.19 
 
 		 404 aa  273  3e-72  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0798953  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1493  cysteine desulfurase IscS  39.9 
 
 		 419 aa  273  3e-72  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2502  cysteine desulfurase  41.19 
 
 		 404 aa  273  3e-72  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00893038  normal  0.0261535 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2386  cysteine desulfurase  41.19 
 
 		 404 aa  273  3e-72  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000240874  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1458  cysteine desulfurase  40.16 
 
 		 404 aa  273  3e-72  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.586038  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0484  aminotransferase, class V  38.48 
 
 		 417 aa  273  3e-72  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0750137  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2317  cysteine desulfurase  40.47 
 
 		 404 aa  273  4.0000000000000004e-72  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.459864  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0303  cysteine desulfurase  41.36 
 
 		 402 aa  273  4.0000000000000004e-72  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>