More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_77492 on replicon NC_009044
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
BN001307  ANIA_02315  ATP synthase beta chain, mitochondrial (Eurofung)  79.29 
 
 		 518 aa  769    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.80478  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0218  F0F1 ATP synthase subunit beta  74 
 
 		 482 aa  694    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.933064  normal  0.232974 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0917  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.23 
 
 		 465 aa  637    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00508196  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1525  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.59 
 
 		 465 aa  641    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00013374  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0113  F0F1 ATP synthase subunit beta  74.26 
 
 		 470 aa  705    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.800377  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_77492  F1F0-ATPase complex, F1 beta subunit  100 
 
 		 503 aa  1009    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.686531  normal  0.984135 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1939  ATP synthase F1 subunit beta  68.09 
 
 		 482 aa  644    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2922  F0F1 ATP synthase subunit beta  76.23 
 
 		 509 aa  714    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0203  F0F1 ATP synthase subunit beta  71.46 
 
 		 475 aa  684    Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.838406  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16171  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.12 
 
 		 486 aa  635    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5430  F0F1 ATP synthase subunit beta  70 
 
 		 468 aa  654    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0114  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.74 
 
 		 484 aa  645    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000729583  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0102  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.74 
 
 		 465 aa  646    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.532539  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0687  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.87 
 
 		 465 aa  646    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0516039  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1799  F0F1 ATP synthase subunit beta  76.65 
 
 		 521 aa  692    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.469261  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4747  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.24 
 
 		 463 aa  635    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2080  F0F1 ATP synthase subunit beta  74.63 
 
 		 478 aa  707    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.331414 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5155  F0F1 ATP synthase subunit beta  69 
 
 		 469 aa  647    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0181879  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4987  F0F1 ATP synthase subunit beta  69 
 
 		 469 aa  647    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5005  F0F1 ATP synthase subunit beta  69 
 
 		 469 aa  647    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.509964  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4507  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.24 
 
 		 463 aa  635    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0605714 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0193  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.97 
 
 		 475 aa  648    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.196024  normal  0.0120657 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1732  F0F1 ATP synthase subunit beta  76.65 
 
 		 521 aa  692    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.352683  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF00570  conserved hypothetical protein  76.86 
 
 		 547 aa  781    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0429252  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4737  F0F1 ATP synthase subunit beta  73.74 
 
 		 542 aa  686    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.603739  decreased coverage  0.00210198 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2024  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.51 
 
 		 477 aa  650    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.531003 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0176  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.15 
 
 		 483 aa  635    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2201  F0F1 ATP synthase subunit beta  76.79 
 
 		 475 aa  725    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0049  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.26 
 
 		 462 aa  661    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.534709  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0459  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.45 
 
 		 507 aa  662    Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  decreased coverage  0.00202199  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1738  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.44 
 
 		 465 aa  639    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.31199  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0433  F0F1 ATP synthase subunit beta  76.78 
 
 		 476 aa  732    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2298  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.87 
 
 		 482 aa  647    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0603  F0F1 ATP synthase subunit beta  71.52 
 
 		 467 aa  676    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00132647  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3074  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.17 
 
 		 458 aa  635    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2934  F0F1 ATP synthase subunit beta  76.32 
 
 		 474 aa  726    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.511404  normal  0.0433672 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2299  F0F1 ATP synthase subunit beta  75.95 
 
 		 475 aa  714    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0962572  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0949  F0F1 ATP synthase subunit beta  73.83 
 
 		 468 aa  697    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.740096  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3131  F0F1 ATP synthase subunit beta  73.83 
 
 		 468 aa  697    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0408  F0F1 ATP synthase subunit beta  75.88 
 
 		 480 aa  718    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.364668 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0021  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.26 
 
 		 482 aa  667    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.141679 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3736  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.78 
 
 		 472 aa  659    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2014  F0F1 ATP synthase subunit beta  71.34 
 
 		 462 aa  669    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1466  F0F1 ATP synthase subunit beta  73.26 
 
 		 485 aa  681    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0580828 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3406  F0F1 ATP synthase subunit beta  73.83 
 
 		 470 aa  703    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.732253  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0985  F0F1 ATP synthase subunit beta  72.35 
 
 		 470 aa  673    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.197353  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5547  F0F1 ATP synthase subunit beta  69 
 
 		 469 aa  647    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00288434  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5103  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.58 
 
 		 469 aa  641    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119590  ATP synthase beta chain, mitochondrial precursor  73.4 
 
 		 530 aa  702    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.114737  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0142  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.74 
 
 		 465 aa  646    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0029087  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2608  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.16 
 
 		 464 aa  649    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3818  F0F1 ATP synthase subunit beta  77.38 
 
 		 474 aa  727    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1226  F0F1 ATP synthase subunit beta  75.55 
 
 		 474 aa  706    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.877196  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2378  F0F1 ATP synthase subunit beta  72.57 
 
 		 462 aa  680    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00260932 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2844  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.34 
 
 		 475 aa  658    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4348  F0F1 ATP synthase subunit beta  71.4 
 
 		 482 aa  657    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1507  F0F1 ATP synthase subunit beta  74.26 
 
 		 471 aa  704    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0265  F0F1 ATP synthase subunit beta  76.15 
 
 		 476 aa  726    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.615567  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2402  F0F1 ATP synthase subunit beta  77.39 
 
 		 481 aa  744    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0763  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.74 
 
 		 474 aa  652    Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0573  F0F1 ATP synthase subunit beta  71.55 
 
 		 507 aa  662    Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1049  F0F1 ATP synthase subunit beta  75.95 
 
 		 474 aa  714    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3956  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.45 
 
 		 463 aa  635    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0165608  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4366  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.24 
 
 		 463 aa  635    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.521445  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0174  F0F1 ATP synthase subunit beta  75.73 
 
 		 476 aa  722    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1681  F0F1 ATP synthase subunit beta  75.8 
 
 		 476 aa  704    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1465  F0F1 ATP synthase subunit beta  77.52 
 
 		 478 aa  721    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.58444  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2195  F0F1 ATP synthase subunit beta  72.1 
 
 		 470 aa  673    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4263  F0F1 ATP synthase subunit beta  73.13 
 
 		 470 aa  697    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.439057  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0559  F0F1 ATP synthase subunit beta  76.15 
 
 		 476 aa  725    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.29252 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2430  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.39 
 
 		 458 aa  640    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0681755  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0529  F0F1 ATP synthase subunit beta  75.1 
 
 		 476 aa  716    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2327  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.51 
 
 		 477 aa  652    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.568138  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0974  F0F1 ATP synthase subunit beta  75.95 
 
 		 475 aa  714    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4130  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.24 
 
 		 463 aa  636    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.145707 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4332  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.75 
 
 		 480 aa  645    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.551629  normal  0.557772 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2086  F0F1 ATP synthase subunit beta  77.64 
 
 		 474 aa  731    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.531544  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2288  F0F1 ATP synthase subunit beta  77.04 
 
 		 513 aa  720    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.966957  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0008  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.17 
 
 		 460 aa  635    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.366806  normal  0.022382 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0114  F0F1 ATP synthase subunit beta  73.11 
 
 		 537 aa  687    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3218  F0F1 ATP synthase subunit beta  77.94 
 
 		 519 aa  728    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.409534  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3458  F0F1 ATP synthase subunit beta  74.72 
 
 		 474 aa  678    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2452  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.03 
 
 		 465 aa  643    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2162  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.25 
 
 		 465 aa  645    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0623  F0F1 ATP synthase subunit beta  77.37 
 
 		 484 aa  717    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.722449 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3385  F0F1 ATP synthase subunit beta  71.73 
 
 		 484 aa  652    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3925  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.24 
 
 		 463 aa  635    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0179078 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4017  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.24 
 
 		 463 aa  636    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.436457  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2869  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.17 
 
 		 458 aa  640    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.761227  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1105  F0F1 ATP synthase subunit beta  75.75 
 
 		 517 aa  703    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2382  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.16 
 
 		 476 aa  644    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2802  F0F1 ATP synthase subunit beta  73.66 
 
 		 479 aa  675    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.472945  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0603  F0F1 ATP synthase subunit beta  74.15 
 
 		 484 aa  685    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.106818  normal  0.607345 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4365  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.24 
 
 		 463 aa  635    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.853201  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0606  F0F1 ATP synthase subunit beta  74.47 
 
 		 471 aa  704    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.391377  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4495  F0F1 ATP synthase subunit beta  71.1 
 
 		 481 aa  687    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.632426  normal  0.0177309 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6635  F0F1 ATP synthase subunit beta  75.21 
 
 		 484 aa  698    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0663225 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2137  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.3 
 
 		 472 aa  641    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3825  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.6 
 
 		 464 aa  657    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3150  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.41 
 
 		 472 aa  644    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>