30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_45681 on replicon NC_011675
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011675  PHATRDRAFT_45681  predicted protein  100 
 
 
591 aa  1232    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_37849  predicted protein  31.99 
 
 
469 aa  172  1e-41  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00619482  hitchhiker  0.00164206 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_50882  predicted protein  29.3 
 
 
437 aa  168  2.9999999999999998e-40  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.933008  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_10450  RNA methylase family UPF0020 protein (AFU_orthologue; AFUA_4G12140)  30.05 
 
 
499 aa  161  4e-38  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006680  CNK00740  hypothetical protein  26.79 
 
 
475 aa  139  1e-31  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.635907  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1526  putative RNA methylase  29.29 
 
 
350 aa  72.8  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1154  putative RNA methylase  31.11 
 
 
364 aa  70.9  0.00000000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0801  putative RNA methylase  31.25 
 
 
351 aa  70.1  0.0000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1149  putative RNA methylase  31.9 
 
 
350 aa  68.6  0.0000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0482589  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0700  putative RNA methylase  29.21 
 
 
374 aa  67.4  0.0000000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.46275  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0667  putative RNA methylase  28.93 
 
 
367 aa  67  0.0000000009  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.107618  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_46959  predicted protein  28.16 
 
 
460 aa  65.5  0.000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.897224  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0103  putative RNA methylase  37.96 
 
 
310 aa  64.3  0.000000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.802972  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0420  hypothetical protein  30.38 
 
 
317 aa  62.8  0.00000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0587292 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1210  putative RNA methylase  27.93 
 
 
322 aa  56.2  0.000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  hitchhiker  0.00394731 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1864  putative RNA methylase  32.17 
 
 
365 aa  55.8  0.000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.382861  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1059  putative RNA methylase  26.37 
 
 
317 aa  55.1  0.000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.0000310515  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0592  putative RNA methylase  34.26 
 
 
225 aa  55.1  0.000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1789  putative RNA methylase  29.52 
 
 
304 aa  54.7  0.000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2015  putative RNA methylase  27.7 
 
 
314 aa  52.4  0.00002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.128985  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0722  putative RNA methylase  26.77 
 
 
334 aa  53.1  0.00002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1330  N2-methylguanosine tRNA methyltransferase  27.13 
 
 
355 aa  52.4  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.315731  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1659  putative RNA methylase  32.43 
 
 
224 aa  52.8  0.00002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.69991  hitchhiker  0.00475931 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1249  putative RNA methylase  31.62 
 
 
343 aa  52  0.00003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1775  putative RNA methylase  28.1 
 
 
315 aa  50.4  0.00008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0132  putative RNA methylase  29.89 
 
 
371 aa  47.4  0.0008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0686  putative RNA methylase  27.33 
 
 
224 aa  46.2  0.002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.502689  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1623  putative RNA methylase  24.65 
 
 
344 aa  45.1  0.003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.236365  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0020  putative RNA methylase  27.33 
 
 
359 aa  44.3  0.006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0125  putative RNA methylase  26.27 
 
 
317 aa  43.9  0.007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>