77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMN2A_0709 on replicon NC_007335
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL2A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007335  PMN2A_0709  putative pfkB family carbohydrate kinase  100 
 
 		 280 aa  574  1.0000000000000001e-163  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.19808  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15431  putative pfkB family carbohydrate kinase  98.57 
 
 		 280 aa  569  1e-161  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.345352  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_12381  putative pfkB family carbohydrate kinase  54.64 
 
 		 283 aa  324  9e-88  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1746  pfkB family carbohydrate kinase  52.96 
 
 		 288 aa  297  1e-79  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.233467 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1813  pfkB family carbohydrate kinase  49.11 
 
 		 309 aa  278  8e-74  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11501  putative pfkB family carbohydrate kinase  47.94 
 
 		 289 aa  275  8e-73  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.605527  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1055  PfkB family carbohydrate kinase  48.31 
 
 		 289 aa  274  9e-73  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.18758  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11491  putative pfkB family carbohydrate kinase  48.31 
 
 		 289 aa  274  1.0000000000000001e-72  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0717159  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11481  putative pfkB family carbohydrate kinase  49.27 
 
 		 280 aa  272  4.0000000000000004e-72  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.036183  normal  0.108302 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11351  putative pfkB family carbohydrate kinase  47.94 
 
 		 289 aa  266  2e-70  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0498  carbohydrate kinase, PfkB  38.4 
 
 		 285 aa  134  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.130991  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0531  PfkB domain protein  37.64 
 
 		 285 aa  132  6.999999999999999e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.239382  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0526  PfkB domain protein  37.64 
 
 		 285 aa  131  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.387077  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1085  PfkB domain protein  39.39 
 
 		 295 aa  121  9.999999999999999e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2912  ribokinase-like domain-containing protein  34.47 
 
 		 290 aa  85.9  7e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.140234 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0200  ribokinase  25.17 
 
 		 313 aa  60.1  0.00000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.933367 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1603  ribokinase  23.48 
 
 		 310 aa  51.2  0.00002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.0000677641  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0349  putative ribokinase  24.31 
 
 		 309 aa  51.2  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0344  ribokinase  25 
 
 		 308 aa  50.8  0.00002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5471  PfkB domain protein  23.45 
 
 		 324 aa  51.2  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.784292 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1960  ribokinase  22.95 
 
 		 302 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0122509  normal  0.0586965 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1884  ribokinase  23.68 
 
 		 310 aa  50.8  0.00003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0118065  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0077  ribokinase-like domain-containing protein  22.12 
 
 		 281 aa  50.4  0.00003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.775198  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3232  ribokinase  23.99 
 
 		 302 aa  50.4  0.00004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.493529  normal  0.585828 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0078  ribokinase-like domain-containing protein  23.15 
 
 		 286 aa  50.4  0.00004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39540  sugar kinase, ribokinase  26.77 
 
 		 296 aa  49.7  0.00005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.893162 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3179  ribokinase  23.21 
 
 		 303 aa  49.7  0.00006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3631  ribokinase  26.8 
 
 		 304 aa  49.3  0.00007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0417  ribokinase-like domain-containing protein  24.31 
 
 		 309 aa  48.9  0.00008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.994196  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3580  ribokinase  25.9 
 
 		 303 aa  48.9  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4458  carbohydrate kinase  22.22 
 
 		 279 aa  48.5  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0077  PfkB  23.22 
 
 		 299 aa  48.1  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.273667  normal  0.451983 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04400  sugar kinase, ribokinase  21.02 
 
 		 305 aa  48.1  0.0001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.736771 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0354  ribokinase  23.91 
 
 		 308 aa  48.5  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3570  PfkB  23.88 
 
 		 297 aa  47.8  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.498935  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2118  PfkB domain protein  22.55 
 
 		 307 aa  47.8  0.0002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0569  PfkB domain protein  21.68 
 
 		 295 aa  47.4  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1368  ribokinase  32.43 
 
 		 305 aa  47  0.0003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.176905  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2458  ribokinase  22.03 
 
 		 302 aa  47  0.0004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0268  site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  22.22 
 
 		 279 aa  46.6  0.0004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000133044 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0162  ribokinase  31.48 
 
 		 309 aa  46.6  0.0004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0300  ribokinase family sugar kinase  33 
 
 		 320 aa  46.6  0.0004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.750208  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1494  PfkB domain protein  23.66 
 
 		 331 aa  46.2  0.0005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0243607  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2483  PfkB domain protein  22.3 
 
 		 302 aa  46.2  0.0005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3648  ribokinase  25.09 
 
 		 303 aa  46.2  0.0006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.16351  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2100  ribokinase  25.36 
 
 		 307 aa  46.2  0.0006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1142  PfkB  24.26 
 
 		 310 aa  46.2  0.0006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0676537  normal  0.093061 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0267  ribokinase-like domain-containing protein  21.76 
 
 		 279 aa  46.2  0.0006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00045197 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0659  ribokinase  25.18 
 
 		 303 aa  46.2  0.0006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3771  ribokinase  25.18 
 
 		 303 aa  46.2  0.0006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3006  ribokinase-like domain-containing protein  39.44 
 
 		 325 aa  45.4  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000170854 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0005  ribokinase, putative  23.15 
 
 		 313 aa  44.7  0.002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0831175  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0098  PfkB  21.66 
 
 		 282 aa  44.7  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00218841  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1334  putative ribokinase  30.56 
 
 		 353 aa  44.3  0.002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.588315 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3843  fructoselysine 6-kinase  23.74 
 
 		 261 aa  44.3  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0576  bifunctional heptose 7-phosphate kinase/heptose 1-phosphate adenyltransferase  26.12 
 
 		 475 aa  44.7  0.002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0544  PfkB domain protein  32.5 
 
 		 308 aa  44.3  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2113  PfkB domain protein  20.63 
 
 		 304 aa  44.7  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0494  PfkB domain protein  23.1 
 
 		 360 aa  43.9  0.003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.441156  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0052  ribokinase-like domain-containing protein  21.6 
 
 		 306 aa  43.9  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000666375 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2870  PfkB  29.63 
 
 		 315 aa  43.9  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0148576  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2877  ribokinase-like domain-containing protein  22.65 
 
 		 300 aa  43.9  0.003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.98714  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4125  ribokinase-like domain-containing protein  22.64 
 
 		 280 aa  43.9  0.003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3754  ribokinase-like domain-containing protein  21.3 
 
 		 279 aa  43.9  0.003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.415543  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0970  carbohydrate kinase  31.78 
 
 		 314 aa  43.9  0.003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0151  PfkB  28.24 
 
 		 331 aa  43.9  0.003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3908  PfkB domain protein  33.75 
 
 		 305 aa  43.5  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00598203  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0252  ribokinase  23.91 
 
 		 307 aa  43.1  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.377165  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1402  ribokinase  30.56 
 
 		 318 aa  43.5  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0972031 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3069  hypothetical protein  27.16 
 
 		 315 aa  43.5  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.795207  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4640  ribokinase  23.18 
 
 		 305 aa  43.1  0.005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.162899  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4799  ribokinase-like domain-containing protein  23.04 
 
 		 279 aa  42.4  0.008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00319508 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2407  rfaE bifunctional protein  23.81 
 
 		 326 aa  42.4  0.008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3036  PfkB domain protein  28.77 
 
 		 311 aa  42.4  0.008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1980  ribokinase  22.03 
 
 		 302 aa  42.4  0.009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0034  PfkB domain protein  22.49 
 
 		 308 aa  42.4  0.009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0204225  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2117  PfkB domain protein  26.62 
 
 		 338 aa  42.4  0.009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.496872  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>