37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_2084 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_2084  hypothetical protein  100 
 
 		 506 aa  1023    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000330543 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5274  hypothetical protein  35.34 
 
 		 519 aa  304  2.0000000000000002e-81  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0737  hypothetical protein  35.92 
 
 		 509 aa  268  2e-70  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.013183 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0391  hypothetical protein  37.95 
 
 		 571 aa  112  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000199178 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4944  AAA ATPase  35.09 
 
 		 540 aa  68.2  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.051172  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4238  ABC transporter  28.47 
 
 		 588 aa  63.9  0.000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0855  SMC domain-containing protein  34.26 
 
 		 556 aa  61.6  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0223965  normal  0.062418 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2959  hypothetical protein  32.63 
 
 		 533 aa  58.5  0.0000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1584  putative EA59 gene protein, phage lambda  31.19 
 
 		 540 aa  58.2  0.0000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0818233  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3598  AAA ATPase  24.78 
 
 		 530 aa  57  0.0000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.234034  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1004  hypothetical protein  30.7 
 
 		 567 aa  54.3  0.000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0319616 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2727  ABC transporter  34.48 
 
 		 601 aa  52.4  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2704  hypothetical protein  26.09 
 
 		 581 aa  50.8  0.00005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00140481  normal  0.0421451 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2599  hypothetical protein  29.75 
 
 		 619 aa  49.7  0.0001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00474195  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1735  AAA ATPase  31.82 
 
 		 484 aa  48.9  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.331613 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1984  hypothetical protein  22.55 
 
 		 566 aa  49.3  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.370866  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3008  hypothetical protein  21.94 
 
 		 582 aa  48.5  0.0003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.568683  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0524  hypothetical protein  26.89 
 
 		 251 aa  48.1  0.0003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1964  hypothetical protein  27.81 
 
 		 203 aa  47  0.0007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1709  SMC domain protein  27.27 
 
 		 584 aa  47  0.0008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  decreased coverage  0.000133048  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2489  SMC domain-containing protein  28.28 
 
 		 452 aa  46.6  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000889729  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2495  hypothetical protein  31.11 
 
 		 630 aa  46.6  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0608  hypothetical protein  29.66 
 
 		 1404 aa  46.6  0.001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2504  hypothetical protein  27.87 
 
 		 176 aa  45.8  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0211  ATPase  31.51 
 
 		 586 aa  45.8  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0158049  hitchhiker  0.00000676149 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2683  hypothetical protein  25.69 
 
 		 478 aa  45.8  0.002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.497582  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0733  hypothetical protein  25.44 
 
 		 461 aa  45.4  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.987867  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0378  SMC domain protein  28.46 
 
 		 430 aa  44.7  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3357  SMC domain-containing protein  25 
 
 		 437 aa  44.7  0.004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.123972  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0023  AAA ATPase  24.81 
 
 		 736 aa  44.3  0.005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2264  hypothetical protein  22.65 
 
 		 457 aa  44.3  0.005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.402442  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29510  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  25 
 
 		 250 aa  44.3  0.006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0201  hypothetical protein  28.68 
 
 		 442 aa  43.9  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0853474 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3338  ABC transporter related  38.37 
 
 		 347 aa  43.5  0.008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5113  hypothetical protein  24.44 
 
 		 422 aa  43.5  0.009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0493  hypothetical protein  30.56 
 
 		 532 aa  43.5  0.009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.068743  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1567  AAA ATPase  23.91 
 
 		 556 aa  43.5  0.01  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>