166 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_63116 on replicon NC_009047
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009047  PICST_63116  Protein involved in the expression of PAPS reductase and sulfite reductase. Also executes last 2 steps in the biosynthesis of sirohaem  100 
 
 
292 aa  604  9.999999999999999e-173  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.885635  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06710  siroheme synthase Met8, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G05680)  36.05 
 
 
242 aa  135  9.999999999999999e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006691  CNF00750  conserved hypothetical protein  30.74 
 
 
310 aa  103  3e-21  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2313  uroporphyrin-III C-methyltransferase  27.65 
 
 
502 aa  77.4  0.0000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6615  siroheme synthase  25.38 
 
 
193 aa  77  0.0000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.027684 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1506  siroheme synthase  28.43 
 
 
194 aa  75.9  0.0000000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0478  siroheme synthase  26 
 
 
188 aa  74.3  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.598281  normal  0.875071 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1065  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / precorrin-2 dehydrogenase  24.12 
 
 
554 aa  73.6  0.000000000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1107  uroporphyrin-III C-methyltransferase  26.01 
 
 
487 aa  73.6  0.000000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2173  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / precorrin-2 dehydrogenase  27.06 
 
 
489 aa  71.2  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1397  uroporphyrin-III C-methyltransferase  26.47 
 
 
528 aa  70.5  0.00000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04774  siroheme synthase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G06600)  21.53 
 
 
560 aa  69.3  0.00000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.307329  normal  0.90309 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2374  precorrin-2 dehydrogenase  26.8 
 
 
200 aa  69.3  0.00000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.632481 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02359  hypothetical protein  28.3 
 
 
306 aa  69.3  0.00000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL06740  uroporphyrin-III C-methyltransferase, putative  25.78 
 
 
744 aa  68.2  0.0000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.605616  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1123  siroheme synthase  26.56 
 
 
230 aa  68.6  0.0000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.967334 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3090  siroheme synthase  30.53 
 
 
498 aa  67.8  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.000482671  normal  0.0254521 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2383  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / precorrin-2 dehydrogenase  27.06 
 
 
462 aa  67.4  0.0000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.806488  hitchhiker  0.00704026 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0321  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  27.17 
 
 
626 aa  67.4  0.0000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00115564  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1261  siroheme synthase  25.15 
 
 
209 aa  67.4  0.0000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1748  siroheme synthase  26.53 
 
 
229 aa  67.4  0.0000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1251  precorrin-2 dehydrogenase  25.65 
 
 
214 aa  66.6  0.0000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.264543 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003419  siroheme synthase/precorrin-2 oxidase/sirohydrochlorin ferrochelatase  28.74 
 
 
306 aa  65.5  0.0000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.827256  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0863  uroporphyrin-III C-methyltransferase-like  23.98 
 
 
468 aa  65.1  0.000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.147258  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0652  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / precorrin-2 dehydrogenase  24.71 
 
 
493 aa  65.1  0.000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4780  siroheme synthase  26.26 
 
 
195 aa  65.5  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000000000392652  hitchhiker  0.00414073 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30340  siroheme synthase  26.04 
 
 
465 aa  65.1  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1588  siroheme synthase  26.98 
 
 
257 aa  65.5  0.000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2597  siroheme synthase  26.04 
 
 
465 aa  65.1  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0817  uroporphyrin-III C-methyltransferase  22.45 
 
 
476 aa  65.1  0.000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.994278 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2058  virulence protein VirC  27.17 
 
 
313 aa  64.3  0.000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2635  precorrin-2 dehydrogenase  25.4 
 
 
197 aa  64.3  0.000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.917436  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0976  siroheme synthase component enzyme  29.34 
 
 
312 aa  64.7  0.000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.417242  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5870  siroheme synthase  25.86 
 
 
218 aa  63.9  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.115348  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0671  uroporphyrin-III C-methyltransferase  23.08 
 
 
482 aa  63.5  0.000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.523068  normal  0.0127709 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1160  uroporphyrin-III C-methyltransferase  24.32 
 
 
473 aa  63.2  0.000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.277445  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2072  siroheme synthase  24.1 
 
 
235 aa  61.2  0.00000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.628826  hitchhiker  0.0000044464 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2089  ferrochelatase  26.22 
 
 
474 aa  60.5  0.00000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0691041  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2471  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  24.85 
 
 
479 aa  60.8  0.00000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0675252  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0710  siroheme synthase  26.34 
 
 
148 aa  60.5  0.00000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1150  precorrin-2 dehydrogenase  29.29 
 
 
205 aa  60.5  0.00000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.225032  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0464  siroheme synthase  23.74 
 
 
195 aa  60.1  0.00000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000142976  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1977  siroheme synthase CysG  23.44 
 
 
188 aa  59.7  0.00000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.769253  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4522  siroheme synthase  24.16 
 
 
386 aa  59.7  0.00000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0861  uroporphyrin-III C-methyltransferase  21.89 
 
 
472 aa  59.3  0.00000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.402872  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1111  uroporphyrin-III C-methyltransferase  26.04 
 
 
482 aa  58.9  0.00000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0417  uroporphyrin-III C-methyltransferase  26.67 
 
 
462 aa  58.9  0.00000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3356  siroheme synthase  26.44 
 
 
212 aa  58.9  0.00000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0422337  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3236  siroheme synthase  28.93 
 
 
220 aa  58.9  0.00000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0304551  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1980  precorrin-2 dehydrogenase  25 
 
 
194 aa  58.5  0.0000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00160437  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1343  uroporphyrin-III C-methyltransferase  23.83 
 
 
484 aa  58.5  0.0000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3024  uroporphyrin-III C-methyltransferase  24.86 
 
 
505 aa  58.9  0.0000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0830  uroporphyrin-III C-methyltransferase  23.08 
 
 
473 aa  58.5  0.0000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5891  siroheme synthase  21.72 
 
 
493 aa  58.2  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1349  siroheme synthase  24.71 
 
 
213 aa  58.2  0.0000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0405  siroheme synthase  26.56 
 
 
224 aa  57.4  0.0000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00161187  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0049  siroheme synthase  24.38 
 
 
193 aa  57.4  0.0000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000760194  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3379  siroheme synthase  24.75 
 
 
197 aa  56.6  0.0000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000292655  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1933  uroporphyrin-III C-methyltransferase  21.83 
 
 
495 aa  56.6  0.0000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3796  siroheme synthase  22.68 
 
 
457 aa  57  0.0000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.01671 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4048  siroheme synthase  25.51 
 
 
459 aa  57  0.0000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1679  precorrin-2 dehydrogenase / uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  22.09 
 
 
481 aa  56.6  0.0000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0362  siroheme synthase  31.25 
 
 
249 aa  56.6  0.0000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000323001  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3519  uroporphyrin-III C-methyltransferase  21.94 
 
 
480 aa  56.2  0.0000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.605082  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3871  siroheme synthase  23.47 
 
 
459 aa  56.2  0.0000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.560083  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3066  siroheme synthase  23.89 
 
 
221 aa  55.5  0.0000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000329039  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2165  siroheme synthase  29.91 
 
 
190 aa  55.8  0.0000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.576163  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0345  siroheme synthase  26.86 
 
 
182 aa  55.8  0.0000009  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00442257  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0400  siroheme synthase  25.3 
 
 
212 aa  55.5  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1698  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / precorrin-2 dehydrogenase  24.86 
 
 
458 aa  55.1  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0715064 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1249  siroheme synthase  27.38 
 
 
213 aa  55.1  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3362  uroporphyrin-III C-methyltransferase  22.45 
 
 
480 aa  55.1  0.000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2023  precorrin-2 dehydrogenase  23.16 
 
 
225 aa  54.3  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.089983  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28170  Uroporphyrin-III C-methyltransferase  24.26 
 
 
464 aa  54.7  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3282  siroheme synthase  23.74 
 
 
224 aa  54.3  0.000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3999  uroporphyrin-III C-methyltransferase  33.33 
 
 
463 aa  53.9  0.000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.426226  hitchhiker  0.00756787 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11590  siroheme synthase, N-terminal domain protein  24.55 
 
 
246 aa  53.9  0.000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3344  siroheme synthase  23.67 
 
 
464 aa  53.9  0.000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00903193  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1099  uroporphyrin-III C-methyltransferase  21.51 
 
 
484 aa  53.9  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.656193 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3604  uroporphyrin-III C-methyltransferase  33.33 
 
 
463 aa  53.9  0.000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.556509 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1508  siroheme synthase  20.43 
 
 
228 aa  53.5  0.000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.359282  normal  0.0117341 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1483  precorrin-2 dehydrogenase  26.55 
 
 
204 aa  53.1  0.000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.060186  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3305  siroheme synthase  23.08 
 
 
472 aa  53.5  0.000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0970  siroheme synthase  23.08 
 
 
472 aa  53.1  0.000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3437  uroporphyrin-III C-methyltransferase  23.08 
 
 
472 aa  53.1  0.000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3861  precorrin-2 dehydrogenase  26.55 
 
 
204 aa  52.8  0.000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.458104  hitchhiker  0.00000126508 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3174  uroporphyrin-III C-methyltransferase, C-terminal:siroheme synthase, N-terminal  23.67 
 
 
464 aa  53.1  0.000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.108275  normal  0.319321 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3989  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  27.54 
 
 
480 aa  53.1  0.000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0569779  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3959  siroheme synthase  23.64 
 
 
473 aa  53.1  0.000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3719  siroheme synthase  24.55 
 
 
470 aa  53.1  0.000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.411824  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0232  siroheme synthase  23.64 
 
 
473 aa  53.1  0.000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1834  uroporphyrin-III C-methyltransferase  31.88 
 
 
463 aa  52.8  0.000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000289405 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0683  precorrin-2 dehydrogenase / sirohydrochlorin ferrochelatase  22.45 
 
 
225 aa  52.8  0.000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000339701  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0344  uroporphyrin-III C-methyltransferase  23.12 
 
 
457 aa  52.4  0.000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3744  siroheme synthase  23.12 
 
 
457 aa  52.4  0.000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3650  siroheme synthase  23.12 
 
 
457 aa  52.4  0.000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000355794 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2375  uroporphyrin-III C-methyltransferase  24.29 
 
 
507 aa  52.4  0.000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.656731 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3564  siroheme synthase  23.12 
 
 
457 aa  52.4  0.000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3838  siroheme synthase  23.12 
 
 
457 aa  52.4  0.000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0344  siroheme synthase  23.12 
 
 
457 aa  52.4  0.000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.898093 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>