More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_58499 on replicon NC_009044
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009044  PICST_58499  transcriptional regulator of multiple amino acid permeases  100 
 
 		 583 aa  1173    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006682  CNM00800  amino acid transporter, putative  34.99 
 
 		 575 aa  325  1e-87  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE00270  amino acid transporter, putative  33.62 
 
 		 572 aa  320  5e-86  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.102961  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_82860  dicarboxylic amino acid permease  31.91 
 
 		 583 aa  273  7e-72  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.916689  normal  1 
 
 
-
 
NC_006686  CND02430  amino acid transporter, putative  30.74 
 
 		 548 aa  253  7e-66  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.297208  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05678  amino acid transporter (Eurofung)  30.18 
 
 		 588 aa  247  4.9999999999999997e-64  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.561321  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4318  amino acid permease-associated region  30.13 
 
 		 493 aa  243  9e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.193493  normal  0.498738 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2670  lysine transporter  29.5 
 
 		 503 aa  243  1e-62  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1537  lysine transporter  29.5 
 
 		 503 aa  243  1e-62  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.807023  normal  0.123045 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2752  lysine transporter  29.5 
 
 		 503 aa  243  1e-62  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.970075  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3224  lysine transporter  30.35 
 
 		 493 aa  241  2.9999999999999997e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000298398 
 
 
-
 
NC_006670  CNA05800  amino acid transporter, putative  27.87 
 
 		 563 aa  240  4e-62  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_30939  arginine permease  29.57 
 
 		 552 aa  237  4e-61  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0328856  normal  0.365315 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2323  lysine transporter  29.29 
 
 		 492 aa  234  5e-60  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4928  lysine-specific permease  28.57 
 
 		 510 aa  232  1e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.382341  normal  0.631803 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_68755  general amino acid permease  30.16 
 
 		 599 aa  231  3e-59  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2418  lysine transporter  29.14 
 
 		 490 aa  230  4e-59  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2757  lysine transporter  28.47 
 
 		 489 aa  230  6e-59  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.536752  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2303  lysine transporter  28.57 
 
 		 489 aa  230  6e-59  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0126674 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0810  lysine transporter  28.57 
 
 		 489 aa  229  9e-59  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02085  lysine transporter  28.57 
 
 		 489 aa  229  9e-59  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0635265  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1502  amino acid permease-associated region  28.57 
 
 		 489 aa  229  9e-59  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000366881  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2291  lysine transporter  28.57 
 
 		 489 aa  229  9e-59  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3292  lysine transporter  28.57 
 
 		 489 aa  229  9e-59  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0579936  normal  0.854577 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02044  hypothetical protein  28.57 
 
 		 489 aa  229  9e-59  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0708606  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2453  lysine transporter  28.57 
 
 		 489 aa  229  9e-59  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1492  lysine transporter  28.57 
 
 		 489 aa  229  9e-59  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0314529 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02468  amino acid transporter (Eurofung)  30.91 
 
 		 533 aa  229  1e-58  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0199  lysine-specific permease  28.47 
 
 		 520 aa  229  1e-58  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0172  lysine-specific permease  28.47 
 
 		 520 aa  229  1e-58  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2737  lysine-specific permease  28.47 
 
 		 520 aa  229  1e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.279115  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1010  lysine-specific permease  28.47 
 
 		 520 aa  229  1e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2594  lysine-specific permease  28.47 
 
 		 520 aa  229  1e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1344  lysine-specific permease  28.47 
 
 		 520 aa  229  1e-58  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0464  lysine-specific permease  28.47 
 
 		 520 aa  228  3e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1658  lysine transporter  29.6 
 
 		 491 aa  226  6e-58  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0271465  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06118  Amino acid transporter Fragment [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:B2M1L6]  27.8 
 
 		 567 aa  224  3e-57  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.889854  normal  0.0238018 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2439  lysine transporter  28 
 
 		 489 aa  224  3e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2435  lysine transporter  27.82 
 
 		 489 aa  223  4.9999999999999996e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.101181 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2391  lysine transporter  27.82 
 
 		 489 aa  223  4.9999999999999996e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0115571 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2346  lysine transporter  27.82 
 
 		 489 aa  223  4.9999999999999996e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00075881  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2549  lysine transporter  27.82 
 
 		 489 aa  223  4.9999999999999996e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00163669 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1929  lysine transporter  29.42 
 
 		 491 aa  223  6e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.148093  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01581  proline transporter (Eurofung)  28.15 
 
 		 519 aa  223  9e-57  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0103942 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1932  amino acid permease-associated region  28.75 
 
 		 490 aa  222  9.999999999999999e-57  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00030899  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_81453  general amino acid permease  30.29 
 
 		 589 aa  221  1.9999999999999999e-56  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0498735 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_84246  arginine permease  29.03 
 
 		 569 aa  222  1.9999999999999999e-56  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.385569  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1758  lysine-specific permease transmembrane protein  28.78 
 
 		 512 aa  221  3e-56  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.101162  normal  0.222113 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0379  amino acid transporter  28.26 
 
 		 526 aa  221  3e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.139964  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61250  APC family lysine-specific permease  28.21 
 
 		 487 aa  220  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.405295  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5011  amino acid permease-associated region  28.83 
 
 		 514 aa  220  6e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.677067 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5274  lysine-specific permease  28.15 
 
 		 487 aa  219  1e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3450  amino acid permease-associated region  27.89 
 
 		 526 aa  217  4e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5271  amino acid permease-associated region  27.89 
 
 		 526 aa  217  5e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.221406  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2396  amino acid transporter  26.77 
 
 		 511 aa  217  5e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.953097  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3096  amino acid permease-associated region  27.89 
 
 		 526 aa  217  5e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.552339  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4997  amino acid permease-associated region  27.89 
 
 		 526 aa  217  5.9999999999999996e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1821  lysine-specific permease  29.01 
 
 		 489 aa  217  5.9999999999999996e-55  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_52197  Proline specific permease  28.7 
 
 		 574 aa  216  7e-55  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0650572  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02201  amino acid transporter (Eurofung)  26.91 
 
 		 544 aa  215  9.999999999999999e-55  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.000000058324  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1404  amino acid permease-associated region  28.83 
 
 		 506 aa  216  9.999999999999999e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1856  amino acid permease-associated region  29.33 
 
 		 493 aa  216  9.999999999999999e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.368764 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_32180  general amino acid permease  29.39 
 
 		 554 aa  215  1.9999999999999998e-54  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.279338  normal  0.0497012 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3599  amino acid permease-associated region  27.16 
 
 		 511 aa  214  3.9999999999999995e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.872031  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5455  amino acid permease-associated region  27.16 
 
 		 536 aa  214  3.9999999999999995e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.402528  normal  0.936054 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1849  amino acid transporter  27.27 
 
 		 479 aa  214  4.9999999999999996e-54  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.682086  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4631  amino acid permease-associated region  27.34 
 
 		 526 aa  213  7e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1489  amino acid permease-associated region  27.4 
 
 		 511 aa  212  1e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00379868  normal  0.284901 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3806  amino acid permease-associated region  27.19 
 
 		 511 aa  211  2e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.742871 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3715  amino acid permease-associated region  26.79 
 
 		 538 aa  212  2e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0410363 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4648  amino acid permease-associated region  26.79 
 
 		 538 aa  212  2e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1448  amino acid permease-associated region  27.58 
 
 		 511 aa  211  4e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0115525  hitchhiker  0.00101809 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2505  amino acid transporter  28.62 
 
 		 488 aa  210  7e-53  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.187909  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39044  dicarboxylic amino acid permease  26.62 
 
 		 519 aa  208  2e-52  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.115951 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2176  lysine-specific permease  27.92 
 
 		 488 aa  207  6e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3104  lysine-specific permease  27.47 
 
 		 488 aa  206  1e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.108094  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3071  lysine-specific permease  27.74 
 
 		 488 aa  204  4e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3102  lysine-specific permease  27.55 
 
 		 488 aa  204  4e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00351231  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2247  amino acid permease-associated region  26.69 
 
 		 496 aa  204  4e-51  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03287  amino acid transporter (Eurofung)  28.55 
 
 		 562 aa  204  5e-51  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.836736  hitchhiker  0.00261923 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3085  lysine-specific permease  26.61 
 
 		 488 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2834  lysine specific permease  26.61 
 
 		 488 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2794  lysine specific permease  26.61 
 
 		 488 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.689488  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2862  lysine-specific permease  26.42 
 
 		 488 aa  201  3e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.456947  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3076  lysine-specific permease  26.42 
 
 		 488 aa  201  3e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.121364  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3945  amino acid permease-associated region  26.92 
 
 		 520 aa  201  3.9999999999999996e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.425956 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2856  amino acid permease-associated region  26.97 
 
 		 488 aa  201  3.9999999999999996e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0658699  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_37009  general amino acid permease  26.86 
 
 		 579 aa  201  3.9999999999999996e-50  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.367656  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4422  amino acid permease-associated region  26.92 
 
 		 520 aa  201  3.9999999999999996e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3583  amino acid permease-associated region  26.92 
 
 		 520 aa  201  3.9999999999999996e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.542229  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2051  amino acid permease-associated region  26.97 
 
 		 488 aa  200  5e-50  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.111812  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3635  amino acid permease-associated region  28.11 
 
 		 527 aa  199  7.999999999999999e-50  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0393  lysine-specific permease  26.88 
 
 		 492 aa  198  2.0000000000000003e-49  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.449766  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00990  amino acid transporter  28.76 
 
 		 500 aa  197  4.0000000000000005e-49  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3839  amino acid permease-associated region  26.56 
 
 		 513 aa  197  6e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.766371  normal  0.301841 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_78721  amino acid permease  27.19 
 
 		 597 aa  196  7e-49  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00834318 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04328  amino acid transporter (Eurofung)  27.09 
 
 		 581 aa  196  1e-48  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0954  lysine-specific permease  28.23 
 
 		 496 aa  192  1e-47  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2141  amino acid transporter  25.66 
 
 		 510 aa  192  2e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.654652  normal  0.109603 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_29107  histidine permease  24.83 
 
 		 529 aa  191  2.9999999999999997e-47  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0754466 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>