62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG1888 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002950  PG1888  hypothetical protein  100 
 
 		 204 aa  418  1e-116  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.660532 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1688  SirA family protein  36.84 
 
 		 204 aa  132  3e-30  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.733385  normal  0.789276 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2500  hypothetical protein  36.45 
 
 		 190 aa  120  9.999999999999999e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2206  hypothetical protein  36.45 
 
 		 190 aa  120  1.9999999999999998e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1487  SirA family protein  33.48 
 
 		 223 aa  119  1.9999999999999998e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0677  hypothetical protein  34.83 
 
 		 197 aa  119  1.9999999999999998e-26  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0124  SirA-like  34.83 
 
 		 193 aa  118  4.9999999999999996e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0144261  normal  0.614717 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0367  SirA family protein  32.52 
 
 		 199 aa  117  9.999999999999999e-26  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11340  predicted redox protein, regulator of disulfide bond formation  34.47 
 
 		 203 aa  115  3e-25  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.544302  normal  0.497017 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0303  redox protein, regulator of disulfide bond formation  31.71 
 
 		 199 aa  112  3e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000562968  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2521  hypothetical protein  32.11 
 
 		 195 aa  112  4.0000000000000004e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.104075  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2448  SirA family protein  32.84 
 
 		 196 aa  112  5e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000888888  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0248  SirA family protein  32.29 
 
 		 203 aa  109  2.0000000000000002e-23  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.322 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3077  SirA family protein  33.33 
 
 		 199 aa  108  6e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000237941 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3495  SirA family protein  29.7 
 
 		 195 aa  108  7.000000000000001e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.70288e-33 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1085  hypothetical protein  31.79 
 
 		 196 aa  108  7.000000000000001e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  5.60528e-18  hitchhiker  0.0000092747 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3433  SirA family protein  29.7 
 
 		 195 aa  106  2e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000787487  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3765  SirA family protein  29.21 
 
 		 193 aa  105  4e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000718423  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25450  predicted redox protein, regulator of disulfide bond formation  32.64 
 
 		 201 aa  102  4e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.337434  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4588  SirA family protein  28.57 
 
 		 197 aa  102  5e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.282378  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1887  SirA-like protein  30.2 
 
 		 195 aa  99.8  3e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1242  SirA family protein  31.96 
 
 		 196 aa  97.4  1e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2431  selenium metabolism protein YedF  30.69 
 
 		 189 aa  96.3  3e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00446585  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0251  SirA family protein  31.28 
 
 		 202 aa  94.4  1e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0630  selenium metabolism protein YedF  28.79 
 
 		 198 aa  90.5  2e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0025612  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3402  SirA family protein  30.35 
 
 		 200 aa  88.2  7e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0293629 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0807  selenium metabolism protein YedF  29.13 
 
 		 211 aa  87.4  1e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.45173 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1060  hypothetical protein  28.78 
 
 		 206 aa  84.3  0.000000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1708  hypothetical protein  25.13 
 
 		 204 aa  83.6  0.000000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0132248  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2159  SirA family protein  26.92 
 
 		 197 aa  81.3  0.000000000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000102186  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1959  hypothetical protein  28.86 
 
 		 208 aa  79  0.00000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.51951  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0830  hypothetical protein  31.19 
 
 		 114 aa  74.7  0.000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000290687 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2054  selenium metabolism protein YedF  29.35 
 
 		 196 aa  70.1  0.00000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1581  hypothetical protein  32.08 
 
 		 117 aa  69.3  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.38625  normal  0.052602 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1779  hypothetical protein  24.74 
 
 		 199 aa  69.3  0.00000000004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1894  SirA family protein  29.17 
 
 		 209 aa  69.3  0.00000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00825245  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1857  hypothetical protein  24.61 
 
 		 190 aa  68.9  0.00000000005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0573  SirA-like protein  30.7 
 
 		 119 aa  68.6  0.00000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0576  SirA-like protein  30.7 
 
 		 119 aa  68.6  0.00000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.676233  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0339  hypothetical protein  24.1 
 
 		 199 aa  68.6  0.00000000007  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.331374  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1497  hypothetical protein  24.21 
 
 		 190 aa  67.4  0.0000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1678  hypothetical protein  24.74 
 
 		 190 aa  67.4  0.0000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3421  hypothetical protein  33.94 
 
 		 140 aa  66.2  0.0000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00083332 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0368  hypothetical protein  26.09 
 
 		 214 aa  64.3  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.162867 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2893  SirA family protein  31.53 
 
 		 118 aa  64.3  0.000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.455878  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1780  hypothetical protein  25.51 
 
 		 200 aa  64.3  0.000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0463262  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0361  putative transcriptional regulator  25.5 
 
 		 192 aa  62.4  0.000000005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2136  translation initiation factor IF-3  23.59 
 
 		 200 aa  60.5  0.00000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1417  hypothetical protein  27.14 
 
 		 212 aa  58.5  0.00000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.126908  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1524  SirA family protein  38.33 
 
 		 189 aa  51.2  0.00001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1311  SirA family protein  35 
 
 		 200 aa  48.1  0.00009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0598  SirA family protein  31.43 
 
 		 75 aa  47.8  0.0001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1319  SirA family protein  35.09 
 
 		 70 aa  46.2  0.0003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.514232  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1439  SirA-like  39.06 
 
 		 72 aa  46.6  0.0003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000145745  normal  0.024487 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1451  SirA family protein  32.2 
 
 		 75 aa  46.2  0.0004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2894  SirA family protein  35.71 
 
 		 75 aa  44.3  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2705  SirA family protein  24.29 
 
 		 81 aa  43.9  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1210  SirA family protein  31.43 
 
 		 75 aa  42.4  0.005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0436  SirA-like  28.57 
 
 		 75 aa  42  0.006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2339  SirA family protein  32.2 
 
 		 75 aa  41.6  0.007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0889916  normal  0.318145 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3534  SirA family protein  36.21 
 
 		 76 aa  41.2  0.009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.724974  decreased coverage  0.000159335 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2642  SirA family protein  28.44 
 
 		 201 aa  41.2  0.01  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.140879  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>