101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_39512 on replicon NC_009068
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009068  PICST_39512  predicted protein  100 
 
 		 274 aa  569  1e-161  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0377472 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08173  Impact family protein (AFU_orthologue; AFUA_5G03000)  33.64 
 
 		 341 aa  160  3e-38  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.627119  normal  1 
 
 
-
 
NC_006686  CND01590  regulation of amino acid metabolism-related protein, putative  28.82 
 
 		 450 aa  115  6e-25  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0433818  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_48866  predicted protein  32.47 
 
 		 327 aa  102  6e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_33634  predicted protein  51.09 
 
 		 96 aa  73.9  0.000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.540309  normal  0.671015 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0699  hypothetical protein  36.36 
 
 		 126 aa  73.9  0.000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0928683  normal  0.0143499 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3669  protein of unknown function UPF0029  30.77 
 
 		 192 aa  72.8  0.000000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000253627  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1450  hypothetical protein  37.27 
 
 		 198 aa  71.2  0.00000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1014  hypothetical protein  36.61 
 
 		 115 aa  69.3  0.00000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.250849  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1076  protein of unknown function UPF0029  27.97 
 
 		 192 aa  68.9  0.00000000009  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1725  protein of unknown function UPF0029  33.09 
 
 		 204 aa  68.9  0.00000000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0111  protein of unknown function UPF0029  33.58 
 
 		 216 aa  66.6  0.0000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0876  protein of unknown function UPF0029  32.46 
 
 		 203 aa  65.5  0.0000000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.196068 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0383  hypothetical protein  35.11 
 
 		 208 aa  64.3  0.000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.46169  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0415  hypothetical protein  33.9 
 
 		 213 aa  63.9  0.000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_60871  predicted protein  33.82 
 
 		 151 aa  62.8  0.000000006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0533  hypothetical protein  28.35 
 
 		 205 aa  62.4  0.000000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  decreased coverage  0.00814053  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1598  hypothetical protein  28.21 
 
 		 205 aa  62  0.00000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  decreased coverage  0.00000000468439  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0314  hypothetical protein  29.92 
 
 		 205 aa  61.2  0.00000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.55405 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0134  protein of unknown function UPF0029  28.32 
 
 		 207 aa  59.7  0.00000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000670968  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1558  protein of unknown function UPF0029  31.87 
 
 		 203 aa  58.9  0.00000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.17892  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1241  hypothetical protein  33.65 
 
 		 197 aa  58.2  0.0000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2179  protein of unknown function UPF0029  36.94 
 
 		 204 aa  58.5  0.0000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.509167  normal  0.553697 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0035  hypothetical protein  33.64 
 
 		 198 aa  57.8  0.0000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000127558  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1554  protein of unknown function UPF0029  32.14 
 
 		 211 aa  58.2  0.0000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1261  hypothetical protein  40.26 
 
 		 124 aa  57  0.0000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1335  hypothetical protein  32.77 
 
 		 221 aa  55.5  0.000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000275512  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0638  hypothetical protein  39.36 
 
 		 194 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000134379 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0593  hypothetical protein  39.36 
 
 		 194 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.195431  normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl056  putative proline dipeptidase  29.73 
 
 		 232 aa  54.3  0.000002  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0023  hypothetical protein  30.91 
 
 		 198 aa  54.3  0.000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.132491  normal  0.0840592 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0633  hypothetical protein  39.36 
 
 		 194 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  unclonable  0.0000000000102941  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0361  hypothetical protein  33.91 
 
 		 210 aa  54.3  0.000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3734  hypothetical protein  32.71 
 
 		 212 aa  53.9  0.000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4991  hypothetical protein  32.71 
 
 		 211 aa  53.9  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4570  hypothetical protein  39.36 
 
 		 194 aa  53.9  0.000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000000582787  normal  0.0106541 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0682  hypothetical protein  37.23 
 
 		 193 aa  53.1  0.000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000348018  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5046  hypothetical protein  32.41 
 
 		 211 aa  52.8  0.000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5431  hypothetical protein  32.41 
 
 		 211 aa  52.8  0.000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB03580  expressed protein  41.82 
 
 		 309 aa  52  0.000009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.805406  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5363  conserved hypothetical protein TIGR00257  33.67 
 
 		 211 aa  52  0.000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5305  hypothetical protein  33.67 
 
 		 211 aa  52  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4876  hypothetical protein  33.67 
 
 		 211 aa  52  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4891  hypothetical protein  33.67 
 
 		 211 aa  52  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0030  hypothetical protein  30.91 
 
 		 198 aa  52  0.00001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.0000164661  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1191  hypothetical protein  32.63 
 
 		 211 aa  52  0.00001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.952586  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5287  conserved hypothetical protein TIGR00257  33.67 
 
 		 211 aa  52  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000948336 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0770  hypothetical protein  35.11 
 
 		 197 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.634391  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1009  hypothetical protein  35.44 
 
 		 191 aa  51.2  0.00002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0286427  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1121  hypothetical protein  35 
 
 		 192 aa  51.2  0.00002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.490437  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0899  protein of unknown function UPF0029  30.7 
 
 		 211 aa  51.2  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000000186376  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2223  protein of unknown function UPF0029  33.68 
 
 		 200 aa  50.8  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.238524  normal  0.0468847 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3242  protein of unknown function UPF0029  30.63 
 
 		 213 aa  51.2  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1375  hypothetical protein  30 
 
 		 197 aa  50.4  0.00003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.000270637  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0813  protein of unknown function UPF0029  28.42 
 
 		 206 aa  50.4  0.00003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0467204  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3045  protein of unknown function UPF0029  31.78 
 
 		 211 aa  50.4  0.00003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0019281  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0674  hypothetical protein  35.11 
 
 		 197 aa  50.1  0.00004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12020  conserved hypothetical protein TIGR00257  30.43 
 
 		 208 aa  50.1  0.00004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.226332  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0733  hypothetical protein  33 
 
 		 212 aa  49.3  0.00007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000337539  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1690  hypothetical protein  33.77 
 
 		 172 aa  48.9  0.00009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.296344  normal  0.209957 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2729  hypothetical protein  32.93 
 
 		 206 aa  48.9  0.00009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5318  conserved hypothetical protein TIGR00257  32.65 
 
 		 211 aa  48.9  0.00009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0405  hypothetical protein  30.85 
 
 		 208 aa  48.5  0.0001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0499  hypothetical protein  32.97 
 
 		 218 aa  48.1  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000766856  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1413  hypothetical protein  25.2 
 
 		 205 aa  48.5  0.0001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.533633  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0004  protein of unknown function UPF0029  30.1 
 
 		 210 aa  48.1  0.0001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.528127 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02100  hypothetical protein  35.11 
 
 		 196 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.482389 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0772  hypothetical protein  32.99 
 
 		 213 aa  47.4  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.540579  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0789  hypothetical protein  32.99 
 
 		 213 aa  47.4  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0502356  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1183  hypothetical protein  30.56 
 
 		 200 aa  47.4  0.0002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.895174  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03138  hypothetical protein  29.09 
 
 		 206 aa  47.8  0.0002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0335  hypothetical protein  31.91 
 
 		 214 aa  47  0.0003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2174  hypothetical protein  30.91 
 
 		 201 aa  47.4  0.0003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.279701  normal  0.249309 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3700  hypothetical protein  33.33 
 
 		 194 aa  47.4  0.0003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5641  hypothetical protein TIGR00257  32.65 
 
 		 211 aa  47.4  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.989891  hitchhiker  0.000000000000266179 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4048  hypothetical protein  42.62 
 
 		 209 aa  47.4  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.173399  decreased coverage  0.000882934 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0720  Xaa-Pro dipeptidase  32.29 
 
 		 194 aa  46.6  0.0004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1632  protein of unknown function UPF0029  30.53 
 
 		 201 aa  47  0.0004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0180  protein of unknown function UPF0029  40.32 
 
 		 216 aa  46.2  0.0005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.190284  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2192  hypothetical protein  30.25 
 
 		 198 aa  46.2  0.0006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1444  hypothetical protein  32.95 
 
 		 216 aa  46.2  0.0006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1849  protein of unknown function UPF0029  34.04 
 
 		 206 aa  46.2  0.0006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1310  hypothetical protein  33.68 
 
 		 205 aa  45.1  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00619746  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1211  protein of unknown function UPF0029  33.66 
 
 		 212 aa  45.4  0.001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0084  protein of unknown function UPF0029  37.7 
 
 		 212 aa  45.4  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12728  hypothetical protein  31.68 
 
 		 203 aa  45.1  0.001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0124  hypothetical protein  33.68 
 
 		 206 aa  44.3  0.002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000265032 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2757  hypothetical protein  32.23 
 
 		 213 aa  44.7  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2867  hypothetical protein  28.18 
 
 		 201 aa  44.7  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0449  hypothetical protein  32.05 
 
 		 194 aa  44.7  0.002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1527  hypothetical protein  32.05 
 
 		 194 aa  44.3  0.002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0478  hypothetical protein  32.05 
 
 		 194 aa  43.5  0.003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0812291  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0046  hypothetical protein  24.79 
 
 		 191 aa  43.9  0.003  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2511  hypothetical protein  30.53 
 
 		 203 aa  43.9  0.003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0248  hypothetical protein  41.27 
 
 		 196 aa  43.9  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.895952  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2891  hypothetical protein  26.36 
 
 		 205 aa  43.5  0.004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.373114  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2078  hypothetical protein  34.95 
 
 		 219 aa  42.7  0.006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17110  hypothetical protein  30.84 
 
 		 212 aa  42.7  0.006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.46381 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2225  protein of unknown function UPF0029  33.7 
 
 		 195 aa  42.4  0.008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1608  protein of unknown function UPF0029  34.15 
 
 		 201 aa  42.4  0.009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.172462 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>