More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_42467 on replicon NC_011669
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011669  PHATRDRAFT_42467  predicted protein  100 
 
 
679 aa  1425    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.486955  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2737  glycosyl transferase group 1  34.23 
 
 
416 aa  225  3e-57  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.829529  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2115  glycosyl transferase group 1  33.59 
 
 
379 aa  202  1.9999999999999998e-50  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0564866  normal  0.0238358 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2544  glycosyl transferase, group 1  33.25 
 
 
401 aa  197  8.000000000000001e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.434322  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0879  glycosyl transferase, group 1  32.49 
 
 
393 aa  189  1e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.418877  normal  0.357161 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1913  glycosyl transferase group 1  33.6 
 
 
378 aa  189  1e-46  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2157  glycosyl transferase, group 1  32.99 
 
 
385 aa  186  9e-46  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.750957  normal  0.801991 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2081  glycosyl transferase group 1  32.98 
 
 
381 aa  186  2.0000000000000003e-45  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.212135  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2155  glycosyl transferase, group 1  34.94 
 
 
390 aa  184  4.0000000000000006e-45  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.150304  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2161  glycosyl transferase group 1  32.23 
 
 
377 aa  178  3e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00492248 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1670  glycosyl transferase  31.22 
 
 
376 aa  174  5.999999999999999e-42  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0304  glycosyl transferase  31.12 
 
 
372 aa  169  1e-40  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0175476  unclonable  0.000000745959 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0368  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.57 
 
 
380 aa  166  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.31592  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4872  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.7 
 
 
380 aa  166  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4657  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.7 
 
 
380 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4513  glycosyl transferase family protein  30.03 
 
 
380 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2485  glycosyl transferase group 1  31.22 
 
 
387 aa  166  2.0000000000000002e-39  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5012  group 1 family glycosyl transferase  29.7 
 
 
380 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4898  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.37 
 
 
380 aa  164  5.0000000000000005e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4907  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.04 
 
 
380 aa  164  7e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.957632  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4495  glycosyl transferase family protein  29.04 
 
 
380 aa  162  2e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4881  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.37 
 
 
380 aa  161  3e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4589  glycosyl transferase group 1  30.82 
 
 
381 aa  160  7e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11160  glycosyl transferase group 1  30.79 
 
 
383 aa  159  1e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53380  putative glycosyl transferase  31.79 
 
 
406 aa  158  3e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0237616 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2305  glycosyltransferase  32.83 
 
 
393 aa  158  4e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2339  glycosyl transferase, group 1  35.62 
 
 
381 aa  157  6e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0818  glycosyl transferase group 1  31.52 
 
 
381 aa  157  7e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4916  glycosyl transferase group 1  32.42 
 
 
377 aa  157  9e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.559859 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21361  SqdX  31.45 
 
 
382 aa  156  1e-36  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4678  putative glycosyl transferase  31.84 
 
 
406 aa  156  2e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.364939  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2602  glycosyl transferase, group 1  26.81 
 
 
812 aa  155  2e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3140  glycosyl transferase group 1  31.04 
 
 
381 aa  155  2.9999999999999998e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10200  Glycosyl transferase, group 1  29.79 
 
 
403 aa  154  4e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1012  glycosyl transferase, group 1  31.04 
 
 
406 aa  154  5e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1265  SqdX  31.16 
 
 
382 aa  154  5e-36  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3802  glycosyl transferase, group 1  30.83 
 
 
394 aa  153  1e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.769025  normal  0.0224743 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0138  glycosyl transferase group 1  29.5 
 
 
405 aa  152  2e-35  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4643  glycosyl transferase group 1  31.7 
 
 
376 aa  152  2e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.0000017343  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0399  glycosyl transferase, group 1  31.7 
 
 
377 aa  151  3e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18561  SqdX  29.91 
 
 
377 aa  151  5e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.330873  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1174  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.78 
 
 
403 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17931  SqdX  30.33 
 
 
382 aa  149  2.0000000000000003e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.335649  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18561  SqdX  30.03 
 
 
373 aa  148  3e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.213199  n/a   
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_50356  glycosyl transferase, group 1  34.04 
 
 
507 aa  148  3e-34  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0051  SqdX  33.55 
 
 
381 aa  148  4.0000000000000006e-34  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1989  glycosyl transferase group 1  28.98 
 
 
820 aa  147  5e-34  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43238  predicted protein  32.87 
 
 
456 aa  147  5e-34  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.169779  normal  0.020707 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43286  predicted protein  32.87 
 
 
456 aa  147  5e-34  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.355252  normal  0.0628635 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0604  glycosyl transferase group 1  28.38 
 
 
819 aa  147  5e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0579  sulfolipid sulfoquinovosyldiacylglycerol biosynthesis protein  29.02 
 
 
377 aa  147  7.0000000000000006e-34  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.513517  normal  0.138904 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3612  glycosyl transferase group 1  30.13 
 
 
377 aa  147  7.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2502  glycosyl transferase group 1  30.13 
 
 
377 aa  147  8.000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.861736 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0697  glycosyl transferase group 1  29.07 
 
 
772 aa  146  1e-33  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2328  glycosyl transferase, group 1  28.61 
 
 
432 aa  146  1e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18751  SqdX  29.41 
 
 
377 aa  146  1e-33  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3604  glycosyl transferase group 1  31 
 
 
387 aa  146  2e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.592965  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5565  glycosyl transferase group 1  26.84 
 
 
810 aa  145  3e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.896864 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0978  glycosyl transferase, group 1  29.46 
 
 
441 aa  145  3e-33  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000121289 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0048  SqdX  32.9 
 
 
382 aa  144  4e-33  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1758  SqdX  29.41 
 
 
377 aa  144  6e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3607  glycosyl transferase group 1  33.12 
 
 
413 aa  142  1.9999999999999998e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0124021 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0885  glycosyl transferase, group 1  29.92 
 
 
406 aa  142  3e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0090  glycosyl transferase, group 1  31.67 
 
 
378 aa  141  3.9999999999999997e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.22562 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1334  glycosyl transferase group 1  29.91 
 
 
385 aa  141  3.9999999999999997e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00501  SqdX  31.61 
 
 
381 aa  141  3.9999999999999997e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02497  glycosyl transferase  31.91 
 
 
378 aa  141  4.999999999999999e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.45745  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1480  glycosyl transferase, group 1:PHP-like  30.05 
 
 
803 aa  140  7e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.117248 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0974  glycosyl transferase, group 1  28.24 
 
 
400 aa  140  7e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.277341 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3543  glycosyl transferase, group 1  29 
 
 
373 aa  139  1e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.219559 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1817  glycosyl transferase, group 1  32.47 
 
 
385 aa  139  2e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1142  glycosyl transferase group 1  31.79 
 
 
378 aa  137  5e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.696085  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1801  glycosyl transferase group 1  33.7 
 
 
408 aa  137  5e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.115818  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1425  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.08 
 
 
373 aa  137  7.000000000000001e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1405  glycosyl transferase group 1  30.23 
 
 
655 aa  136  9.999999999999999e-31  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.873771 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2734  glycosyl transferase, group 1  27.98 
 
 
403 aa  135  3e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0803  glycosyl transferase, group 1  29.5 
 
 
396 aa  134  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0688317 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2903  glycosyl transferase, group 1  28.64 
 
 
827 aa  134  3.9999999999999996e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0301322 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3886  glycosyl transferase group 1  33.21 
 
 
390 aa  134  5e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3774  glycosyl transferase group 1  33.21 
 
 
390 aa  134  5e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.872783  normal  0.105154 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0220  glycosyl transferase group 1  30.05 
 
 
373 aa  134  6e-30  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.881158  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2328  glycosyl transferase group 1  31.44 
 
 
871 aa  133  9e-30  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0778  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.5 
 
 
396 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2705  glycosyl transferase group 1  30.33 
 
 
803 aa  133  1.0000000000000001e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2502  glycosyl transferase, group 1  34.07 
 
 
387 aa  133  1.0000000000000001e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.417702 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0817  glycosyl transferase group 1  30.18 
 
 
396 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4411  glycosyl transferase group 1  29.2 
 
 
404 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.886505  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0731  glycosyl transferase group 1  30.41 
 
 
384 aa  132  3e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2540  glycosyl transferase group 1  30.34 
 
 
398 aa  131  4.0000000000000003e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.125364 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3283  glycosyl transferase group 1  35.12 
 
 
420 aa  130  6e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1898  glycosyl transferase group 1  29.94 
 
 
416 aa  130  1.0000000000000001e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3745  group 1 glycosyl transferase  27.09 
 
 
385 aa  130  1.0000000000000001e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2688  glycosyl transferase group 1  34.76 
 
 
387 aa  129  1.0000000000000001e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.504834  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04450  glycosyltransferase  30.17 
 
 
405 aa  127  7e-28  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1160  glycosyl transferase group 1  26.79 
 
 
385 aa  127  9e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000209348 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12420  glycosyltransferase  30.45 
 
 
381 aa  125  3e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0338746  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2869  glycosyl transferase, group 1  28.05 
 
 
816 aa  125  4e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.541026 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1907  glycosyl transferase, group 1  28.46 
 
 
426 aa  124  7e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.278952  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1298  glycosyl transferase, group 1  27.58 
 
 
374 aa  123  9.999999999999999e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1070  glycosyl transferase, group 1  27.97 
 
 
434 aa  123  9.999999999999999e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>