More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG0959 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002950  PG0959  ATP-binding Mrp/Nbp35 family protein  100 
 
 
372 aa  753    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.152007 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2226  protein of unknown function DUF59  54.27 
 
 
365 aa  386  1e-106  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.934574  normal  0.117815 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0926  Mrp/Nbp35 family ATP-binding protein  53.85 
 
 
367 aa  383  1e-105  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0267061 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00760  hypothetical protein  52.33 
 
 
376 aa  371  1e-101  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.161739  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4935  protein of unknown function DUF59  51.22 
 
 
368 aa  369  1e-101  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.716392  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1110  ATPase-like, ParA/MinD  51.35 
 
 
367 aa  368  1e-100  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.559665 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1327  chromosome partitioning ATPase  50.97 
 
 
376 aa  362  5.0000000000000005e-99  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1044  Mrp/Nbp35 family ATP-binding protein  51.92 
 
 
373 aa  360  2e-98  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0046  protein of unknown function DUF59  48.72 
 
 
368 aa  346  4e-94  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.261408 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2325  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  45.82 
 
 
367 aa  327  2.0000000000000001e-88  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0869  hypothetical protein  45.13 
 
 
366 aa  314  9.999999999999999e-85  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.671214 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1814  protein of unknown function DUF59  47.78 
 
 
363 aa  303  3.0000000000000004e-81  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0920101  normal  0.492126 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0399  ATP-binding Mrp/Nbp35 family protein  43.58 
 
 
395 aa  290  4e-77  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2014  hypothetical protein  45.25 
 
 
357 aa  282  8.000000000000001e-75  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.000000063714  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0420  protein of unknown function DUF59  46.89 
 
 
360 aa  281  1e-74  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0587708  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4070  protein of unknown function DUF59  43.93 
 
 
353 aa  281  1e-74  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4109  protein of unknown function DUF59  43.64 
 
 
353 aa  280  2e-74  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00117274  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1105  MRP protein-like  42.18 
 
 
361 aa  276  3e-73  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.914762 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2597  protein of unknown function DUF59  43.18 
 
 
356 aa  273  2.0000000000000002e-72  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0491781 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1588  protein of unknown function DUF59  42.15 
 
 
363 aa  271  1e-71  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3055  protein of unknown function DUF59  42.25 
 
 
353 aa  270  2.9999999999999997e-71  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.325814 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4583  hypothetical protein  43.22 
 
 
356 aa  266  5e-70  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0576  hypothetical protein  42.7 
 
 
363 aa  264  2e-69  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0440999  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5982  MRP protein-like protein  39.46 
 
 
374 aa  261  1e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.141343  normal  0.087256 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2622  ATPase-like ParA/MinD  43.84 
 
 
356 aa  260  2e-68  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.783345  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17011  MRP-like protein  40.34 
 
 
357 aa  258  8e-68  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.995649 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2755  hypothetical protein  43.14 
 
 
364 aa  258  1e-67  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.153981 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2587  protein of unknown function DUF59  41.24 
 
 
351 aa  258  1e-67  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.600696  normal  0.426631 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0691  hypothetical protein  43.84 
 
 
357 aa  258  1e-67  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0228073  normal  0.794986 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1575  ATPase-like, ParA/MinD  42.69 
 
 
358 aa  257  3e-67  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2109  hypothetical protein  43.34 
 
 
367 aa  256  4e-67  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0874248  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2017  protein of unknown function DUF59  46.52 
 
 
368 aa  256  4e-67  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.77544  normal  0.693477 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1760  hypothetical protein  42.05 
 
 
367 aa  255  8e-67  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.224371  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0931  putative iron sulfur binding protein  46.22 
 
 
363 aa  254  1.0000000000000001e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0923  mrp protein  40.86 
 
 
386 aa  254  1.0000000000000001e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2055  ATP-binding Mrp/Nbp35 family protein  43.87 
 
 
376 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0442  hypothetical protein  40.65 
 
 
384 aa  254  2.0000000000000002e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.44272  normal  0.0224463 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2528  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  42.61 
 
 
348 aa  254  2.0000000000000002e-66  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0638219  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2037  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  42.78 
 
 
358 aa  253  3e-66  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.0000910104  hitchhiker  0.00000144662 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0326  hypothetical protein  42.53 
 
 
359 aa  253  3e-66  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0057  mrp-related protein  41.78 
 
 
387 aa  253  5.000000000000001e-66  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0057  mrp-related protein  41.78 
 
 
394 aa  253  5.000000000000001e-66  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0740397  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0395  Mrp/NBP35 family protein  42.47 
 
 
354 aa  252  6e-66  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.616395  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2188  protein of unknown function DUF59  42.32 
 
 
363 aa  251  1e-65  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.321021 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1163  putative iron sulfur binding protein  44.06 
 
 
365 aa  251  1e-65  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0126108  normal  0.565689 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1831  protein of unknown function DUF59  43.82 
 
 
345 aa  250  2e-65  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.203374  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0402  MRP protein-like  40.51 
 
 
358 aa  251  2e-65  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.277305  normal  0.78996 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2457  hypothetical protein  43.72 
 
 
382 aa  251  2e-65  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.12568 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1165  hypothetical protein  41.95 
 
 
356 aa  250  3e-65  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000258705 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5082  MRP protein-like protein  40.11 
 
 
373 aa  250  3e-65  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1786  ATPase-like, ParA/MinD  42.73 
 
 
363 aa  250  3e-65  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00000257216  normal  0.0179532 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17681  hypothetical protein  39.77 
 
 
355 aa  250  3e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.400744  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2245  ATP-binding protein, Mrp/Nbp35 family protein  43.44 
 
 
371 aa  249  4e-65  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.615288  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3344  ATPase-like, ParA/MinD  42.35 
 
 
358 aa  249  5e-65  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.312419  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0560  protein of unknown function DUF59  41.19 
 
 
362 aa  249  6e-65  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1180  putative ATPase  42.82 
 
 
373 aa  249  6e-65  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3830  hypothetical protein  45.86 
 
 
363 aa  248  9e-65  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.358406  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0968  protein of unknown function DUF59  42.17 
 
 
371 aa  248  9e-65  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3476  hypothetical protein  44.69 
 
 
363 aa  248  1e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0863865  normal  0.308541 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4565  MRP protein-like protein  39.17 
 
 
378 aa  248  1e-64  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.550495 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0676  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  44.38 
 
 
362 aa  248  1e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3272  putative iron sulfur binding protein  43.06 
 
 
363 aa  248  1e-64  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2287  chromosome partitioning ATPase protein  41.16 
 
 
358 aa  248  1e-64  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000432977 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2661  Mrp protein  41.16 
 
 
358 aa  248  1e-64  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5025  Mrp protein  39.78 
 
 
375 aa  248  2e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.27935 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2800  protein of unknown function DUF59  44.69 
 
 
363 aa  247  2e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.183179  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1652  ATP-binding Mrp/Nbp35 family protein  48.09 
 
 
305 aa  247  2e-64  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.491623  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1978  ATP-binding Mrp/Nbp35 family protein  44.67 
 
 
371 aa  247  2e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.000194849  hitchhiker  0.00590431 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2767  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  43.87 
 
 
362 aa  247  2e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1898  MRP family ATP-binding protein  44.38 
 
 
354 aa  247  2e-64  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.121089  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4025  hypothetical protein  39.78 
 
 
379 aa  247  2e-64  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.859751  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1138  hypothetical protein  49.81 
 
 
368 aa  246  3e-64  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2621  hypothetical protein  44.57 
 
 
363 aa  246  4e-64  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.83768  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0549  protein of unknown function DUF59  41.24 
 
 
388 aa  246  6e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4146  ParA family protein  43.73 
 
 
364 aa  245  6.999999999999999e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0064  hypothetical protein  40.92 
 
 
389 aa  245  9e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.209294  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2189  cobyrinic acid ac-diamide synthase  40.44 
 
 
362 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00291769  normal  0.27131 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1045  hypothetical protein  41.52 
 
 
364 aa  244  9.999999999999999e-64  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.232996  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17881  hypothetical protein  38.64 
 
 
356 aa  245  9.999999999999999e-64  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.804319  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2379  MRP family ATP-binding protein  42.61 
 
 
362 aa  244  1.9999999999999999e-63  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.384277  hitchhiker  0.0044393 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1042  putative ATP-binding protein  44.78 
 
 
374 aa  244  1.9999999999999999e-63  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.261199  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1846  hypothetical protein  45.75 
 
 
363 aa  244  1.9999999999999999e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1557  hypothetical protein  42.17 
 
 
362 aa  244  1.9999999999999999e-63  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2357  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  47.67 
 
 
298 aa  243  3e-63  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1234  hypothetical protein  42.49 
 
 
370 aa  243  5e-63  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0423  ATPase-like, ParA/MinD  42.58 
 
 
376 aa  242  7e-63  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1066  nucleotide-binding protein-like protein  46.86 
 
 
364 aa  242  7e-63  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0514785 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7302  MRP protein-like protein  38.11 
 
 
374 aa  242  7.999999999999999e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.145804  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0822  hypothetical protein  44.29 
 
 
363 aa  241  1e-62  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0555  mrp protein  45.67 
 
 
382 aa  241  1e-62  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.414747  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2187  putative multidrug-resistance related protein  41.69 
 
 
370 aa  241  1e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0964076  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2492  protein of unknown function DUF59  42.86 
 
 
364 aa  241  2e-62  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0134384  normal  0.291391 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2392  putative ATPase  50.77 
 
 
369 aa  241  2e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0920  hypothetical protein  42.11 
 
 
362 aa  241  2e-62  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.536406 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1064  hypothetical protein  42.11 
 
 
362 aa  241  2e-62  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.626095  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2592  protein of unknown function DUF59  42.61 
 
 
363 aa  240  2.9999999999999997e-62  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.144704 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1673  MRP protein-like  38.15 
 
 
356 aa  240  2.9999999999999997e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  decreased coverage  0.0087484  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002982  Mrp protein  47.48 
 
 
358 aa  240  2.9999999999999997e-62  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.435734  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0179  GTP/ATP binding protein, putative  40 
 
 
340 aa  239  4e-62  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2652  ATP-binding Mrp/Nbp35 family protein  43.8 
 
 
371 aa  239  4e-62  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.240141 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>