56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_4650 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_4650  YcfA family protein  100 
 
 		 75 aa  151  2.9999999999999998e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000113321 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1350  YcfA family protein  85.33 
 
 		 75 aa  136  1e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0870  hypothetical protein  74.67 
 
 		 75 aa  122  1e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  unclonable  0.0000000000000055222  normal  0.0369438 
 
 
 
NC_011726  PCC8801_0175  YcfA family protein  45.33 
 
 		 73 aa  70.5  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0170  YcfA family protein  45.33 
 
 		 73 aa  70.5  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.58816  normal  0.310451 
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4469  YcfA family protein  46.67 
 
 		 76 aa  69.3  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013167  Cyan8802_4632  YcfA family protein  46.67 
 
 		 76 aa  69.3  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2005  YcfA family protein  45.21 
 
 		 74 aa  66.6  0.0000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0386325  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3185  YcfA family protein  49.32 
 
 		 73 aa  65.9  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.232391  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0152  hypothetical protein  44.44 
 
 		 81 aa  63.9  0.0000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2943  YcfA family protein  42.03 
 
 		 74 aa  62.8  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3153  YcfA family protein  42.03 
 
 		 74 aa  62.8  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.028613  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1494  hypothetical protein  44.44 
 
 		 76 aa  63.5  0.000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0656607  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0377  YcfA-like  41.33 
 
 		 73 aa  61.6  0.000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0773151 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1230  YcfA family protein  45.07 
 
 		 73 aa  61.2  0.000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0669  YcfA-like  42.86 
 
 		 75 aa  60.8  0.000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0763403 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2354  hypothetical protein  46.48 
 
 		 74 aa  60.8  0.000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.104234  normal  0.0102619 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5956  YcfA family protein  42.25 
 
 		 74 aa  60.5  0.000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.246481 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1240  YcfA family protein  38.67 
 
 		 74 aa  60.1  0.00000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4379  YcfA family protein  39.39 
 
 		 74 aa  58.9  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.000000396987  unclonable  0.0000000014534 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2779  YcfA-like  42.67 
 
 		 76 aa  58.9  0.00000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2364  hypothetical protein  46.48 
 
 		 74 aa  57.8  0.00000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.404097  normal  0.0567112 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1010  hypothetical protein  35.62 
 
 		 74 aa  57.8  0.00000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000868639  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2121  hypothetical protein  38.67 
 
 		 80 aa  55.5  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0116167  normal  0.982172 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1246  YcfA family protein  39.44 
 
 		 75 aa  54.7  0.0000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0250  YcfA-like  43.48 
 
 		 76 aa  54.7  0.0000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2276  YcfA family protein  41.94 
 
 		 79 aa  54.3  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0979587  hitchhiker  0.00000437635 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2213  YcfA family protein  41.94 
 
 		 79 aa  54.3  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0298  YcfA-like  39.47 
 
 		 77 aa  50.4  0.000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.09568  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2715  YcfA-like  39.13 
 
 		 74 aa  50.4  0.000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.307819  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4579  YcfA-like  42.67 
 
 		 78 aa  50.1  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3192  YcfA family protein  38.46 
 
 		 80 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0334864  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0355  hypothetical protein  36.84 
 
 		 80 aa  49.3  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1100  YcfA family protein  35.62 
 
 		 73 aa  48.1  0.00004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.417133 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1137  YcfA family protein  40.32 
 
 		 80 aa  48.1  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0318024  normal  0.63493 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0399  YcfA-like  34.78 
 
 		 74 aa  47.8  0.00005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.463825  normal  0.203895 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1951  YcfA family protein  37.33 
 
 		 74 aa  47.8  0.00005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.508484 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1936  YcfA family protein  36 
 
 		 74 aa  46.2  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.064189  normal  0.797457 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0711  YcfA-like  37.33 
 
 		 77 aa  46.2  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.032978 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2669  YcfA family protein  38.67 
 
 		 74 aa  45.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.16159 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0794  hypothetical protein  30.77 
 
 		 82 aa  46.2  0.0002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.331284  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1098  hypothetical protein  38.33 
 
 		 61 aa  45.8  0.0002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.459799  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0566  YcfA-like  40.32 
 
 		 84 aa  45.4  0.0003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0211  YcfA family protein  35.21 
 
 		 70 aa  44.7  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0555  YcfA family protein  31.58 
 
 		 80 aa  44.7  0.0005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1233  hypothetical protein  34.25 
 
 		 80 aa  44.3  0.0006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0780039 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2666  YcfA family protein  41.94 
 
 		 62 aa  43.9  0.0008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.0000153756  normal  0.80145 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1471  YcfA family protein  34.18 
 
 		 76 aa  43.1  0.001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0621  YcfA-like protein  36.11 
 
 		 76 aa  42.4  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3514  YcfA family protein  29.87 
 
 		 76 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2603  YcfA family protein  29.87 
 
 		 76 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006366  plpl0035  hypothetical protein  34.38 
 
 		 65 aa  40.8  0.007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  0.151222  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3622  YcfA family protein  37.1 
 
 		 63 aa  40.8  0.007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2486  YcfA family protein  37.1 
 
 		 63 aa  40.8  0.007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2649  YcfA-like  39.44 
 
 		 81 aa  40.4  0.008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2116  hypothetical protein  36 
 
 		 95 aa  40.4  0.008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>