37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG1430 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002950  PG1430  TPR domain-containing protein  100 
 
 
228 aa  460  1e-129  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.480041 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5634  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  37.62 
 
 
231 aa  127  1.0000000000000001e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00113498  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09778  hypothetical protein  39.07 
 
 
257 aa  125  7e-28  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.685186  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0213  TPR repeat-containing protein  33.95 
 
 
259 aa  120  3e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5454  Tetratricopeptide domain protein  33.17 
 
 
237 aa  117  9.999999999999999e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.525083 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0326  TPR repeat-containing protein  32.86 
 
 
262 aa  111  1.0000000000000001e-23  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0533  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.56 
 
 
223 aa  106  4e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000139229 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3815  Tetratricopeptide domain protein  34.3 
 
 
233 aa  105  5e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.165621  normal  0.472906 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0496  hypothetical protein  32.8 
 
 
208 aa  94.7  1e-18  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3719  TPR domain-containing protein  33.85 
 
 
213 aa  89  5e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.555314 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1798  Tetratricopeptide domain protein  32.59 
 
 
235 aa  74.3  0.000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1777  Tetratricopeptide domain protein  32.03 
 
 
228 aa  56.6  0.0000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1348  TPR repeat-containing protein  25 
 
 
221 aa  55.8  0.0000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0820  hypothetical protein  30.08 
 
 
1212 aa  47.8  0.0001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.826533 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1238  TPR repeat-containing protein  24.66 
 
 
377 aa  47  0.0002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2327  TPR repeat-containing protein  40.58 
 
 
1023 aa  47.4  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.930727  normal  0.708749 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2098  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.35 
 
 
566 aa  46.2  0.0004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000120088  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0963  hypothetical protein  30.08 
 
 
1550 aa  45.8  0.0005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.424465 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1768  TPR repeat-containing protein  32.35 
 
 
923 aa  45.8  0.0006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.706396 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0727  exsB protein  35.29 
 
 
1310 aa  45.1  0.0009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.202441  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2246  TPR repeat-containing protein  31.87 
 
 
1004 aa  44.7  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0678  extracellular ligand-binding receptor  40 
 
 
1073 aa  44.7  0.001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1003  TPR repeat-containing protein  30.67 
 
 
251 aa  45.1  0.001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1310  TPR repeat-containing protein  36.36 
 
 
391 aa  43.9  0.002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000392094  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1257  tetratricopeptide repeat family protein  36.36 
 
 
519 aa  44.3  0.002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.221403  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2232  TPR repeat-containing protein  28.36 
 
 
946 aa  43.5  0.002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0966  hypothetical protein  29.81 
 
 
2145 aa  42.4  0.005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.360119 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3903  tetratricopeptide TPR_2  29.7 
 
 
809 aa  42.4  0.005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2078  TPR domain-containing protein  27.17 
 
 
242 aa  42.4  0.006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1826  TPR repeat-containing protein  26.67 
 
 
289 aa  42.4  0.006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0280  TPR domain-containing protein  28.12 
 
 
1013 aa  42.4  0.006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.416311 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0410  hypothetical protein  29.13 
 
 
222 aa  42  0.007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000196847  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1312  TPR repeat-containing protein  37.88 
 
 
1069 aa  42.4  0.007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.530092  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2656  TPR repeat-containing protein  30.11 
 
 
568 aa  42  0.008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000162187  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0757  TPR repeat-containing protein  23.42 
 
 
264 aa  42  0.009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0531  putative lipoprotein  25.74 
 
 
236 aa  42  0.009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0340  hypothetical protein  28.03 
 
 
2413 aa  41.6  0.009  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.259192 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>