More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_5153 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_5153  TrkA-N domain protein  100 
 
 
355 aa  719    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000053583 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0368  TrkA-N domain protein  74.43 
 
 
356 aa  528  1e-149  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0361  TrkA-N domain protein  74.43 
 
 
356 aa  527  1e-149  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3004  TrkA-N domain-containing protein  68.18 
 
 
354 aa  513  1e-144  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3731  hypothetical protein  70.83 
 
 
338 aa  507  9.999999999999999e-143  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.00000000000159336  normal  0.309617 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2518  TrkA-N domain protein  67.33 
 
 
362 aa  488  1e-137  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0683  potassium channel protein  57.88 
 
 
341 aa  298  1e-79  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0618  VIC family potassium channel protein  44.1 
 
 
351 aa  244  1.9999999999999999e-63  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4160  TrkA domain-containing protein  38.89 
 
 
351 aa  243  3.9999999999999997e-63  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3794  TrkA-N domain protein  40 
 
 
350 aa  241  1e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.434274  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3877  TrkA-N domain protein  40 
 
 
350 aa  241  2e-62  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.705897 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1744  VIC family potassium channel protein  42.77 
 
 
352 aa  240  2.9999999999999997e-62  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0715  VIC family potassium channel protein  41.43 
 
 
351 aa  238  1e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.4714  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07711  VIC family potassium channel protein  41.43 
 
 
351 aa  238  1e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.584573  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07731  VIC family potassium channel protein  41.43 
 
 
351 aa  237  2e-61  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06531  putative potassium channel, VIC family protein  41.92 
 
 
359 aa  236  3e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0875  TrkA-N domain protein  38.26 
 
 
350 aa  236  5.0000000000000005e-61  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2971  TrkA domain-containing protein  36.89 
 
 
350 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14401  K+ transport system, NAD-binding component  43.17 
 
 
352 aa  233  4.0000000000000004e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000716154 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0063  TrkA family potassium uptake protein  39.42 
 
 
351 aa  232  6e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08671  VIC family potassium channel protein  40.19 
 
 
351 aa  229  6e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3283  TrkA-N  38.48 
 
 
332 aa  227  2e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.825743  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00100  potassium channel protein  34.25 
 
 
335 aa  218  1e-55  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.377928  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10941  hypothetical protein  39.58 
 
 
346 aa  218  2e-55  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00275534 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0471  TrkA domain-containing protein  36.31 
 
 
325 aa  217  2e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0403  VIC family potassium channel protein  39.58 
 
 
346 aa  217  2.9999999999999998e-55  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.133961  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1694  TrkA domain-containing protein  35.24 
 
 
332 aa  216  7e-55  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.249596  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2079  TrkA-N domain protein  37.3 
 
 
371 aa  214  1.9999999999999998e-54  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1528  TrkA domain-containing protein  36.31 
 
 
347 aa  211  1e-53  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.857437  normal  0.417483 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1751  TrkA domain-containing protein  34.64 
 
 
332 aa  211  1e-53  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2095  TrkA family potassium uptake protein  35.87 
 
 
346 aa  211  1e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.188907  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0800  TrkA-N domain protein  36.94 
 
 
331 aa  208  1e-52  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.501698  normal  0.632091 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3127  K+ transport systems, NAD-binding component  35.45 
 
 
337 aa  207  2e-52  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0453  TrkA-N domain protein  35.4 
 
 
346 aa  206  3e-52  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1045  TrkA domain-containing protein  36.78 
 
 
350 aa  204  1e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000596347  hitchhiker  0.00364441 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0451  TrkA domain-containing protein  34.73 
 
 
336 aa  203  4e-51  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.278158  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1024  TrkA domain-containing protein  33.43 
 
 
335 aa  199  7e-50  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.282206 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2743  TrkA domain-containing protein  34.15 
 
 
333 aa  199  7.999999999999999e-50  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2039  TrkA-N domain protein  35.35 
 
 
350 aa  199  9e-50  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1142  TrkA domain-containing protein  34.92 
 
 
341 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0922  TrkA domain-containing protein  33.33 
 
 
335 aa  198  2.0000000000000003e-49  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1654  TrkA domain-containing protein  33.33 
 
 
335 aa  195  8.000000000000001e-49  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.190782  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3915  TrkA domain-containing protein  32.82 
 
 
330 aa  195  8.000000000000001e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.557122  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3347  TrkA-N  35.35 
 
 
352 aa  194  2e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.220422  normal  0.349567 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5517  potassium uptake protein, TrkA family  32.53 
 
 
330 aa  193  4e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5434  potassium uptake protein, TrkA family  31.95 
 
 
337 aa  187  2e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5187  TrkA domain-containing protein  32.23 
 
 
330 aa  187  3e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5573  potassium uptake protein, TrkA family  31.93 
 
 
330 aa  184  3e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5092  potassium channel protein  31.93 
 
 
334 aa  182  8.000000000000001e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00108262  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5489  potassium uptake protein, TrkA family  31.93 
 
 
330 aa  182  9.000000000000001e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5075  potassium channel protein  31.93 
 
 
334 aa  181  1e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000793674  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1120  TrkA-N domain protein  32.32 
 
 
335 aa  180  2.9999999999999997e-44  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000439413  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0556  TrkA domain-containing protein  28.99 
 
 
346 aa  172  5.999999999999999e-42  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3909  TrkA domain-containing protein  30.42 
 
 
355 aa  172  6.999999999999999e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0877338 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0117  TrkA-N domain protein  30.87 
 
 
345 aa  172  1e-41  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0303  response regulator receiver domain-containing protein  31.4 
 
 
384 aa  171  2e-41  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1634  TrkA domain-containing protein  31.38 
 
 
339 aa  166  5e-40  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.853014  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0064  TrkA-N domain protein  29.69 
 
 
337 aa  163  4.0000000000000004e-39  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1744  TrkA-N domain protein  32.67 
 
 
368 aa  163  5.0000000000000005e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.844821 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2888  TrkA-N  30.18 
 
 
357 aa  162  1e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5545  TrkA-N domain protein  32.92 
 
 
341 aa  161  1e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.789205 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1346  TrkA domain-containing protein  28.57 
 
 
376 aa  154  2.9999999999999998e-36  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.538374  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3680  TrkA domain-containing protein  31.56 
 
 
509 aa  151  2e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0721  hypothetical protein  27.64 
 
 
335 aa  150  3e-35  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2212  TrkA domain-containing protein  31.75 
 
 
347 aa  150  3e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.217414  normal  0.271729 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1323  TrkA-N domain protein  28.91 
 
 
346 aa  146  5e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0771  hypothetical protein  28.57 
 
 
376 aa  145  1e-33  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.94547  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0972  hypothetical protein  26.82 
 
 
376 aa  139  6e-32  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.625398  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1520  TrkA domain-containing protein  27.04 
 
 
324 aa  136  6.0000000000000005e-31  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.639077  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2680  TrkA domain-containing protein  28.91 
 
 
397 aa  135  9e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000721375  normal  0.421945 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2566  TrkA-N  32.4 
 
 
366 aa  135  9.999999999999999e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.353731  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1601  hypothetical protein  26.88 
 
 
378 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0577  TrkA-N domain protein  31.82 
 
 
395 aa  126  6e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1030  conserved hypothetical protein (TrkA domain protein)  23.12 
 
 
375 aa  114  2.0000000000000002e-24  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.583921  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1529  TrkA-N domain protein  32.04 
 
 
395 aa  114  2.0000000000000002e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.479554  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2999  TrkA-N domain protein  29.66 
 
 
388 aa  112  1.0000000000000001e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1256  TrkA-N domain protein  30.26 
 
 
350 aa  110  4.0000000000000004e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.430368  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2168  TrkA-N domain protein  28.99 
 
 
531 aa  109  7.000000000000001e-23  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2970  TrkA-N domain protein  32.68 
 
 
393 aa  109  8.000000000000001e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.489017  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1743  TrkA-N domain protein  29.61 
 
 
256 aa  107  4e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.589845 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5245  potassium channel protein, C-terminus  34.07 
 
 
182 aa  105  1e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.835427  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2663  sodium/hydrogen exchanger  31.64 
 
 
668 aa  101  2e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4403  TrkA domain-containing protein  29.81 
 
 
341 aa  100  6e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.602366  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2358  TrkA domain-containing protein  28.73 
 
 
564 aa  99.8  6e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1890  voltage-gated potassium channel  28.02 
 
 
402 aa  99.4  8e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0139159 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1737  voltage-gated potassium channel  28.02 
 
 
402 aa  99.4  8e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000607493  normal  0.0325074 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01224  voltage-gated potassium channel  28.02 
 
 
417 aa  99  1e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.308891  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2398  TrkA-N domain protein  28.02 
 
 
417 aa  99  1e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00329227  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2377  voltage-gated potassium channel  28.02 
 
 
417 aa  99  1e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.408742  hitchhiker  0.0000021243 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1419  voltage-gated potassium channel  28.02 
 
 
417 aa  99  1e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0226544  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1398  voltage-gated potassium channel  28.02 
 
 
417 aa  99  1e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.488594  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01234  hypothetical protein  28.02 
 
 
417 aa  99  1e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.302174  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1359  voltage-gated potassium channel  28.02 
 
 
417 aa  99  1e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000079785  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3499  TrkA-N domain protein  26.59 
 
 
356 aa  97.8  2e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0133106  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06820  K+ transport system, NAD-binding component  28.14 
 
 
370 aa  97.8  3e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.074637  normal  0.0591627 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3113  potassium channel protein  29.97 
 
 
347 aa  97.8  3e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.144823  normal  0.715084 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1590  TrkA-N domain protein  30.23 
 
 
252 aa  97.4  3e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5641  TrkA domain-containing protein  29.75 
 
 
364 aa  95.9  1e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.289182 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1162  TrkA-like protein  29.41 
 
 
386 aa  95.5  1e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.30388 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3710  TrkA-N  29.75 
 
 
364 aa  95.9  1e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.360814  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>