28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_43759 on replicon NC_011670
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011670  PHATRDRAFT_43759  predicted protein  100 
 
 
462 aa  962    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_48135  predicted protein  26.32 
 
 
840 aa  62  0.00000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.525832  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_14985  hypothetical protein, contains no bromo domain  47.06 
 
 
1474 aa  62.4  0.00000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_88926  conserved hypothetical protein DNA-binding protein jumonji/RBP2/SMCY, contains JmjC domain  45.45 
 
 
844 aa  58.9  0.0000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.492923  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42822  predicted protein  35.06 
 
 
837 aa  58.2  0.0000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_43159  predicted protein  30.59 
 
 
2413 aa  55.1  0.000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.280738  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42820  predicted protein  46.67 
 
 
419 aa  54.3  0.000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.749474  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119675  TrxG-related PHD-finger protein  39.19 
 
 
705 aa  53.5  0.000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45954  predicted protein  40 
 
 
1041 aa  52.8  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.340544  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07300  PHD finger domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G16810)  46.15 
 
 
841 aa  52.4  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.202225  normal  0.238789 
 
 
-
 
NC_006692  CNG00240  conserved hypothetical protein  38 
 
 
940 aa  52.4  0.00002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0793418  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08211  PHD transcription factor (Rum1), putative (AFU_orthologue; AFUA_5G03430)  41.67 
 
 
1717 aa  51.6  0.00003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.362779  normal 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_19230  predicted protein  38.78 
 
 
1544 aa  51.6  0.00003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00281974 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_17878  predicted protein  38.78 
 
 
1544 aa  51.6  0.00003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0363694 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_92541  predicted protein  31.34 
 
 
824 aa  50.4  0.00006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.707438  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_37523  predicted protein  36.36 
 
 
1325 aa  50.4  0.00006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.706155  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_59773  conserved hypothetical protein  36.96 
 
 
651 aa  49.7  0.0001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44453  predicted protein  44.64 
 
 
589 aa  49.3  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07294  PHD and RING finger domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G16870)  41.18 
 
 
614 aa  48.5  0.0003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0466722 
 
 
-
 
NC_006686  CND05870  conserved hypothetical protein  32.79 
 
 
1858 aa  47.4  0.0005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_15230  predicted protein  27.91 
 
 
784 aa  47.4  0.0006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.456459  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF02300  Bromodomain and PHD finger-containing protein 3, putative  39.58 
 
 
1064 aa  45.4  0.002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.890789  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45987  predicted protein  40.54 
 
 
2344 aa  45.4  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43517  predicted protein  38.78 
 
 
1255 aa  45.1  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0220601  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06675  PHD finger domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G05250)  40.43 
 
 
1173 aa  44.7  0.003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0408152 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_29003  predicted protein  37.25 
 
 
831 aa  44.7  0.004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.596418  normal  0.417698 
 
 
-
 
NC_006692  CNG01970  nucleus protein, putative  40.38 
 
 
511 aa  44.7  0.004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI02340  conserved hypothetical protein  42.86 
 
 
518 aa  43.9  0.007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.232361  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>