More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG0347 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002950  PG0347  UDP-glucose 4-epimerase  100 
 
 		 342 aa  705    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0730081 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0923  UDP-glucose 4-epimerase  59.94 
 
 		 341 aa  425  1e-118  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000000616826  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1728  UDP-glucose 4-epimerase  58.11 
 
 		 338 aa  419  1e-116  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.87625  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2894  UDP-glucose 4-epimerase  58.16 
 
 		 339 aa  407  1.0000000000000001e-112  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.107811 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03925  UDP-glucose 4-epimerase  57.82 
 
 		 340 aa  401  1e-111  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.317311  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3613  UDP-glucose 4-epimerase  58.41 
 
 		 340 aa  398  9.999999999999999e-111  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.965696  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5839  UDP-glucose 4-epimerase  60.42 
 
 		 343 aa  386  1e-106  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1125  UDP-glucose 4-epimerase  54.22 
 
 		 337 aa  363  3e-99  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4007  UDP-glucose 4-epimerase  52.99 
 
 		 337 aa  359  4e-98  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.006628  normal  0.348015 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0367  UDP-glucose 4-epimerase  50.15 
 
 		 337 aa  348  8e-95  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0019063  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1410  UDP-glucose 4-epimerase  53.15 
 
 		 339 aa  348  8e-95  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.935662  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0182  UDP-glucose 4-epimerase  50.59 
 
 		 342 aa  348  1e-94  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1804  UDP-glucose 4-epimerase  50.45 
 
 		 337 aa  347  2e-94  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07350  UDP-galactose 4-epimerase  51.2 
 
 		 339 aa  345  5e-94  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.141517  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4008  UDP-glucose 4-epimerase  51.2 
 
 		 346 aa  345  6e-94  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000293012 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5636  UDP-glucose 4-epimerase  51.05 
 
 		 338 aa  342  5e-93  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5588  UDP-glucose 4-epimerase  51.2 
 
 		 338 aa  342  5.999999999999999e-93  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1672  UDP-glucose 4-epimerase  50 
 
 		 341 aa  342  5.999999999999999e-93  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1563  UDP-glucose 4-epimerase  51.5 
 
 		 337 aa  340  1e-92  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2591  UDP-galactose 4-epimerase  50 
 
 		 337 aa  341  1e-92  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.496154  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1793  UDP-glucose 4-epimerase  49.4 
 
 		 341 aa  340  2e-92  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0859  UDP-glucose 4-epimerase  51.49 
 
 		 340 aa  340  2e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5574  UDP-glucose 4-epimerase  50.3 
 
 		 338 aa  340  2.9999999999999998e-92  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.739221  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2501  UDP-glucose 4-epimerase  50.6 
 
 		 340 aa  339  4e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5244  UDP-glucose 4-epimerase  50.15 
 
 		 338 aa  338  5.9999999999999996e-92  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5388  UDP-glucose 4-epimerase  49.7 
 
 		 336 aa  338  7e-92  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3965  UDP-glucose 4-epimerase  50 
 
 		 339 aa  338  7e-92  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5568  UDP-glucose 4-epimerase  50.3 
 
 		 337 aa  338  8e-92  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5381  UDP-glucose 4-epimerase  49.4 
 
 		 338 aa  338  9e-92  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5437  UDP-glucose 4-epimerase  49.55 
 
 		 342 aa  337  9.999999999999999e-92  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0410  UDP-glucose 4-epimerase  51.19 
 
 		 340 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0889  UDP-glucose 4-epimerase  51.19 
 
 		 340 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.334492  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5304  UDP-glucose 4-epimerase  47.89 
 
 		 338 aa  337  1.9999999999999998e-91  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3986  UDP-galactose 4-epimerase  50.89 
 
 		 340 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.205233 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5700  UDP-glucose 4-epimerase  47.89 
 
 		 338 aa  337  1.9999999999999998e-91  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5373  UDP-glucose 4-epimerase  49.7 
 
 		 338 aa  337  1.9999999999999998e-91  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.259242  hitchhiker  0.00471599 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1914  UDP-galactose 4-epimerase  50.6 
 
 		 335 aa  337  1.9999999999999998e-91  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.810767  normal  0.343621 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000160  UDP-glucose 4-epimerase  49.1 
 
 		 338 aa  336  2.9999999999999997e-91  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0154193  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0346  UDP-glucose 4-epimerase  49.55 
 
 		 351 aa  336  2.9999999999999997e-91  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4061  UDP-glucose 4-epimerase  51.05 
 
 		 337 aa  335  5e-91  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.811719 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0116  UDP-glucose 4-epimerase  48.36 
 
 		 366 aa  335  7e-91  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0227  UDP-glucose 4-epimerase  49.13 
 
 		 351 aa  335  7e-91  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0501438  normal  0.38802 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1774  UDP-galactose 4-epimerase  49.55 
 
 		 336 aa  335  7.999999999999999e-91  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00238  UDP-glucose 4-epimerase  48.49 
 
 		 338 aa  335  7.999999999999999e-91  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5131  UDP-glucose 4-epimerase  47.59 
 
 		 338 aa  334  1e-90  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0518622  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5545  UDP-glucose 4-epimerase  47.59 
 
 		 338 aa  334  1e-90  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0306452 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5146  UDP-glucose 4-epimerase  47.59 
 
 		 338 aa  333  2e-90  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.370805  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0768  UDP-glucose 4-epimerase  49.7 
 
 		 340 aa  333  2e-90  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42345  predicted protein  49.4 
 
 		 352 aa  333  3e-90  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.252628  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0779  UDP-glucose 4-epimerase  49.4 
 
 		 340 aa  332  4e-90  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3477  UDP-glucose 4-epimerase  47.76 
 
 		 340 aa  332  7.000000000000001e-90  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.350304 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05793  UDP-glucose 4-epimerase  48.2 
 
 		 338 aa  332  8e-90  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5547  UDP-glucose 4-epimerase  51.04 
 
 		 336 aa  330  1e-89  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1485  UDP-glucose 4-epimerase  52.68 
 
 		 340 aa  330  1e-89  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3705  UDP-galactose 4-epimerase  49.11 
 
 		 340 aa  331  1e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3676  UDP-glucose 4-epimerase  48.96 
 
 		 339 aa  331  1e-89  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.193812 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5166  UDP-glucose 4-epimerase  48.36 
 
 		 336 aa  331  1e-89  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.500566 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0571  UDP-glucose 4-epimerase  49.4 
 
 		 337 aa  330  2e-89  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0714  UDP-glucose 4-epimerase  47.45 
 
 		 338 aa  330  2e-89  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.168591  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0789  UDP-galactose 4-epimerase  47.01 
 
 		 338 aa  330  2e-89  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0916  UDP-glucose 4-epimerase  48.81 
 
 		 340 aa  329  4e-89  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0816  UDP-glucose 4-epimerase  49.85 
 
 		 337 aa  328  8e-89  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2932  UDP-glucose 4-epimerase  49.1 
 
 		 337 aa  327  1.0000000000000001e-88  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000357428  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0107  UDP-galactose 4-epimerase  47.92 
 
 		 343 aa  328  1.0000000000000001e-88  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44740  UDP-glucose 4-epimerase  49.09 
 
 		 352 aa  328  1.0000000000000001e-88  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0737  UDP-glucose 4-epimerase  49.25 
 
 		 339 aa  328  1.0000000000000001e-88  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03331  UDP-glucose 4-epimerase  47.46 
 
 		 336 aa  328  1.0000000000000001e-88  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1446  UDP-glucose 4-epimerase  47.59 
 
 		 339 aa  327  2.0000000000000001e-88  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000042923  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3147  UDP-glucose 4-epimerase  52.08 
 
 		 340 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3124  UDP-glucose 4-epimerase  52.08 
 
 		 340 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3087  UDP-glucose 4-epimerase  52.08 
 
 		 340 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3310  UDP-glucose 4-epimerase  50.9 
 
 		 340 aa  326  3e-88  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.138688  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1500  UDP-glucose 4-epimerase  50.45 
 
 		 340 aa  326  3e-88  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2546  UDP-glucose 4-epimerase  51.79 
 
 		 340 aa  326  3e-88  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0486  UDP-glucose 4-epimerase  48.65 
 
 		 338 aa  326  3e-88  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00171475  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002660  UDP-glucose 4-epimerase  46.41 
 
 		 339 aa  326  4.0000000000000003e-88  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.342599  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3049  uridine diphosphate N-acetylgalactosamine 4-epimerase  49.4 
 
 		 335 aa  326  4.0000000000000003e-88  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.200753  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2195  UDP-glucose 4-epimerase  51.79 
 
 		 340 aa  326  5e-88  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.382513  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2271  UDP-glucose 4-epimerase  48.96 
 
 		 340 aa  325  5e-88  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.967584  normal  0.133855 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2068  UDP-glucose 4-epimerase  51.79 
 
 		 340 aa  326  5e-88  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.198671  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0712  UDP-glucose 4-epimerase  51.79 
 
 		 340 aa  326  5e-88  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0994374  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5595  UDP-galactose 4-epimerase  47.18 
 
 		 339 aa  325  8.000000000000001e-88  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.455346  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2007  UDP-galactose 4-epimerase  47.34 
 
 		 334 aa  324  1e-87  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.5887  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4083  UDP-glucose 4-epimerase  48.65 
 
 		 337 aa  325  1e-87  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46785  UDP-glucose 4-epimerase  47.63 
 
 		 358 aa  323  2e-87  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3246  UDP-glucose 4-epimerase  45.83 
 
 		 338 aa  323  2e-87  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0593  UDP-glucose 4-epimerase  47.46 
 
 		 339 aa  323  2e-87  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1537  UDP-glucose 4-epimerase  46.75 
 
 		 339 aa  323  3e-87  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2015  UDP-glucose 4-epimerase  47.16 
 
 		 339 aa  323  3e-87  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.714124 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1433  UDP-glucose 4-epimerase  47.89 
 
 		 337 aa  322  4e-87  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0122713  normal  0.432402 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1101  UDP-glucose 4-epimerase protein  47.62 
 
 		 341 aa  322  5e-87  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.139946  normal  0.0944899 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1384  UDP-glucose 4-epimerase  47.75 
 
 		 337 aa  322  6e-87  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3002  UDP-glucose 4-epimerase  49.55 
 
 		 337 aa  322  6e-87  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1044  UDP-galactose 4-epimerase  48.8 
 
 		 338 aa  322  7e-87  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0260  UDP-glucose 4-epimerase  47.09 
 
 		 353 aa  322  7e-87  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.115261  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4235  UDP-glucose 4-epimerase  47.02 
 
 		 341 aa  321  9.999999999999999e-87  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4345  UDP-glucose 4-epimerase  47.02 
 
 		 341 aa  321  9.999999999999999e-87  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.697217  normal  0.478622 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03064  UDP-glucose 4-epimerase  45.24 
 
 		 340 aa  321  9.999999999999999e-87  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0468  UDP-glucose 4-epimerase  48.05 
 
 		 338 aa  321  9.999999999999999e-87  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2783  UDP-galactose 4-epimerase  47.75 
 
 		 337 aa  320  1.9999999999999998e-86  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0966218  hitchhiker  0.000208277 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>