34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_42885 on replicon NC_009043
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009043  PICST_42885  predicted protein  100 
 
 
395 aa  806    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_24748  predicted protein  37.34 
 
 
413 aa  275  1.0000000000000001e-72  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA00930  pelota, putative  36.39 
 
 
415 aa  268  2e-70  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0299897  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_44170  predicted protein  32.54 
 
 
383 aa  234  2.0000000000000002e-60  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.717736  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04530  translation factor pelota, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G02960)  32.46 
 
 
403 aa  226  7e-58  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.664166  decreased coverage  0.00419597 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1084  putative translation factor pelota  26.3 
 
 
348 aa  132  7.999999999999999e-30  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1591  cell division protein pelota  26.56 
 
 
348 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0862  translation factor pelota  25.53 
 
 
348 aa  130  6e-29  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.592599  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1576  cell division protein pelota  28.68 
 
 
350 aa  129  7.000000000000001e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1097  putative translation factor pelota  28.05 
 
 
348 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0720  putative translation factor pelota  27.2 
 
 
348 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2030  translation factor pelota  25.81 
 
 
355 aa  114  3e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.481161 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0626  putative translation factor pelota  25.33 
 
 
351 aa  110  6e-23  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.991887  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2861  translation factor pelota  26.36 
 
 
355 aa  110  6e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0863  translation factor pelota  26.74 
 
 
355 aa  109  8.000000000000001e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1390  cell division protein pelota  26.98 
 
 
347 aa  107  5e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0557084  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2924  translation factor pelota  24.43 
 
 
356 aa  105  2e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.31723  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0438  putative translation factor pelota  25.67 
 
 
341 aa  101  3e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.750363  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1329  putative translation factor pelota  23.88 
 
 
341 aa  95.1  2e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.520708 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2121  translation factor pelota  23.14 
 
 
355 aa  94.4  3e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.163385  normal  0.700321 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0342  translation factor pelota  25.79 
 
 
328 aa  93.6  6e-18  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0139479  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0539  cell division protein pelota  22.99 
 
 
342 aa  88.6  2e-16  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.185665  normal  0.43653 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0937  putative translation factor pelota  22.28 
 
 
341 aa  85.5  0.000000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0307408  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1062  translation factor pelota  24.87 
 
 
344 aa  80.9  0.00000000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1565  translation factor pelota  22.93 
 
 
340 aa  80.9  0.00000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.718031  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0556  eRF1 domain-containing protein  22.59 
 
 
337 aa  70.5  0.00000000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2156  cell division protein pelota  22.88 
 
 
341 aa  68.6  0.0000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0245621  hitchhiker  0.000505649 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0109  eRF1 domain-containing 1 protein  22.28 
 
 
349 aa  67  0.0000000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000388933 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0153  peptide chain release factor 1  22.85 
 
 
357 aa  53.1  0.000009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3138  eRF1 domain 2 protein  21.82 
 
 
358 aa  50.8  0.00004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1763  cell division protein pelota  21.61 
 
 
332 aa  47  0.0006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000803667 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1714  eRF1 domain-containing 1 protein  22.61 
 
 
333 aa  45.4  0.002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.839139  normal  0.0545178 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0749  peptide chain release factor 1  21.48 
 
 
338 aa  43.5  0.007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0557014  normal  0.0243779 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0491  eRF1 domain-containing 1 protein  20.9 
 
 
330 aa  43.5  0.007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>